Applications in Plant Sciences

Công bố khoa học tiêu biểu

* Dữ liệu chỉ mang tính chất tham khảo

Sắp xếp:  
Tổng hợp bộ gen diệp lục hoàn chỉnh của một loài thảo dược quý, Huperzia serrata (Lycopodiaceae), và so sánh với loài liên quan Dịch bởi AI
Applications in Plant Sciences - Tập 4 Số 11 - 2016
Zhiyou Guo, Hongrui Zhang, Nawal Shrestha, Xian‐Chun Zhang
Đặt vấn đề nghiên cứu:Trong nghiên cứu này, chúng tôi báo cáo bộ gen diệp lục hoàn chỉnh của loài thảo dược quan trọng Huperzia serrata (Lycopodiaceae) và so sánh nó với bộ gen diệp lục của loài liên quan H. lucidula.Phương pháp và Kết quả:Bộ gen diệp lục toàn bộ của H. serrata đã được giải trình tự bằng nền tảng Illumina và lắp ráp với Geneious phiên bản R9.0.5. Kích thước bộ gen của H. serrata l... hiện toàn bộ
PhyloHerb: Một quy trình phylogenomic hiệu suất cao để xử lý dữ liệu genome skimming Dịch bởi AI
Applications in Plant Sciences - Tập 10 Số 3 - 2022
Liming Cai, Hongrui Zhang, Charles C. Davis
Tóm tắtGiới thiệuViệc áp dụng giải trình tự cao thông lượng, đặc biệt là đối với các mẫu herbaria, đang nhanh chóng thúc đẩy nghiên cứu đa dạng sinh học. Giải trình tự gen tổng thể với độ phủ thấp (genome skimming) là một phương pháp hứa hẹn và có thể đồng thời thu hồi các vùng ribosome plastid, ty thể và nhân ở hàng trăm loài. Ở đây, chúng tôi giới thiệu PhyloHerb, một quy trình sinh tin học nhằm... hiện toàn bộ
Các đoạn khởi đầu plastid cho phép phát sinh loài và phát sinh địa lý của Angiosperm Dịch bởi AI
Applications in Plant Sciences - Tập 3 Số 6 - 2015
Linda M. Prince
Nền tảng của nghiên cứu:Các đoạn khởi đầu PCR có sẵn cho gần như mọi vùng của bộ gen plastid. Việc lựa chọn cặp đoạn khởi đầu nào để sử dụng chỉ đứng sau việc lựa chọn vùng gen. Điều này đặc biệt đúng với nghiên cứu ở giao diện loài/dân số.Phương pháp:Các cặp đoạn khởi đầu cho 130 vùng của bộ gen diệp lục đã được đánh giá trên 12 loài được phân bố trong nhóm Angiosperm. Khả năng thành công trong v... hiện toàn bộ
Các mồi NS31/AML2 có mã vạch để giải trình tự cộng đồng nấm mycorrhiza dạng túi trong các mẫu môi trường Dịch bởi AI
Applications in Plant Sciences - Tập 5 Số 8 - 2017
Benjamin S. T. Morgan, Louise M. Egerton‐Warburton
Giới thiệu nghiên cứu:Nấm mycorrhiza dạng túi (AMF) là những mối quan hệ cộng sinh với rễ có tầm quan trọng toàn cầu, giúp tăng cường sự phát triển và dinh dưỡng của cây trồng cũng như ảnh hưởng đến cấu trúc và chức năng hệ sinh thái. Để định hình rõ hơn các mức độ đa dạng của AMF có liên quan đến chức năng hệ sinh thái, cần có độ sâu giải trình tự lớn hơn trong các mẫu môi trường. Trong nghiên cứ... hiện toàn bộ
Hình học than củi cho phân tích cổ sinh thái: Ảnh hưởng của loại nhiên liệu và vận chuyển đến các tham số hình học Dịch bởi AI
Applications in Plant Sciences - Tập 2 Số 8 - 2014
A. J. Crawford, Claire M. Belcher
• Tiền đề của nghiên cứu: Các hạt than củi được bảo tồn trong trầm tích được sử dụng như những chỉ số của cháy rừng cổ đại. Hầu hết các nghiên cứu tập trung vào độ phong phú như một chỉ số của tần suất cháy, nhưng than củi cũng truyền đạt thông tin về thực vật mà nó xuất phát. Một nguồn thông tin có khả năng là hình thái của chúng, bị ảnh hưởng bởi vật liệu nguồn, tính chất của lửa, và sự vận chuy... hiện toàn bộ
Geneious! Phương pháp lướt genom đơn giản hóa cho các nghiên cứu hệ thống học phân loại: Một nghiên cứu trường hợp ở Oreocarya (Boraginaceae) Dịch bởi AI
Applications in Plant Sciences - Tập 2 Số 12 - 2014
Lee Ripma, Michael G. Simpson, Kristen E. Hasenstab‐Lehman
• Cơ sở nghiên cứu: Khi những nhà hệ thống học cố gắng khai thác tốt nhất sức mạnh của giải trình tự thế hệ tiếp theo (NGS), một lượng lớn các bài tổng quan, phương pháp và công cụ phân tích khiến việc lựa chọn phương pháp phù hợp trở nên khó khăn. Oreocarya (Boraginaceae), một chi gồm 63 loài, là một ví dụ điển hình về một nhóm thiếu cả độ phân giải ở cấp loài và tài nguyên gen. Việc sử dụng Gene... hiện toàn bộ
#hệ thống học #giải trình tự thế hệ tiếp theo #Geneious #lướt genom #<i>Oreocarya</i>
Tổng quan về tần suất, tính hữu dụng và những lưu ý khi sử dụng các đoạn lặp đơn giản trong lục lạp để nghiên cứu sinh học thực vật Dịch bởi AI
Applications in Plant Sciences - Tập 2 Số 12 - 2014
Gregory Wheeler, Hanna E. Dorman, Alenda T. Buchanan, Lavanya Challagundla, Lisa E. Wallace
Các microsatellite tồn tại trong tất cả các bộ gen thực vật và cung cấp các dấu hiệu hữu ích cho nghiên cứu đa dạng di truyền và cấu trúc. Các microsatellite trong lục lạp (cpSSRs) thường được nghiên cứu do dễ dàng tách chiết hơn so với các microsatellite trong nhân. Trong nghiên cứu này, chúng tôi đã định lượng tần suất và các ứng dụng của cpSSRs dựa trên một tổng quan tài liệu hơn 400 nghiên cứu... hiện toàn bộ
Dễ dàng xác định diện tích lá: Phân tích hình ảnh số tự động cho việc đo lường diện tích lá nhanh chóng và chính xác Dịch bởi AI
Applications in Plant Sciences - Tập 2 Số 7 - 2014
Hsien Ming Easlon, Arnold J. Bloom
• Tiền đề của nghiên cứu: Việc đo lường diện tích lá từ các bức ảnh số truyền thống yêu cầu sự can thiệp đáng kể của người dùng, trừ khi các nền ảnh được ẩn cẩn thận. Dễ dàng xác định diện tích lá đã được phát triển để xử lý hàng loạt hàng trăm hình ảnh chùm hoa Arabidopsis trong vài phút, loại bỏ các yếu tố nền không mong muốn và lưu kết quả vào tệp CSV sẵn sàng cho bảng tính.• Phương pháp và Kết... hiện toàn bộ
#diện tích lá; phân tích hình ảnh số; tự động hóa; Arabidopsis; phần mềm Easy Leaf Area
Tổng số: 8   
  • 1