Wiley

Tóm tắt: Bệnh đa xơ cứng (MS) đã được biết đến từ những năm 1970 có liên quan đến các đặc điểm HLA-Dw2 và -DR2 ở người châu Âu da trắng và Bắc Mỹ. Bằng việc sử dụng các kỹ thuật phân loại genom, liên kết này đã được xác định là thuộc về DRwlS,DQw6,Dw2, tức là haplotype DRBI*1501-DQAI*0102-DQBl*0602. Một báo cáo đã mô tả sự liên kết DPw4 đáng kể ở bệnh nhân MS Scandinavi. Tuy nhiên, sự liên kết này chưa được xác nhận trong nhiều nghiên cứu tiếp theo với bệnh nhân từ cùng một nhóm sắc tộc và các nhóm khác. Trong vài năm qua, nhiều báo cáo, dựa trên dữ liệu huyết thanh, RFLP và PCR-SSO, đã gợi ý rằng các gen nhạy cảm với MS liên quan đến HLA lớp II có thể liên quan chặt chẽ hơn với DQ hơn là khu vực DR. Các quan sát cho thấy các gen HLA-DQBI của bệnh nhân MS chia sẻ các chuỗi dài các động thái trình tự và cũng mang các alen DQA1 mã hóa glutamine ở vị trí 34 của chuỗi α DQ đã nhận được sự quan tâm đáng kể. Có giả thuyết rằng tính nhạy cảm phát triển MS có thể được xác định bởi các heterodimer DQ α-β tương ứng được mã hóa trong cis hoặc trong trans. Chúng tôi đã điều tra các vấn đề này trong một nhóm lớn các bệnh nhân MS Thụy Điển (n=179). Chúng tôi phát hiện rằng các mối liên hệ với các trình tự DQBI được đề xuất và vị trí 34 của chuỗi α DQ là do sự mất cân bằng liên kết và thứ yếu là do mối liên kết với haplotype DRw15,DQw6,Dw2 (p < 10-⁹ và p < 10-⁸, tương ứng). Không có sự quá đại diện của các heterodimer DQ α-β liên quan được quan sát ở bệnh nhân âm tính với DRw1S,DQw6,Dw2. Chúng tôi kết luận rằng dữ liệu hiện có không cho phép xác định vị trí của các gen nhạy cảm với MS liên quan đến HLA lớp II trong haplotype DRw15,DQw6,Dw2. Chúng tôi đã mô tả trước đó những khác biệt miễn dịch di truyền giữa các hình thức lâm sàng khác nhau của MS. Trong nghiên cứu hiện tại về một nhóm bệnh nhân MS mới so với một bảng kiểm soát mới, những khác biệt này đã được xác nhận một phần. Mối liên kết DRw17,DQw2 trong bệnh MS tái phát/tái phát đã được khẳng định. Tuy nhiên, ở bệnh nhân mắc bệnh MS tiến triển mãn tính chủ yếu, một mối liên kết tiêu cực với alen DQw7 đã không được xác thực và một mối liên kết tích cực với haplotype DR4.DQw8 cũng không thể được xác nhận hay bác bỏ.

Abstract:  The human major histocompatibility (MHC) genomic region at chromosomal position 6p21 encodes the six classical transplantation HLA genes and many other genes that have important roles in the regulation of the immune system as well as in some fundamental cellular processes. This small segment of the human genome has been associated with more than 100 diseases, including common diseases – such as diabetes, rheumatoid arthritis, psoriasis, asthma and various autoimmune disorders. The MHC 3.6 Mb genomic sequence was first reported in 1999 with the annotation of 224 gene loci. The locus and allelic information of the MHC continue to be updated by identifying newly mapped expressed genes and pseudogenes based on comparative genomics, SNP analysis and cDNA projects. Since 1999, new innovations in bioinformatics and gene‐specific functional databases and studies on the MHC genes have resulted in numerous changes to gene names and better ways to update and link the MHC gene symbols, names and sequences together with function, variation and disease associations. In this study, we present a brief overview of the MHC genomic structure and the recent information that we have gathered on the MHC gene loci via LocusLink at the National Centre for Biological Information (http://www.ncbi.nih.gov/.) and the MHC genes' association with various diseases taken from publications and records in public databases, such as the Online Mendelian Inheritance in Man and the Genetic Association Database.

This paper describes a new cell isolation and HLA typing technique, which permits cell separation and HLA class I or class II typing to be performed in 70 min. Magnetic monodisperse microspheres (Dynabeads TM) were coated with monoclonal antibodies (MAbs) specific for the CD8 T cell antigen or for HLA class II monomorphic epitopes. They could then be used to obtain HLA class I or class II positive cells directly from ACD blood in approximately 15 min by the use of magnetic separation. The cells (attached to the microspheres) were subsequently used in microcytotoxic HLA typing (total incubation time of 55 min) using acridin orange/ethidiumbromide to stain viable (yellow) and dead (red) cells. It was found that this immunomagnetic (IM) HLA typing technique was specific, has a sensitivity superior to that observed for conventional microcytotoxicity assays and gave low background staining. IM HLA‐ABC typing of 50 healthy donors and 10 patients and IM HLA‐DR typing of 25 healthy donors and 30 patients gave results corresponding well with that obtained independently by conventional HLA typing (concordancy rates 92–100%). Furthermore, the IM HLA typing technique permitted reliable HLA class II typing of blood cells from six patients where conventional HLA class II typing was impossible. The IM HLA typing technique also enables HLA class I and II typing to be quickly and reliably performed on cells from ACD blood of cadaveric donors.

Chúng tôi đã cập nhật danh mục các alen kháng nguyên bạch cầu người (HLA) thông thường và đã được tài liệu hóa (CWD) để phản ánh hiểu biết hiện tại về sự phổ biến của các trình tự alen cụ thể. Danh mục CWD ban đầu đã chỉ định 721 alen tại các locus HLA‐A, ‐B, ‐C, ‐DRB1, ‐DRB3/4/5, ‐DQA1, ‐DQB1, và ‐DPB1 trong dữ liệu IMGT (IMmunoGeneTics)/HLA phát hành 2.15.0 là những alen CWD. Danh mục CWD đã được cập nhật chỉ định 1122 alen tại các locus HLA‐A, ‐B, ‐C, ‐DRB1, ‐DRB3/4/5, ‐DQA1, ‐DQB1, ‐DPA1 và ‐DPB1 là những alen CWD, đại diện cho 14.3% các alen HLA trong dữ liệu IMGT/HLA phát hành 3.9.0. Đặc biệt, chúng tôi đã xác định 415 trong số các alen này là 'thông thường' (có tần suất đã biết) và 707 là 'đã được tài liệu hóa' dựa trên ~140,000 quan sát định danh theo trình tự và dữ liệu haplotype HLA có sẵn. Sử dụng các dữ liệu về sự phổ biến alen này, chúng tôi cũng đã chỉ định trạng thái CWD cho các ký hiệu G và P cụ thể. Chúng tôi đã xác định 147/151 nhóm G và 290/415 nhóm P là CWD. Danh mục CWD sẽ được cập nhật thường xuyên trong tương lai, và sẽ kết hợp các thay đổi từ dữ liệu IMGT/HLA cũng như dữ liệu thực nghiệm từ cộng đồng tương thích miễn dịch và miễn dịch học. Phiên bản 2.0.0 của danh mục CWD hiện có thể truy cập trực tuyến tại cwd.immunogenomics.org, và sẽ được tích hợp vào cơ sở dữ liệu Tần suất Alen, cơ sở dữ liệu IMGT/HLA và các trang web thông tin sinh học của Chương trình Tặng Tủy Xương Quốc Gia.

Aging is associated clinically with increases in the frequency and severity of infectious diseases and an increased incidence of cancer, chronic inflammatory disorders and autoimmunity. These age‐associated immune dysfunctions are the consequence of declines in both the generation of new naïve T and B lymphocytes and the functional competence of memory populations. These alterations collectively are termed immunosenescence.

Abstract: The HLA class II genotypes were determined in the B‐lymphoblastoid cell lines selected for the Tenth International Histocompatibility Workshop. The HLA class II genes were determined by the PCR‐SSOP method using the reagents provided by the Eleventh Histocompatibility Workshop. Additional studies have been performed for further characterization of HLA class II polymorphism on these cell lines. It is observed that several cell lines have HLA class II haplotypes with the same DRB1, DQA1 and DQB1 alleles on both haplotypes but different alleles at the other class II loci, confirming that these cell lines are not truly HLA class II‐homozygous. Other cell lines carried HLA class II haplotypes which were only different at the DRB1 gene. These results suggest double recombination events or gene conversion‐like events in generation of HLA DR, DQ haplotypes. These cell lines provide an important tool as references for HLA DNA typing.

Độ nhạy cảm liên quan đến HLA để phát triển bệnh celiac (CD) dường như chủ yếu được tạo ra bởi một heterodimer HLA‐DQ đặc biệt được mã hóa bởi các gen DQA1*0501 và DQB1*0201, có thể ở vị trí cis hoặc trans. Để nghiên cứu ảnh hưởng có thể của DRB1 hoặc các allele DQA1 và DQB1 khác đối với độ nhạy cảm với CD mà các gen DQ này tạo ra, chúng tôi đã thực hiện xác định gen HLA trên 94 bệnh nhân CD, chọn những người mang ít nhất một bản sao của haplotype DRB1*0301‐DQA1*0501‐DQB1*0201 (N = 89) và so sánh họ với 47 người Na Uy khỏe mạnh được chọn ngẫu nhiên, có ít nhất một bản sao của haplotype trên. Chúng tôi phát hiện ra rằng có sự vượt trội của DQB1*0201 homozygosity ở các bệnh nhân. Điều này là do tần suất gia tăng của các haplotype DRB1*0301‐DQA1*0501‐DQB1*0201 và DRB1*0701‐DQA1*0201‐DQB1*0201 có mặt trên nhiễm sắc thể còn lại. Chúng tôi đề xuất rằng, trong những cá nhân mang các allele DQA1*0501 và DQB1*0201, sự hiện diện của một bản sao thứ hai của allele DQB1*0201 làm tăng độ nhạy cảm với CD.

Tóm tắt: Các đặc điểm của các đồng dạng canine của CD4 và CD8, được xác định bởi các kháng thể đơn dòng chuột CA13.1E4 (IgG1) và CA9.JD3 (IgG2a) được mô tả. Những kháng thể này xác định các phân nhóm tế bào lympho không B loại trừ lẫn nhau trong các cơ quan lympho ngoại biên và trong máu. Tuy nhiên, trong tuyến ức, các kháng thể xác định các quần thể tế bào dương tính kép, âm tính kép và dương tính đơn, cho thấy sự trưởng thành tiến triển nhất quán với những gì đã mô tả cho CD4 và CD8 ở các loài động vật có vú khác. Hơn nữa, các nghiên cứu chức năng đã liên kết rõ ràng chức năng tế bào hiệu ứng cytotoxic với phân nhóm phản ứng với CA9.JD3 (CD8). Ngược lại, sự tăng sinh kích thích bởi các tế bào đồng loài và các mitogen có phần nổi bật hơn ở phân nhóm phản ứng với CA13.1E4 (CD4). Các nghiên cứu phân bố tế bào và mô cho thấy CA13.1E4 đã nhuộm bạch cầu trung tính với cường độ tương đương với sự nhuộm của các tế bào T ngoại biên. CA13.1E4 kết tủa một protein 60 kD từ bề mặt của các tế bào T và bạch cầu trung tính được tinh chế cao dưới cả hai điều kiện khử và không khử. CA9.JD3 đã kết tủa một heterodimer 32 kd và 36 kD dưới điều kiện khử, và một protein 70 kD dưới điều kiện không khử. Việc biểu hiện CD4 bởi các bạch cầu trung tính chó là điều chưa từng có ở các loài động vật có vú khác; ý nghĩa chức năng của việc biểu hiện CD4 của bạch cầu trung tính còn nhiều điều đáng ngạc nhiên trong bối cảnh hiểu biết hiện tại về các chức năng của CD4, bao gồm vai trò của nó như một thụ thể cho các vùng không đa hình của các phân tử MHC lớp II.

Abstract:  The difference in sizes of conserved stretches of DNA sequence within the major histocompatibility complex (MHC) in human individuals constitutes an underappreciated genetic diversity that has many practical implications. We developed a model to describe the variable sizes of stretches of conserved DNA in the MHC using the known frequencies of four different kinds of small (< 0.2 Mb) blocks of relatively conserved DNA sequence: HLA‐Cw/B; TNF; complotype; and HLA‐DR/DQ. Each of these small blocks is composed of two or more alleles of closely linked loci inherited as one genetic unit. We updated the concept of the conserved extended haplotype (CEH) using HLA allele identification and TNF microsatellites to show that specific combinations of the four blocks form single genetic units (≥ 1.5 Mb) with a total haplotype frequency in the Caucasian population of 0.30. Some CEHs extend to the HLA‐A and ‐DPB1 loci forming fixed genetic units of up to at least 3.2 Mb of DNA. Finally, intermediate fragments of CEHs also exist, which are, nevertheless, larger than any of the four small blocks. This complexity of genetic fixity at various levels should be taken into account in studies of genetic disease association, immune response control, and human diversity. This knowledge could also be used for matching CEHs and their fragments for patients undergoing allotransplantation.