Springer Science and Business Media LLC
2042-5783
Cơ quản chủ quản: N/A
Lĩnh vực:
Các bài báo tiêu biểu
Beginner’s guide to comparative bacterial genome analysis using next-generation sequence data
Tập 3 Số 1 - 2013
Growth comparison of several Escherichia coli strains exposed to various concentrations of lactoferrin using linear spline regressionAbstract
Background
We wanted to compare growth differences between 13 Escherichia coli strains exposed to various concentrations of the growth inhibitor lactoferrin in two different types of broth (Syncase and Luria-Bertani (LB)). To carry this out, we present a simple... ... hiện toàn bộ
- 2012
Metagenomics - Hướng dẫn từ việc lấy mẫu đến phân tích dữ liệu Dịch bởi AI
Tập 2 - Trang 1-12 - 2012
Metagenomics áp dụng một loạt công nghệ gen và công cụ tin sinh học để truy cập trực tiếp vào nội dung di truyền của toàn bộ cộng đồng sinh vật. Lĩnh vực metagenomics đã đóng vai trò quan trọng trong việc thúc đẩy tiến bộ đáng kể trong sinh thái vi sinh vật, tiến hóa và sự đa dạng trong 5 đến 10 năm qua, và hiện nay nhiều phòng thí nghiệm nghiên cứu đang tích cực tham gia vào lĩnh vực này. Sự gia ...... hiện toàn bộ
#metagenomics #sinh thái vi sinh vật #đa dạng sinh học #công nghệ giải trình tự #phân tích thống kê
The Regulatory Network of Pseudomonas aeruginosa
Tập 1 - Trang 1-11 - 2011
Pseudomonas aeruginosa is an important bacterial model due to its metabolic and pathogenic abilities, which allow it to interact and colonize a wide range of hosts, including plants and animals. In this work we compile and analyze the structure and organization of an experimentally supported regulatory network in this bacterium. The regulatory network consists of 690 genes and 1020 regulatory inte...... hiện toàn bộ
Natural genetic engineering: intelligence & design in evolution?
Tập 1 - Trang 1-4 - 2011
There are many things that I like about James Shapiro's new book "Evolution: A View from the 21st Century" (FT Press Science, 2011). He begins the book by saying that it is the creation of novelty, and not selection, that is important in the history of life. In the presence of heritable traits that vary, selection results in the evolution of a population towards an optimal composition of those tra...... hiện toàn bộ
PerPlot & PerScan: tools for analysis of DNA curvature-related periodicity in genomic nucleotide sequences
Tập 1 - Trang 1-11 - 2011
Periodic spacing of short adenine or thymine runs phased with DNA helical period of ~10.5 bp is associated with intrinsic DNA curvature and deformability, which play important roles in DNA-protein interactions and in the organization of chromosomes in both eukaryotes and prokaryotes. Local differences in DNA sequence periodicity have been linked to differences in gene expression in some organisms....... hiện toàn bộ
Where the bugs are: analyzing distributions of bacterial phyla by descriptor keyword search in the nucleotide database
Tập 1 - Trang 1-8 - 2011
The associations between bacteria and environment underlie their preferential interactions with given physical or chemical conditions. Microbial ecology aims at extracting conserved patterns of occurrence of bacterial taxa in relation to defined habitats and contexts. In the present report the NCBI nucleotide sequence database is used as dataset to extract information relative to the distribution ...... hiện toàn bộ
Use of the University of Minnesota Biocatalysis/Biodegradation Database for study of microbial degradation
Tập 2 - Trang 1-10 - 2012
Microorganisms are ubiquitous on earth and have diverse metabolic transformative capabilities important for environmental biodegradation of chemicals that helps maintain ecosystem and human health. Microbial biodegradative metabolism is the main focus of the University of Minnesota Biocatalysis/Biodegradation Database (UM-BBD). UM-BBD data has also been used to develop a computational metabolic pa...... hiện toàn bộ