• Tiền đề của nghiên cứu: Việc đo lường diện tích lá từ các bức ảnh số truyền thống yêu cầu sự can thiệp đáng kể của người dùng, trừ khi các nền ảnh được ẩn cẩn thận. Dễ dàng xác định diện tích lá đã được phát triển để xử lý hàng loạt hàng trăm hình ảnh chùm hoa Arabidopsis trong vài phút, loại bỏ các yếu tố nền không mong muốn và lưu k...... hiện toàn bộ
#diện tích lá; phân tích hình ảnh số; tự động hóa; Arabidopsis; phần mềm Easy Leaf Area
Gregory Wheeler, Hanna E. Dorman, Alenda T. Buchanan, Lavanya Challagundla, Lisa E. Wallace
Các microsatellite tồn tại trong tất cả các bộ gen thực vật và cung cấp các dấu hiệu hữu ích cho nghiên cứu đa dạng di truyền và cấu trúc. Các microsatellite trong lục lạp (cpSSRs) thường được nghiên cứu do dễ dàng tách chiết hơn so với các microsatellite trong nhân. Trong nghiên cứu này, chúng tôi đã định lượng tần suất và các ứng dụng của cpSSRs dựa trên một tổng quan tài liệu hơn 400 ng...... hiện toàn bộ
Lee Ripma, Michael G. Simpson, Kristen E. Hasenstab‐Lehman
• Cơ sở nghiên cứu: Khi những nhà hệ thống học cố gắng khai thác tốt nhất sức mạnh của giải trình tự thế hệ tiếp theo (NGS), một lượng lớn các bài tổng quan, phương pháp và công cụ phân tích khiến việc lựa chọn phương pháp phù hợp trở nên khó khăn. Oreocarya (Boraginaceae), một chi gồm 63 loài, là một ví dụ điển hình về một nhóm thiếu c...... hiện toàn bộ
#hệ thống học #giải trình tự thế hệ tiếp theo #Geneious #lướt genom #<i>Oreocarya</i>
• Tiền đề của nghiên cứu: Các hạt than củi được bảo tồn trong trầm tích được sử dụng như những chỉ số của cháy rừng cổ đại. Hầu hết các nghiên cứu tập trung vào độ phong phú như một chỉ số của tần suất cháy, nhưng than củi cũng truyền đạt thông tin về thực vật mà nó xuất phát. Một nguồn thông tin có khả năng là hình thái của chúng, bị ảnh hưởng bởi vật liệu nguồn...... hiện toàn bộ
Benjamin S. T. Morgan, Louise M. Egerton‐Warburton
Giới thiệu nghiên cứu:Nấm mycorrhiza dạng túi (AMF) là những mối quan hệ cộng sinh với rễ có tầm quan trọng toàn cầu, giúp tăng cường sự phát triển và dinh dưỡng của cây trồng cũng như ảnh hưởng đến cấu trúc và chức năng hệ sinh thái. Để định hình rõ hơn các mức độ đa dạng của AMF có liên quan đến chức năng hệ sinh thái, cần có độ sâu giải trình tự lớn hơ...... hiện toàn bộ
Nền tảng của nghiên cứu:Các đoạn khởi đầu PCR có sẵn cho gần như mọi vùng của bộ gen plastid. Việc lựa chọn cặp đoạn khởi đầu nào để sử dụng chỉ đứng sau việc lựa chọn vùng gen. Điều này đặc biệt đúng với nghiên cứu ở giao diện loài/dân số.Phương pháp:Các cặp đoạn khởi đầu cho 130 vùng của bộ ...... hiện toàn bộ
Tóm tắtGiới thiệuViệc áp dụng giải trình tự cao thông lượng, đặc biệt là đối với các mẫu herbaria, đang nhanh chóng thúc đẩy nghiên cứu đa dạng sinh học. Giải trình tự gen tổng thể với độ phủ thấp (genome skimming) là một phương pháp hứa hẹn và có thể đồng thời thu hồi các vùng ribosome plastid, ty thể và nhân ở hàng trăm loài. Ở ...... hiện toàn bộ
Đặt vấn đề nghiên cứu:Trong nghiên cứu này, chúng tôi báo cáo bộ gen diệp lục hoàn chỉnh của loài thảo dược quan trọng Huperzia serrata (Lycopodiaceae) và so sánh nó với bộ gen diệp lục của loài liên quan H. lucidula.Phương pháp và Kết quả:...... hiện toàn bộ