• Tiền đề của nghiên cứu: Việc đo lường diện tích lá từ các bức ảnh số truyền
thống yêu cầu sự can thiệp đáng kể của người dùng, trừ khi các nền ảnh được ẩn
cẩn thận. Dễ dàng xác định diện tích lá đã được phát triển để xử lý hàng loạt
hàng trăm hình ảnh chùm hoa Arabidopsis trong vài phút, loại bỏ các yếu tố nền
không mong muốn và lưu kết quả vào tệp CSV sẵn sàng cho bảng tính.• Phương pháp
và Kết... hiện toàn bộ
#diện tích lá; phân tích hình ảnh số; tự động hóa; Arabidopsis; phần mềm Easy Leaf Area
Gregory Wheeler, Hanna E. Dorman, Alenda T. Buchanan, Lavanya Challagundla, Lisa E. Wallace
Các microsatellite tồn tại trong tất cả các bộ gen thực vật và cung cấp các dấu
hiệu hữu ích cho nghiên cứu đa dạng di truyền và cấu trúc. Các microsatellite
trong lục lạp (cpSSRs) thường được nghiên cứu do dễ dàng tách chiết hơn so với
các microsatellite trong nhân. Trong nghiên cứu này, chúng tôi đã định lượng tần
suất và các ứng dụng của cpSSRs dựa trên một tổng quan tài liệu hơn 400 nghiên
cứu... hiện toàn bộ
Lee Ripma, Michael G. Simpson, Kristen E. Hasenstab‐Lehman
• Cơ sở nghiên cứu: Khi những nhà hệ thống học cố gắng khai thác tốt nhất sức
mạnh của giải trình tự thế hệ tiếp theo (NGS), một lượng lớn các bài tổng quan,
phương pháp và công cụ phân tích khiến việc lựa chọn phương pháp phù hợp trở nên
khó khăn. Oreocarya (Boraginaceae), một chi gồm 63 loài, là một ví dụ điển hình
về một nhóm thiếu cả độ phân giải ở cấp loài và tài nguyên gen. Việc sử dụng
Gene... hiện toàn bộ
#hệ thống học #giải trình tự thế hệ tiếp theo #Geneious #lướt genom #<i>Oreocarya</i>
• Tiền đề của nghiên cứu: Các hạt than củi được bảo tồn trong trầm tích được sử
dụng như những chỉ số của cháy rừng cổ đại. Hầu hết các nghiên cứu tập trung vào
độ phong phú như một chỉ số của tần suất cháy, nhưng than củi cũng truyền đạt
thông tin về thực vật mà nó xuất phát. Một nguồn thông tin có khả năng là hình
thái của chúng, bị ảnh hưởng bởi vật liệu nguồn, tính chất của lửa, và sự vận
chuy... hiện toàn bộ
Benjamin S. T. Morgan, Louise M. Egerton‐Warburton
Giới thiệu nghiên cứu:Nấm mycorrhiza dạng túi (AMF) là những mối quan hệ cộng
sinh với rễ có tầm quan trọng toàn cầu, giúp tăng cường sự phát triển và dinh
dưỡng của cây trồng cũng như ảnh hưởng đến cấu trúc và chức năng hệ sinh thái.
Để định hình rõ hơn các mức độ đa dạng của AMF có liên quan đến chức năng hệ
sinh thái, cần có độ sâu giải trình tự lớn hơn trong các mẫu môi trường. Trong
nghiên cứ... hiện toàn bộ
Nền tảng của nghiên cứu:Các đoạn khởi đầu PCR có sẵn cho gần như mọi vùng của bộ
gen plastid. Việc lựa chọn cặp đoạn khởi đầu nào để sử dụng chỉ đứng sau việc
lựa chọn vùng gen. Điều này đặc biệt đúng với nghiên cứu ở giao diện loài/dân
số.Phương pháp:Các cặp đoạn khởi đầu cho 130 vùng của bộ gen diệp lục đã được
đánh giá trên 12 loài được phân bố trong nhóm Angiosperm. Khả năng thành công
trong v... hiện toàn bộ
Đặt vấn đề nghiên cứu:Trong nghiên cứu này, chúng tôi báo cáo bộ gen diệp lục
hoàn chỉnh của loài thảo dược quan trọng Huperzia serrata (Lycopodiaceae) và so
sánh nó với bộ gen diệp lục của loài liên quan H. lucidula.Phương pháp và Kết
quả:Bộ gen diệp lục toàn bộ của H. serrata đã được giải trình tự bằng nền tảng
Illumina và lắp ráp với Geneious phiên bản R9.0.5. Kích thước bộ gen của H.
serrata l... hiện toàn bộ
Tóm tắtGiới thiệuViệc áp dụng giải trình tự cao thông lượng, đặc biệt là đối với
các mẫu herbaria, đang nhanh chóng thúc đẩy nghiên cứu đa dạng sinh học. Giải
trình tự gen tổng thể với độ phủ thấp (genome skimming) là một phương pháp hứa
hẹn và có thể đồng thời thu hồi các vùng ribosome plastid, ty thể và nhân ở hàng
trăm loài. Ở đây, chúng tôi giới thiệu PhyloHerb, một quy trình sinh tin học
nhằm... hiện toàn bộ