Springer Science and Business Media LLC

Công bố khoa học tiêu biểu

* Dữ liệu chỉ mang tính chất tham khảo

Sắp xếp:  
Dự đoán Peptide Tín hiệu Sử dụng Mạng Nơ-ron Hàm Cơ sở Sinh học và Cây Quyết định Dịch bởi AI
Springer Science and Business Media LLC - Tập 5 - Trang 13-19 - 2012
Ateesh Sidhu, Zheng Rong Yang
Việc xác định peptide tín hiệu cực kỳ quan trọng trong việc thiết kế thuốc. Việc xác định chính xác các peptide tín hiệu là bước quan trọng đầu tiên để thay đổi hướng của các protein nhắm mục tiêu và sử dụng thuốc thiết kế để nhắm vào một bào quan cụ thể nhằm khắc phục một khiếm khuyết. Vì phương pháp xác định thực nghiệm là phương pháp chính xác nhất, nhưng tốn kém và mất nhiều thời gian, nên một...... hiện toàn bộ
#peptide tín hiệu #mạng nơ-ron #cây quyết định #thiết kế thuốc #dự đoán peptide
Alternative mRNA Polyadenylation Can Potentially Affect Detection of Gene Expression by Affymetrix GeneChip® Arrays
Springer Science and Business Media LLC - Tập 5 - Trang 249-253 - 2012
Veera D’mello, Ju Youn Lee, Clinton C. MacDonald, Bin Tian
DNA microarrays have been widely used to examine gene expression. The Affymetrix GeneChip® is one of the most commonly used platforms, employing DNA probes of 25 nucleotides designed to hybridise to different regions of target mRNA. The targeted region is often biased toward the 3′ end of mRNA, which can lead to biases in detection. A large number of mammalian genes can undergo alternative polyade...... hiện toàn bộ
BLMT
Springer Science and Business Media LLC - Tập 3 - Trang 193-200 - 2012
Madhavi Ganapathiraju, Vijayalaxmi Manoharan, Judith Klein-Seetharaman
Abstract: Statistical analysis of amino acid and nucleotide sequences, especially sequence alignment, is one of the most commonly performed tasks in modern molecular biology. However, for many tasks in bioinformatics, the requirement for the features in an alignment to be consecutive is restrictive and ‘n-grams’ (aka k-tuples) have been used as features instead. N-grams are usuall...... hiện toàn bộ
JAE
Springer Science and Business Media LLC - Tập 4 - Trang 151-154 - 2012
Tim J. Carver, Lisa J. Mullan
One of the most basic methods of understanding the biological significance of a sequence is to produce an alignment with related sequences. A vital aspect of correctly aligning sequences is to apply biological intuition through manual editing of an alignment produced by multiple-sequence alignment software. As part of the European Molecular Biology Open Source Software Suite (EMBOSS), a new alignm...... hiện toàn bộ
MPID-T
Springer Science and Business Media LLC - Tập 5 Số 2 - Trang 111-114 - 2006
Joo Chuan Tong, Lesheng Kong, Tin Wee Tan, Shoba Ranganathan
Suy diễn áp lực chọn lọc tính chất từ sự bảo tồn dư lượng vị trí Dịch bởi AI
Springer Science and Business Media LLC - Tập 3 - Trang 167-179 - 2012
Rose Hoberman, Judith Klein-Seetharaman, Roni Rosenfeld
Trong nghiên cứu này, chúng tôi cố gắng hiểu và giải thích áp lực chọn lọc vị trí dựa trên các thuộc tính vật lý và hóa học cơ bản. Chúng tôi đề xuất một tập hợp các giả định ràng buộc về cách mà các áp lực này hành xử, sau đó mô tả quy trình phân tích và giải thích sự phân bố của các dư lượng tại một vị trí cụ thể trong một căn chỉnh chuỗi đa dạng. Khác với các phương pháp trước đây, mô hình của ...... hiện toàn bộ
#áp lực chọn lọc #tính chất vật lý-hóa học #bảo tồn dư lượng #HIV-1 #Nef #Env
Constructing Sequence Alignments from a Markov Decision Model with Estimated Parameter Values
Springer Science and Business Media LLC - Tập 3 - Trang 159-165 - 2012
Fern Y. Hunt, Anthony J. Kearsley, Agnes O’Gallagher
Current methods for aligning biological sequences are based on dynamic programming algorithms. If large numbers of sequences or a number of long sequences are to be aligned, the required computations are expensive in memory and central processing unit (CPU) time. In an attempt to bring the tools of large-scale linear programming (LP) methods to bear on this problem, we formulate the alignment proc...... hiện toàn bộ
MSAT
Springer Science and Business Media LLC - Tập 3 - Trang 149-158 - 2012
Te Ren, Mallika Veeramalai, Aik Choon Tan, David Gilbert
This article describes the development of a new method for multiple sequence alignment based on fold-level protein structure alignments, which provides an improvement in accuracy compared with the most commonly used sequence-only-based techniques. This method integrates the widely used, progressive multiple sequence alignment approach ClustalW with the Topology of Protein Structure (TOPS) topology...... hiện toàn bộ
Biotool2Web
Springer Science and Business Media LLC - Tập 5 - Trang 63-66 - 2012
Mohammad Shahid, Intikhab Alam, Georg Fuellen
Currently there are many bioinformatics applications being developed, but there is no easy way to publish them on the World Wide Web. We have developed a Perl script, called Biotool2Web, which makes the task of creating web interfaces for simple (‘home-made’) bioinformatics applications quick and easy. Biotool2Web uses an XML document containing the parameters to run the tool on the Web, and gener...... hiện toàn bộ
MultiPrimer
Springer Science and Business Media LLC - - 2012
Chungnan Lee, Jain-Shing Wu, Yow-Ling Shiue, Hong-Long Liang
This study presents a novel application, MultiPrimer, to assist users to design multiplex PCR primers. MultiPrimer adopts an algorithm based on a genetic algorithm and can efficiently solve the multi-objective optimisation problem. A match pattern model is proposed to speed up examination of the specificity constraint. MultiPrimer is able to find a set of primer pairs simultaneously for a set of g...... hiện toàn bộ
Tổng số: 62   
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7