Tóm tắt Việc sử dụng cả mô hình hỗn hợp tuyến tính và mô hình hỗn hợp tuyến tính
tổng quát (LMMs và GLMMs) đã trở nên phổ biến không chỉ trong khoa học xã hội và
y khoa mà còn trong khoa học sinh học, đặc biệt trong lĩnh vực sinh thái học và
tiến hóa. Các tiêu chí thông tin, chẳng hạn như Tiêu chí Thông tin Akaike (AIC),
thường được trình bày như các công cụ so sánh mô hình cho các mô hình hỗn hợp... hiện toàn bộ
#mô hình hỗn hợp #R2 #phân tích thống kê #sinh học #sinh thái học
Tóm tắt1. Tại đây, tôi trình bày một gói phần mềm phát sinh chủng loài đa chức
năng mới, phytools, dành cho môi trường tính toán thống kê R.2. Trọng tâm của
gói này là các phương pháp cho sinh học so sánh phát sinh chủng loài; tuy nhiên,
nó cũng bao gồm các công cụ cho việc suy diễn cây, nhập/xuất phát sinh chủng
loài, vẽ đồ thị, thao tác và một số nhiệm vụ khác.3. Tôi mô tả và lập bảng các
phương... hiện toàn bộ
Guangchuang Yu, David K. Smith, Huachen Zhu, Yi Guan, Tommy Tsan‐Yuk Lam
Tóm tắt Chúng tôi giới thiệu gói r, ggtree, cung cấp hình ảnh hóa có thể lập
trình và chú thích cho các cây phát sinh loài. ggtree có thể đọc nhiều định dạng
tệp cây hơn so với các phần mềm khác, bao gồm các định dạng newick, nexus, NHX,
phylip và jplace, và hỗ trợ hình ảnh hóa các đối tượng cây phylo, multiphylo,
phylo4, phylo4d, obkdata và phyloseq được định nghĩa trong các gói r khác. Nó
cũng c... hiện toàn bộ
Tóm tắt 1. Các mô hình hồi quy tuyến tính là một công cụ thống kê quan trọng
trong các nghiên cứu tiến hóa và sinh thái. Thật không may, những mô hình này
thường cho ra những ước lượng và kiểm nghiệm giả thuyết không thể giải thích
được, đặc biệt là khi các mô hình bao gồm sự tương tác hoặc các hạng tử đa thức.
Hơn nữa, các sai số chuẩn cho các nhóm điều trị, mặc dù thường được quan tâm
trong việc... hiện toàn bộ
Tóm tắt Các khía cạnh định lượng trong nghiên cứu hành vi của động vật và con
người ngày càng trở nên quan trọng để kiểm tra các giả thuyết và tìm kiếm sự hỗ
trợ thực nghiệm cho chúng. Đồng thời, máy ảnh và máy quay video có thể lưu trữ
một số lượng lớn các bản ghi video và thường được sử dụng để giám sát đối tượng
từ xa. Các nhà nghiên cứu thường gặp phải nhu cầu mã hóa một lượng lớn các bản
ghi ... hiện toàn bộ
#BORIS #mã nguồn mở #quan sát hành vi #mã hóa video #phần mềm đa nền tảng #phân tích ngân sách thời gian
Tóm tắt1. Đa dạng sinh học beta, tức là sự biến đổi trong thành phần loài giữa
các địa điểm, có thể là kết quả của việc thay thế loài giữa các địa điểm (lưu
chuyển) và sự mất mát loài giữa các địa điểm (tổn thương lồng ghép).2. Chúng tôi
trình bày betapart, một gói R để tính toán độ khác biệt tổng thể dưới dạng chỉ
số Sørensen hoặc Jaccard, cũng như các thành phần lưu chuyển và tổn thương lồng
ghé... hiện toàn bộ
Tóm tắtNhiều nghiên cứu sinh thái và tiến hóa tìm cách giải thích các mô hình
biến thể hình dạng và sự đồng biến của chúng với các biến khác. Phân tích hình
học mô phỏng (geometric morphometrics) thường được sử dụng cho mục đích này,
trong đó một tập hợp các biến hình dạng được thu thập từ tọa độ landmark theo
một sự chồng chéo Procrustes.Chúng tôi giới thiệu geomorph: một gói phần mềm để
thực hiệ... hiện toàn bộ
Robert Muscarella, Peter J. Galante, Mariano Soley‐Guardia, Robert A. Boria, Jamie M. Kass, María Uriarte, Robert P. Anderson
Tóm tắt Các nghiên cứu gần đây đã chỉ ra rằng cần phải nâng cao độ chính xác
trong việc xây dựng và đánh giá các mô hình sinh cảnh sinh thái (ENM) dựa trên
dữ liệu có mặt chỉ. Hai mục tiêu chính là cân bằng tính phù hợp của mô hình với
độ phức tạp của mô hình (ví dụ: bằng cách ‘điều chỉnh’ các cài đặt mô hình) và
đánh giá các mô hình với dữ liệu độc lập theo không gian. Những vấn đề này đặc
biệt q... hiện toàn bộ