Journal of Microscopy
SCIE-ISI SCOPUS (1969-2023)
0022-2720
1365-2818
Anh Quốc
Cơ quản chủ quản: Wiley-Blackwell Publishing Ltd , WILEY
Lĩnh vực:
HistologyPathology and Forensic Medicine
Các bài báo tiêu biểu
Một chuyến tham quan có hướng dẫn về phân tích đồng địa điểm trong vi kính ánh sáng Dịch bởi AI Tóm tắt Chúng ta thường chấp nhận rằng việc phân chia chức năng của tế bào eukaryotic được phản ánh qua sự xuất hiện khác nhau của các protein trong các bào quan của chúng. Vị trí và chức năng sinh lý của một protein có mối quan hệ chặt chẽ; thông tin địa phương về một protein do đó là rất quan trọng để hiểu vai trò của nó trong các quá trình sinh học. Việc hình dung các protein cư trú trên các cấu trúc nội bào bằng kính hiển vi huỳnh quang đã trở thành một phương pháp thường quy trong sinh học tế bào và ngày càng được sử dụng để đánh giá sự đồng địa điểm của chúng với các dấu ấn đã được đặc trưng rõ ràng. Tuy nhiên, các phương pháp phân tích hình ảnh cho các nghiên cứu đồng địa điểm là một lĩnh vực tranh cãi và bí ẩn. Do đó, chúng tôi đã tiến hành xem xét các phương pháp phân tích đồng địa điểm hiện đang được sử dụng, giới thiệu các khái niệm quang học cơ bản quan trọng cho việc thu thập hình ảnh và phân tích sau đó. Chúng tôi cung cấp một tóm tắt các mẹo thực hành cho việc thu thập và xử lý hình ảnh mà nên diễn ra trước khi thực hiện phân tích đồng địa điểm đúng. Hơn nữa, chúng tôi thảo luận về việc áp dụng và khả năng thực hiện của các công cụ đồng địa điểm cho các tình huống đồng địa điểm sinh học khác nhau và thảo luận về những điểm mạnh và điểm yếu tương ứng của chúng. Chúng tôi đã tạo ra một bộ công cụ mới cho phân tích đồng địa điểm dưới tế bào trong ImageJ, được gọi là JACoP, tích hợp các phương pháp thống kê toàn cầu hiện tại và một phương pháp dựa trên đối tượng mới.
Tập 224 Số 3 - Trang 213-232 - 2006
#phân tích đồng địa điểm #tế bào eukaryotic #kính hiển vi huỳnh quang #phương pháp thống kê #JACoP
Vượt qua giới hạn độ phân giải bên qua một yếu tố gấp đôi bằng cách sử dụng kính hiển vi chiếu sáng cấu trúc Dịch bởi AI Độ phân giải bên đạt được mức cao hơn gấp đôi so với giới hạn nhiễu xạ cổ điển bằng cách sử dụng chiếu sáng cấu trúc trong kính hiển vi huỳnh quang trường rộng. Mẫu vật được chiếu sáng bằng một loạt các mẫu ánh sáng kích thích, gây ra thông tin độ phân giải cao không thể tiếp cận trong điều kiện bình thường được mã hóa vào hình ảnh quan sát được. Các hình ảnh ghi lại được xử lý tuyến tính để trích xuất thông tin mới và tạo ra một hình ảnh tái cấu trúc với độ phân giải gấp đôi so với bình thường. Khác với kính hiển vi quang sai, cải tiến độ phân giải này không cần phải loại bỏ bất kỳ ánh sáng phát xạ nào. Phương pháp này tạo ra những hình ảnh có độ rõ nét tăng đáng kể so với cả kính hiển vi truyền thống và kính hiển vi quang sai.
Tập 198 Số 2 - Trang 82-87 - 2000
#độ phân giải bên #kính hiển vi huỳnh quang #chiếu sáng cấu trúc #thông tin độ phân giải cao #hình ảnh tái cấu trúc
Ước lượng không thiên lệch số lượng và kích thước của các hạt tùy ý sử dụng disector Dịch bởi AI TÓM TẮT Một quy tắc đếm ba chiều và hệ thống kiểm tra tích phân của nó, disector, nhằm thu được ước lượng không thiên lệch số lượng các hạt tùy ý trong một mẫu vật đã được giới thiệu. Được sử dụng kết hợp với các phương pháp hình thái học cổ điển và gần đây đã được phát triển, các ước lượng không thiên lệch về kích thước trung bình của các hạt khác nhau và phương sai thể tích của hạt có thể thu được trên các tập hợp hai mặt cắt song song với một khoảng cách đã biết. Nguyên tắc tương tự cho phép ước lượng không thiên lệch phân bố thể tích của các hạt riêng lẻ trong các tập hợp các mặt cắt tuần tự.
Tập 134 Số 2 - Trang 127-136 - 1984
Một phương pháp mới để đánh giá độ dày độc lập với mô hình trong hình ảnh ba chiều Dịch bởi AI Các tham số cấu trúc ba chiều (3‐D) được suy diễn từ các phép đo có chiều thấp hơn bằng cách sử dụng các phương pháp hình học gián tiếp có thể bị thiên lệch mạnh nếu các đối tượng được đo có độ sai lệch so với mô hình cấu trúc đã giả định. Với sự xuất hiện của các kỹ thuật đo lường vi mô 3‐D, giờ đây có thể thu được một hình ảnh đầy đủ về các cấu trúc không gian phức tạp. Do đó, các phương pháp 3‐D mới gần đây đã được phát triển để ước lượng các tham số hình học như thể tích, diện tích bề mặt và kết nối bằng cách xử lý trực tiếp các hình ảnh 3‐D. Độ dày cấu trúc là một tham số hình học quan trọng thường chỉ được định nghĩa cho các mô hình cấu trúc cụ thể. Trong bài báo này, chúng tôi đề xuất một định nghĩa độ dày tổng quát cho các cấu trúc tùy ý cho phép chúng tôi tính toán độ dày trung bình của cấu trúc và phân bố độ dày của các đối tượng 3‐D một cách trực tiếp và không phụ thuộc vào mô hình cấu trúc đã giả định. Thêm vào đó, một cách triển khai hiệu quả cho việc sử dụng thực tiễn của phương pháp này được mô tả bằng cách sử dụng biến đổi khoảng cách. Phương pháp mới này được áp dụng cho các cấu trúc xương bọt được đo bằng hệ thống chụp cắt lớp vi tính 3‐D.
Tập 185 Số 1 - Trang 67-75 - 1997
Stereology of arbitrary particles* Dịch bởi AI TÓM TẮT Bài báo này đề cập đến các đối tượng riêng lẻ, có thể đếm được, thường được gọi là hạt, trong không gian ba chiều. Nội dung của nó là ước lượng hình học không thiên lệch của số lượng, chiều cao, diện tích và thể tích của các hạt này mà không đưa ra bất kỳ giả định nào về hình dạng của chúng . Tất cả các ước lượng viên được mô tả, một số lần đầu tiên, một số dưới dạng cải tiến, một số dưới nhiều phiên bản khác nhau, và tất cả đều dựa trên yêu cầu tuyệt đối là có thể xác định được những gì đang được định lượng trên các mặt cắt. Về số lượng mặt cắt tối thiểu cho phân tích, các ước lượng viên có thể được phân loại như sau: Trên một mặt cắt duy nhất, có thể ước lượng v̄V , thể tích trung bình của các hạt trong phân bố có trọng số thể tích hoặc ‘sàng lọc’. Trên hai mặt cắt song song, cách nhau một khoảng cách đã biết, tồn tại các ước lượng về số lượng hạt và tất cả các kích thước trung bình (chiều cao, diện tích và thể tích) trong phân bố số lượng thông thường, cũng như SDN (v) Trên một chồng các mặt cắt song song, ít nhất cao bằng hạt lớn nhất và cách nhau bởi những khoảng cách đã biết, có thể thu được mười hai kích thước trung bình và mười hai phân bố các kích thước riêng lẻ: tất cả các kết hợp của ba kích thước: chiều cao, diện tích và thể tích trong bốn loại phân bố khác nhau: số lượng, chiều cao, diện tích và thể tích. Để đáp ứng các yêu cầu lấy mẫu của hai nguyên tắc ước lượng trên, gần đây đã được chứng minh rằng bằng cách kết hợp chúng, người ta có thể ước lượng kích thước trung bình và số lượng của các hạt tùy ý trong một chồng các mặt cắt với khoảng cách không đổi nhưng không biết.
Tập 143 Số 1 - Trang 3-45 - 1986
Hiệu quả của việc lấy mẫu hệ thống trong stereology - xem xét lại Dịch bởi AI Tóm tắt Trong bài báo này, chúng tôi tóm tắt và phát triển thêm nghiên cứu gần đây về việc ước lượng phương sai của các ước lượng stereolog học dựa trên việc lấy mẫu hệ thống. Cụ thể, chúng tôi nhấn mạnh rằng quy trình ước lượng liên quan phụ thuộc vào mật độ mẫu. Tính hợp lệ của việc ước lượng phương sai được kiểm tra trong một tập hợp các bộ dữ liệu, thu được thông qua việc lấy mẫu hệ thống. Những khuyến nghị thực tiễn cũng được cung cấp trong một phần riêng.
Tập 193 Số 3 - Trang 199-211 - 1999
Ghi chú về việc ước lượng độ dày số học của các hình dạng tùy ý: hiệu ứng biên Dịch bởi AI TÓM TẮT Đã mô tả một họ khung thử nghiệm để có được ước lượng không thiên lệch về mật độ số học của các hình dạng tùy ý trên một mặt cắt. Quy tắc đếm liên quan đến khung thử nghiệm là đơn giản và không yêu cầu sửa chữa dựa trên các đại lượng ước lượng khác.
Tập 111 Số 2 - Trang 219-223 - 1977
Ước lượng diện tích bề mặt từ các mặt cắt dọc Dịch bởi AI TÓM TẮT Các mặt cắt ‘dọc’ là các mặt cắt phẳng kéo dài theo một hướng trục cố định (nhưng tùy ý). Ví dụ là các mặt cắt của một hình trụ song song với trục giữa; và các mặt cắt của một tấm phẳng vuông góc với mặt phẳng của tấm. Các mặt cắt dọc của bất kỳ đối tượng nào có thể được tạo ra bằng cách đặt đối tượng lên bàn và lấy các mặt cắt vuông góc với mặt phẳng của bàn. Các phương pháp chuẩn của hình học thể tích giả định các mặt cắt ngẫu nhiên đồng nhất và không áp dụng được cho loại mẫu thiên lệch này. Tuy nhiên, bằng cách sử dụng các hệ thống thử nghiệm được thiết kế đặc biệt, có thể thu được một đánh giá không thiên lệch về diện tích bề mặt. Các nguyên tắc chung của hình học thể tích cho các mặt cắt dọc được phác thảo. Không cần phải giả định về hình dạng hoặc phân bố phương hướng của cấu trúc. Hình học thể tích các mặt cắt dọc là hợp lệ trên cùng các điều kiện như các phương pháp hình học thể tích chuẩn cho các mặt cắt ngẫu nhiên đồng nhất. Phạm vi các đại lượng cấu trúc có thể được ước lượng từ các mặt cắt dọc bao gồm Vv , Nv , Sv và thể tích trung bình trọng số v̄v Lv . Có sự tự do hoàn toàn để chọn hướng trục dọc, điều này làm cho quy trình lấy mẫu trở nên đơn giản và ‘tự nhiên’. Các quy trình lấy mẫu thực tiễn để thực hiện các ý tưởng được mô tả và minh họa bằng các ví dụ.
Tập 142 Số 3 - Trang 259-276 - 1986
Phương pháp trung bình tương quan của một protein bao tế bào vi khuẩn sắp xếp theo quy luật Dịch bởi AI TÓM TẮT Một sự điều chỉnh của phương pháp ‘trung bình tương quan’ được mô tả cho phép thực hiện trung bình hình ảnh một cách đáng tin cậy và gần như hoàn toàn tự động trong trường hợp các cấu trúc gần chu kỳ, bất chấp sự hiện diện của các khuyết tật tinh thể đáng kể; các phương pháp đánh giá độ phân giải và đối xứng mà không phụ thuộc vào tính tinh thể cũng được thảo luận. Các vi hình điện tử của protein lớp HPI từ màng tế bào của Micrococcus radiodurans được nhuộm âm và bóng xoay đã được trung bình bằng phương pháp này, và cấu trúc chiếu được mô tả với độ phân giải khoảng 1·9 nm.
Tập 127 Số 2 - Trang 127-138 - 1982
Reconstruct: một trình chỉnh sửa miễn phí cho kính hiển vi cắt nối tiếp Dịch bởi AI Tóm tắt Nhiều nghiên cứu kính hiển vi yêu cầu tái cấu trúc từ các lát cắt nối tiếp, một phương pháp phân tích đôi khi khó khăn và tốn thời gian. Khi mỗi lát cắt được cắt, lắp ghép và hình ảnh hóa riêng biệt, các hình ảnh lát cắt phải được ráp lại và căn chỉnh để phân tích và hình dung chính xác cấu trúc ba chiều (3D). Reconstruct là một trình chỉnh sửa miễn phí được thiết kế để thuận tiện cho việc ráp nối, căn chỉnh, phân tích và hình dung các lát cắt nối tiếp. Các phương pháp mà Reconstruct sử dụng để tổ chức, chuyển đổi và hiển thị dữ liệu cho phép phân tích các chuỗi với số lượng lớn các lát cắt và hình ảnh trên nhiều mức phóng đại khác nhau bằng cách sử dụng hiệu quả bộ nhớ máy tính. Các căn chỉnh có thể khắc phục một số loại biến dạng phi tuyến tính, bao gồm các vết nứt và nếp gấp, thường gặp trong kính hiển vi điện tử nối tiếp. Rất nhiều cấu trúc khác nhau có thể dễ dàng được theo dõi và đặt cùng nhau trong một cảnh 3D duy nhất có thể được hoạt hình hoặc lưu lại. Với tư cách là một trình chỉnh sửa linh hoạt, Reconstruct có thể giảm thời gian và tài nguyên tiêu tốn cho các nghiên cứu cắt nối tiếp và cho phép phân tích một thể tích mô lớn hơn một cách nhanh chóng hơn.
Tập 218 Số 1 - Trang 52-61 - 2005