Bacillus là gì? Các công bố khoa học về Bacillus

Hợp chất kháng khuẩn tự nhiên carvacrol cho thấy sự ưa thích cao đối với các pha kỵ nước. Hệ số phân phối của carvacrol trong cả pha octanol-nước và pha liposome-dung dịch đệm đã được xác định (3.64 và 3.26, tương ứng). Việc thêm carvacrol vào một huyền phù liposome dẫn đến mở rộng màng liposome. Sự mở rộng tối đa được quan sát sau khi bổ sung 0.50 μmol carvacrol/mg của l -α-phosphatidylethanolamine. Cymene, một tiền chất sinh học của carvacrol không có nhóm hydroxyl, được phát hiện có sự ưa thích cao hơn đối với màng liposome, do đó gây ra sự mở rộng nhiều hơn. Tác động của cymene lên điện thế màng ít nổi bật hơn tác động của carvacrol. Độ chênh lệch pH và các pool ATP không bị ảnh hưởng bởi cymene. Đo lường các hoạt động kháng khuẩn của các hợp chất tương tự carvacrol (ví dụ: thymol, cymene, menthol, và este methyl carvacrol) cho thấy rằng nhóm hydroxyl của hợp chất này và sự hiện diện của hệ thống electron phân tán là quan trọng đối với hoạt động kháng khuẩn của carvacrol. Dựa trên nghiên cứu này, chúng tôi giả thuyết rằng carvacrol làm không ổn định màng tế bào chất và, ngoài ra, hoạt động như một chất trao đổi proton, do đó làm giảm độ chênh lệch pH qua màng tế bào chất. Sự sụp đổ của lực đẩy proton và sự cạn kiệt của pool ATP cuối cùng dẫn đến chết tế bào.

Trình tự 3,308,274-bp của nhiễm sắc thể Lactobacillus plantarum dòng WCFS1, một chủng vi khuẩn tách từ NCIMB8826 và ban đầu được tìm thấy từ nước bọt người, đã được xác định, và chứa 3,052 gen dự đoán mã hóa protein. Chức năng sinh học có khả năng được gán cho 2,120 (70%) protein dự đoán. Phù hợp với phân loại của L. plantarum là một vi khuẩn lactic acid dị dưỡng tùy nghi, bộ gen mã hóa toàn bộ các enzyme cần thiết cho con đường đường phân và con đường phosphoketolase, tất cả dường như thuộc lớp gen có tiềm năng biểu hiện cao trong sinh vật này, điều này rõ ràng từ chỉ số điều chỉnh codon của từng gen. Hơn nữa, L. plantarum mã hóa một tiềm năng khá lớn trong phân giải pyruvate, dẫn đến nhiều sản phẩm cuối của quá trình lên men. L. plantarum là một loài hiện diện trong nhiều môi trường sinh thái khác nhau, và hành vi linh hoạt và thích nghi này được phản ánh qua số lượng tương đối lớn của các chức năng điều tiết và vận chuyển, bao gồm 25 hệ thống vận chuyển đường PTS hoàn chỉnh. Hơn nữa, nhiễm sắc thể mã hóa >200 protein ngoại bào, nhiều trong số đó được dự đoán sẽ gắn với màng tế bào. Một tỷ lệ lớn các gen mã hóa vận chuyển và sử dụng đường, cũng như các gen mã hóa chức năng ngoại bào, dường như được tập trung trong một khu vực 600-kb gần vị trí khởi đầu sao chép. Nhiều gen trong số này hiển thị sự sai lệch trong thành phần nucleotide, phù hợp với nguồn gốc ngoại lai. Những phát hiện này đề nghị rằng các gen này, cung cấp một phần quan trọng cho sự tương tác của L. plantarum với môi trường, tạo nên một khu vực thích nghi lối sống trên nhiễm sắc thể.

Những sự không đồng nhất trong các gen 16S rRNA từ các chủng riêng lẻ của Paenibacillus polymyxa đã được phát hiện thông qua sự phân tách phụ thuộc vào trình tự của các sản phẩm PCR bằng phương pháp điện di gel nhiệt độ gradient (TGGE). Một đoạn của các gen 16S rRNA, bao gồm các vùng biến đổi V6 đến V8, đã được sử dụng làm trình tự mục tiêu cho các phản ứng khuếch đại. Các sản phẩm PCR từ P. polymyxa (chủng loại) đã xuất hiện như một mô hình rõ ràng với các dải trên gel gradient. Sáu plasmid với các chèn khác nhau, thể hiện các đặc điểm di chuyển của các dải đơn lẻ trong mô hình, đã được thu được thông qua việc nhân bản các sản phẩm PCR. Các chuỗi của chúng đã được phân tích như một mẫu đại diện cho sự không đồng nhất tổng thể. Một số 10 vị trí nucleotide biến thể trong đoạn dài 347 bp đã được quan sát, với tất cả các sự thay thế vẫn bảo tồn cấu trúc thứ cấp liên quan của các vùng V6 và V8 trong các phân tử RNA. Sự lai ghép với các mồi được thiết kế đặc biệt đã chứng minh các vị trí nhiễm sắc thể khác nhau của các gen rRNA tương ứng. Các phản ứng khuếch đại của rRNA chuyển đảo từ các chuẩn bị ribosome, cũng như lai ghép toàn tế bào cho thấy một sự đại diện vượt trội của các trình tự cụ thể trong ribosome của các văn hóa phòng thí nghiệm đang tăng trưởng theo cấp số nhân. Các chủng khác nhau của P. polymyxa không chỉ cho thấy các mô hình rất khác nhau của sản phẩm PCR trong phân tích TGGE mà còn có sự gán nhãn toàn tế bào phân biệt với các mồi oligonucleotide đã thiết kế, cho thấy sự đại diện khác nhau của các trình tự riêng trong các ribosome hoạt động. Các kết quả của chúng tôi chứng minh tính hữu ích của TGGE trong phân tích cấu trúc của các gen rRNA không đồng nhất cùng với biểu hiện của chúng, nhấn mạnh các vấn đề về việc tạo ra dữ liệu có ý nghĩa cho các trình tự 16S rRNA và thiết kế mồi, và có thể có những hệ quả đối với các khái niệm tiến hóa.