betapart: gói R dùng để nghiên cứu đa dạng sinh học beta

Methods in Ecology and Evolution - Tập 3 Số 5 - Trang 808-812 - 2012
Andrés Baselga1, C. David L. Orme2
1Departamento de Zoología, Facultad de Biología, Universidad de Santiago de Compostela, c/Lope Gómez de Marzoa s/n, 15782, Santiago de Compostela, Spain
2Division of Biology, Department of Life Sciences, Silwood Park, Ascot, Berkshire SL5 7PY, UK

Tóm tắt

Tóm tắt

1. Đa dạng sinh học beta, tức là sự biến đổi trong thành phần loài giữa các địa điểm, có thể là kết quả của việc thay thế loài giữa các địa điểm (lưu chuyển) và sự mất mát loài giữa các địa điểm (tổn thương lồng ghép).

2. Chúng tôi trình bày betapart, một gói R để tính toán độ khác biệt tổng thể dưới dạng chỉ số Sørensen hoặc Jaccard, cũng như các thành phần lưu chuyển và tổn thương lồng ghép tương ứng của chúng.

3.betapart cho phép đánh giá các mẫu không gian của đa dạng sinh học beta sử dụng các biện pháp khác biệt giữa nhiều địa điểm, tính đến sự không đồng nhất trong thành phần giữa vài địa điểm hoặc các biện pháp cặp đôi cung cấp ma trận khoảng cách tính đến cấu trúc đa biến của sự khác biệt.

4.betapart cũng cho phép tính toán các mẫu khác biệt theo thời gian trong thành phần quần xã, cùng với các thành phần lưu chuyển và tổn thương lồng ghép của nó.

5. Nhiều phân tích ví dụ được trình bày, sử dụng dữ liệu có trong gói, để minh họa sự phù hợp của việc phân tách các thành phần lưu chuyển và tổn thương lồng ghép của đa dạng sinh học beta nhằm suy diễn những cơ chế khác nhau đứng sau các mẫu đa dạng sinh học.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1111/j.1461-0248.2010.01552.x

10.1111/j.2007.0906-7590.05191.x

10.1111/j.0906-7590.2008.5335.x

10.1111/j.1466-8238.2009.00490.x

10.1111/j.1466-8238.2011.00756.x

10.1098/rsbl.2007.0449

10.1890/11-1817.1

Danilevsky M.L.(2007)A check‐list of Longicorn Beetles (Coleoptera Cerambycoidea) of Europe.http://www.cerambycidae.net/.

10.1890/06-1736.1

10.1007/s00442-011-2126-6

Jurasinski G., 2011, simba: A Collection of Functions for Similarity Analysis of Vegetation Data. R Package Version 0.3‐4

10.1007/s00442-008-1190-z

10.1046/j.0021-8790.2001.00563.x

Maechler M., 2005, Cluster Analysis Basics and Extensions. R package

Oksanen J., 2011, vegan: Community Ecology Package. R package Version 2.0‐2

R Development Core Team, 2011, R: A Language and Environment for Statistical Computing Version 2.13.1

10.2475/ajs.241.1.1

10.1111/j.1600-0587.2009.05880.x

10.2307/1943563