Dễ dàng xác định diện tích lá: Phân tích hình ảnh số tự động cho việc đo lường diện tích lá nhanh chóng và chính xác

Applications in Plant Sciences - Tập 2 Số 7 - 2014
Hsien Ming Easlon1, Arnold J. Bloom1
1Department of Plant Sciences, University of California, One Shields Avenue, Davis, California 95616, USA

Tóm tắt

Tiền đề của nghiên cứu: Việc đo lường diện tích lá từ các bức ảnh số truyền thống yêu cầu sự can thiệp đáng kể của người dùng, trừ khi các nền ảnh được ẩn cẩn thận. Dễ dàng xác định diện tích lá đã được phát triển để xử lý hàng loạt hàng trăm hình ảnh chùm hoa Arabidopsis trong vài phút, loại bỏ các yếu tố nền không mong muốn và lưu kết quả vào tệp CSV sẵn sàng cho bảng tính.

Phương pháp và Kết quả: Dễ dàng xác định diện tích lá sử dụng tỷ lệ màu của từng pixel để phân biệt lá và các khu vực hiệu chuẩn khỏi nền của chúng và so sánh số lượng pixel lá với một khu vực hiệu chuẩn màu đỏ để loại bỏ sự cần thiết phải tính toán khoảng cách camera hoặc đo lường thước kẻ thủ công mà các phương pháp phần mềm khác thường yêu cầu. Diện tích lá được ước lượng bởi phần mềm này từ hình ảnh chụp bằng điện thoại camera chính xác hơn so với ước lượng của ImageJ từ hình ảnh quét phẳng.

Từ khóa

#diện tích lá; phân tích hình ảnh số; tự động hóa; Arabidopsis; phần mềm Easy Leaf Area

Tài liệu tham khảo

10.1016/S0176-1617(96)80072-1

10.1186/1471-2229-8-82

10.21273/HORTSCI.43.6.1780

10.1111/j.1365-3040.2012.02498.x

Davidson A.2011onward. ‘Measuring leaf perimeter and leaf area.’ Prometheus wiki. Websitehttp://prometheuswiki.publish.csiro.au/tiki‐index.php?%20page=Measuring+leaf+perimeter+and+leaf+area[accessed 23 June 2014].

10.1007/s11120-013-9891-5

10.1186/1471-2164-14-655

10.1371/journal.pone.0042604

Kimball S. andP.Mattis.2012.GNU Image Manipulation Program (GIMP). Websitehttp://www.gimp.org/[accessed 23 June 2014].

10.1007/s12892-011-0029-z

10.1603/0022-0493-95.6.1190

10.1093/jxb/erq188

10.1038/nmeth.2089

10.1111/j.1600-0706.2010.19344.x