Một chuyến tham quan có hướng dẫn về phân tích đồng địa điểm trong vi kính ánh sáng

Journal of Microscopy - Tập 224 Số 3 - Trang 213-232 - 2006
Susanne Bolte1,2, Fabrice P. Cordelières3
1ISV - Institut des sciences du végétal (bat. 23 Av de la terrasse 91198 GIF SUR YVETTE CEDEX - France)
2PSE - La plante et son environnement (Bât. 23 Avenue de la terrasse 91198 GIF SUR YVETTE CEDEX - France)
3RCO - Régulations cellulaires et oncogenèse (Bâtiment 110, Centre Universitaire 91405 ORSAY CEDEX - France)

Tóm tắt

Tóm tắtChúng ta thường chấp nhận rằng việc phân chia chức năng của tế bào eukaryotic được phản ánh qua sự xuất hiện khác nhau của các protein trong các bào quan của chúng. Vị trí và chức năng sinh lý của một protein có mối quan hệ chặt chẽ; thông tin địa phương về một protein do đó là rất quan trọng để hiểu vai trò của nó trong các quá trình sinh học. Việc hình dung các protein cư trú trên các cấu trúc nội bào bằng kính hiển vi huỳnh quang đã trở thành một phương pháp thường quy trong sinh học tế bào và ngày càng được sử dụng để đánh giá sự đồng địa điểm của chúng với các dấu ấn đã được đặc trưng rõ ràng. Tuy nhiên, các phương pháp phân tích hình ảnh cho các nghiên cứu đồng địa điểm là một lĩnh vực tranh cãi và bí ẩn. Do đó, chúng tôi đã tiến hành xem xét các phương pháp phân tích đồng địa điểm hiện đang được sử dụng, giới thiệu các khái niệm quang học cơ bản quan trọng cho việc thu thập hình ảnh và phân tích sau đó. Chúng tôi cung cấp một tóm tắt các mẹo thực hành cho việc thu thập và xử lý hình ảnh mà nên diễn ra trước khi thực hiện phân tích đồng địa điểm đúng. Hơn nữa, chúng tôi thảo luận về việc áp dụng và khả năng thực hiện của các công cụ đồng địa điểm cho các tình huống đồng địa điểm sinh học khác nhau và thảo luận về những điểm mạnh và điểm yếu tương ứng của chúng. Chúng tôi đã tạo ra một bộ công cụ mới cho phân tích đồng địa điểm dưới tế bào trong ImageJ, được gọi là JACoP, tích hợp các phương pháp thống kê toàn cầu hiện tại và một phương pháp dựa trên đối tượng mới.

Từ khóa

#phân tích đồng địa điểm #tế bào eukaryotic #kính hiển vi huỳnh quang #phương pháp thống kê #JACoP

Tài liệu tham khảo

Abbe E., 1873, Beiträge zur Theorie des Mikroskops und der mikroskopischen Wahrnehmung, Schultzes Arc. F. Mikr. Anat, 9, 414

10.1111/j.1365-2818.1884.tb01110.x

10.1111/j.0022-2720.2004.01348.x

10.1242/jcs.00920

Bolte S., 2006, Functional Plant Genomics

10.1242/jcs.02847

Brown S., 2006, Functional Plant Genomics

Castelman K.R., 1979, Digital Image Processing.

Cordelières F.P.(2003)Quelle fonction pour la CLIP‐170?: recherche de partenaires et nouveaux outils d’investigation.PhD Thesis Dissertation Université de Paris‐Sud.

10.1002/(SICI)1096-9861(20000124)416:4<475::AID-CNE5>3.0.CO;2-V

10.1126/science.1088525

10.1046/j.1365-2818.1997.1470704.x

10.1038/nrm1664

10.1104/pp.103.032508

10.1016/j.copbio.2005.01.003

Gonzales R.C., 1993, Digital Image Processing

10.1007/978-1-4757-5348-6_1

10.1038/nbt896

10.1016/j.jneumeth.2005.01.012

10.1186/1471-2121-5-29

10.1046/j.1365-2818.2003.01239.x

10.1523/JNEUROSCI.0346-04.2004

10.1046/j.1365-2818.1997.d01-625.x

10.1242/jcs.103.3.857

10.1023/A:1024995215340

10.1016/1047-3203(90)90014-M

Minsky M.(1961)Microscopy Apparatus. United States Patent 3 013 467 December 19 1961 (filed November 7 1957).

Oppenheim A.V. Willsky A.S.&Young I.T.(1983)Signals and Systems2nd ed.Prentice Hall Englewood Cliffs New Jersey.

10.1007/978-1-4757-5348-6_2

Rasband W.S.(19972006) ImageJ.US National Institutes of Health Bethesda MD U.S.A.http://rsb.info.nih.gov/ij/

Roerdink J.B.T.M., 2000, Fundamenta Informaticae, 187

Ronot X., 2001, Imaging of Nucleic Acids and Quantitation in Photonic Microscopy, 10.1201/9781420041705

10.1046/j.1365-2818.1996.122402.x

10.1016/S0092-8674(01)00364-6

10.1007/b102215

Sobel I.(1970)Camera models and machine perception.PhD Thesis Stanford University.

10.1007/978-1-4757-5348-6_16

Valeur B., 2002, Molecular Fluorescence: Principles and Applications

10.1242/jcs.109.4.787

10.2144/01315bi01

10.1016/S0091-679X(08)60432-X

10.1007/978-1-4757-5348-6_4

10.1016/S0014-5793(03)00521-0

Thông tin
Thông tin xuất bản

Journal of Microscopy

Tập 224 Số 3

213-232

Thông tin tác giả