Reconstruct: một trình chỉnh sửa miễn phí cho kính hiển vi cắt nối tiếp

Journal of Microscopy - Tập 218 Số 1 - Trang 52-61 - 2005
John C. Fiala1
1Department of Biology, Boston University, Boston, MA, USA. [email protected]

Tóm tắt

Tóm tắtNhiều nghiên cứu kính hiển vi yêu cầu tái cấu trúc từ các lát cắt nối tiếp, một phương pháp phân tích đôi khi khó khăn và tốn thời gian. Khi mỗi lát cắt được cắt, lắp ghép và hình ảnh hóa riêng biệt, các hình ảnh lát cắt phải được ráp lại và căn chỉnh để phân tích và hình dung chính xác cấu trúc ba chiều (3D). Reconstruct là một trình chỉnh sửa miễn phí được thiết kế để thuận tiện cho việc ráp nối, căn chỉnh, phân tích và hình dung các lát cắt nối tiếp. Các phương pháp mà Reconstruct sử dụng để tổ chức, chuyển đổi và hiển thị dữ liệu cho phép phân tích các chuỗi với số lượng lớn các lát cắt và hình ảnh trên nhiều mức phóng đại khác nhau bằng cách sử dụng hiệu quả bộ nhớ máy tính. Các căn chỉnh có thể khắc phục một số loại biến dạng phi tuyến tính, bao gồm các vết nứt và nếp gấp, thường gặp trong kính hiển vi điện tử nối tiếp. Rất nhiều cấu trúc khác nhau có thể dễ dàng được theo dõi và đặt cùng nhau trong một cảnh 3D duy nhất có thể được hoạt hình hoặc lưu lại. Với tư cách là một trình chỉnh sửa linh hoạt, Reconstruct có thể giảm thời gian và tài nguyên tiêu tốn cho các nghiên cứu cắt nối tiếp và cho phép phân tích một thể tích mô lớn hơn một cách nhanh chóng hơn.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1007/s00436-003-1027-y

10.1145/146370.146374

10.1111/j.0021-8782.2004.00268.x

10.1523/JNEUROSCI.22-06-02215.2002

10.1002/hipo.10172

10.1038/nn830

10.1523/JNEUROSCI.18-21-08900.1998

10.1046/j.1365-2818.2001.00926.x

10.1136/jamia.2001.0080001

Fiala J.C., 2002, Computer‐based alignment and reconstruction of serial sections, Microscopy Anal. USA Edition, 52, 5

10.1002/cne.10825

10.1002/ar.1092160402

10.1088/0031-9155/40/1/014

10.1523/JNEUROSCI.22-08-03108.2002

10.1016/j.neuroscience.2004.04.053

10.1002/neu.10018

10.1038/236207a0

10.1038/35093032

10.1523/JNEUROSCI.23-24-08498.2003

10.1016/S0896-6273(02)00785-7

10.1111/j.0022-2720.2004.01298.x

10.1109/42.730403

10.2741/peychl

Popov V.I., 2003, Three‐dimensional organization of synapses and astroglia in the hippocampus of rats and ground squirrels: new structural and functional paradigms of the synapse function, Biofizika, 48, 289

10.1002/(SICI)1098-1098(2000)11:1<71::AID-IMA8>3.0.CO;2-5

10.1523/JNEUROSCI.20-24-09135.2000

10.1046/j.1460-9568.2003.02675.x

10.1126/science.290.5492.744

10.1523/JNEUROSCI.18-20-08300.1998

10.1073/pnas.052151299

10.1046/j.1365-2133.2003.05160.x

Small J.V., 1968, Measurement of section thickness, Abstracts Fourth European Regional Conference on Electron Microscopy, Rome, 1, 609

10.1002/(SICI)1096-9861(19980824)398:2<225::AID-CNE5>3.0.CO;2-2

10.1523/JNEUROSCI.0287-04.2004

10.1016/B978-0-12-008305-3.50015-5

10.1016/S0896-6273(03)00802-X

10.1523/JNEUROSCI.20-21-07986.2000

10.1016/S0165-0270(05)80002-0

10.1038/46574

Toni N., 2001, Remodeling of synaptic membranes after induction of long‐term potentiation, J. Neurosci, 21, 6245, 10.1523/JNEUROSCI.21-16-06245.2001

10.1109/51.195938

10.1523/JNEUROSCI.19-16-06897.1999

10.1016/S0074-7696(08)60956-0

10.1523/JNEUROSCI.21-17-06666.2001

10.1523/JNEUROSCI.23-06-02182.2003

10.1073/pnas.051624598

10.1016/S0262-8856(03)00137-9

Thông tin
Thông tin xuất bản

Journal of Microscopy

Tập 218 Số 1

52-61

Thông tin tác giả