Tổng quan về tần suất, tính hữu dụng và những lưu ý khi sử dụng các đoạn lặp đơn giản trong lục lạp để nghiên cứu sinh học thực vật
Tóm tắt
Các microsatellite tồn tại trong tất cả các bộ gen thực vật và cung cấp các dấu hiệu hữu ích cho nghiên cứu đa dạng di truyền và cấu trúc. Các microsatellite trong lục lạp (cpSSRs) thường được nghiên cứu do dễ dàng tách chiết hơn so với các microsatellite trong nhân. Trong nghiên cứu này, chúng tôi đã định lượng tần suất và các ứng dụng của cpSSRs dựa trên một tổng quan tài liệu hơn 400 nghiên cứu được công bố từ 1995 đến 2013. Những dấu hiệu này là công cụ quan trọng và kinh tế cho các nhà sinh học thực vật và tiếp tục được sử dụng song song với các phương pháp di truyền hiện đại để nghiên cứu đa dạng di truyền và cấu trúc, lịch sử tiến hóa và sự lai giống ở các loài bản địa và nông nghiệp. Các nghiên cứu sử dụng các mồi loài riêng lẻ đã báo cáo số lượng locus đa hình lớn hơn so với những nghiên cứu sử dụng mồi chung. Một nhược điểm lớn của cpSSRs là tính đồng hình của kích thước đoạn phiên mã; do đó, chúng tôi đã ghi nhận sự xuất hiện của nó tại một số locus cpSSR trong và giữa các loài
Từ khóa
Tài liệu tham khảo
Smith S. E., 1989, Biparental inheritance of organelles and its implications in crop improvement, Plant Breeding Reviews, 6, 361
Wheeler G. L., 2013, Population‐level genetic structure of Acmispon argophyllus on the Channel Islands of California