Springer Science and Business Media LLC

Công bố khoa học tiêu biểu

* Dữ liệu chỉ mang tính chất tham khảo

Sắp xếp:  
Alternative mRNA Polyadenylation Can Potentially Affect Detection of Gene Expression by Affymetrix GeneChip® Arrays
Springer Science and Business Media LLC - Tập 5 - Trang 249-253 - 2012
Veera D’mello, Ju Youn Lee, Clinton C. MacDonald, Bin Tian
DNA microarrays have been widely used to examine gene expression. The Affymetrix GeneChip® is one of the most commonly used platforms, employing DNA probes of 25 nucleotides designed to hybridise to different regions of target mRNA. The targeted region is often biased toward the 3′ end of mRNA, which can lead to biases in detection. A large number of mammalian genes can undergo alternative polyade...... hiện toàn bộ
GoDIVA: a pipeline for the design of bioinformatics applications
Springer Science and Business Media LLC - Tập 3 - Trang 1-2 - 2012
Allen Rodrigo
Dự đoán Peptide Tín hiệu Sử dụng Mạng Nơ-ron Hàm Cơ sở Sinh học và Cây Quyết định Dịch bởi AI
Springer Science and Business Media LLC - Tập 5 - Trang 13-19 - 2012
Ateesh Sidhu, Zheng Rong Yang
Việc xác định peptide tín hiệu cực kỳ quan trọng trong việc thiết kế thuốc. Việc xác định chính xác các peptide tín hiệu là bước quan trọng đầu tiên để thay đổi hướng của các protein nhắm mục tiêu và sử dụng thuốc thiết kế để nhắm vào một bào quan cụ thể nhằm khắc phục một khiếm khuyết. Vì phương pháp xác định thực nghiệm là phương pháp chính xác nhất, nhưng tốn kém và mất nhiều thời gian, nên một...... hiện toàn bộ
#peptide tín hiệu #mạng nơ-ron #cây quyết định #thiết kế thuốc #dự đoán peptide
cluML Dịch bởi AI
Springer Science and Business Media LLC - Tập 4 - Trang 211-213 - 2012
Nadia Bolshakova, Pádraig Cunningham
cluML là một ngôn ngữ đánh dấu mới dành cho phân cụm dữ liệu microarray và đánh giá tính hợp lệ của các cụm. Định dạng dựa trên XML này đã được thiết kế để khắc phục một số hạn chế được nhận thấy trong các định dạng truyền thống, chẳng hạn như khả năng lưu trữ nhiều phương pháp phân cụm (bao gồm cả phân cụm đôi) và kết quả xác thực trong cùng một tập dữ liệu. cluML là một công cụ hiệu quả để hỗ tr...... hiện toàn bộ
Học Máy Trong Việc Phát Hiện Các Tương Tác Giữa Các Gen Dịch bởi AI
Springer Science and Business Media LLC - - 2012
Brett A. McKinney, David M. Reif, Marylyn D. Ritchie, Jason H. Moore
Các tương tác phức tạp giữa các gen và các yếu tố môi trường được biết đến là có vai trò trong sinh bệnh học của các bệnh lý thường gặp ở con người. Có một khối lượng bằng chứng ngày càng tăng cho thấy rằng các tương tác phức tạp là ‘điều bình thường’, và thay vì chỉ như một sự nhiễu loạn nhỏ đối với di truyền học Mendel cổ điển, các tương tác có thể là tác động chiếm ưu thế. Các phương pháp thống...... hiện toàn bộ
#học máy #tương tác gen #bệnh lý thường gặp #di truyền học người #phân tích dữ liệu
PathAligner Dịch bởi AI
Springer Science and Business Media LLC - Tập 3 - Trang 241-252 - 2012
Ming Chen, Ralf Hofestädt
Động lực: Phân tích các con đường chuyển hóa là một chủ đề trung tâm trong việc hiểu mối quan hệ giữa kiểu gen và kiểu hình. Sự gia tăng nhanh chóng của dữ liệu sinh học cung cấp khả năng nghiên cứu các con đường chuyển hóa ở cả cấp độ gen và cấp độ chuyển hóa. Lấy thông tin về các con đường chuyển hóa từ các nguồn dữ liệu sinh học hiện tại, tái xây dựng các con đường chuyển hóa t...... hiện toàn bộ
Trình duyệt Cây Chú Giải Ontology Dịch bởi AI
Springer Science and Business Media LLC - Tập 5 - Trang 225-236 - 2012
Anders Bresell, Bo Servenius, Bengt Persson
Phân tích biểu hiện gen và proteomics cho phép nghiên cứu hàng ngàn sinh phẩm đồng thời. Điều này dẫn đến một danh sách dài các gen hoặc protein thú vị và một danh sách các thuật ngữ chú giải trong hàng nghìn. Việc hiểu một danh sách gen như vậy không phải là một nhiệm vụ đơn giản và sẽ đòi hỏi nỗ lực lớn để tập hợp những thông tin liên quan khổng lồ từ tài liệu và cơ sở dữ liệu. Do đó, điều hiển ...... hiện toàn bộ
#biểu hiện gen #proteomics #chú giải ontology #trình duyệt cây chú giải #MeSH #ontology gen #GO #Hệ thống Ngôn ngữ Y học Thống nhất
REGANOR Dịch bởi AI
Springer Science and Business Media LLC - Tập 5 - Trang 193-198 - 2012
Burkhard Linke, Alice C. McHardy, Heiko Neuweger, Lutz Krause, Folker Meyer
Với hơn 1000 dự án giải mã gen của sinh vật prokaryotic đang diễn ra hoặc đã hoàn thành, phân tích so sánh toàn diện về nội dung gen của những bộ gen này đã trở nên khả thi. Để cho phép một phân tích so sánh có ý nghĩa, dự đoán gen của các bộ gen khác nhau cần phải chính xác nhất có thể. Rõ ràng rằng việc cải thiện tình trạng chú thích gen cần các phương pháp xác định gen tự động để đối phó với ản...... hiện toàn bộ
#gen prokaryote #dự đoán gen #chú thích gen #phương pháp xác định gen #REGANOR
BLMT
Springer Science and Business Media LLC - Tập 3 - Trang 193-200 - 2012
Madhavi Ganapathiraju, Vijayalaxmi Manoharan, Judith Klein-Seetharaman
Abstract: Statistical analysis of amino acid and nucleotide sequences, especially sequence alignment, is one of the most commonly performed tasks in modern molecular biology. However, for many tasks in bioinformatics, the requirement for the features in an alignment to be consecutive is restrictive and ‘n-grams’ (aka k-tuples) have been used as features instead. N-grams are usuall...... hiện toàn bộ
So sánh các dự đoán chú thích cho Affymetrix GeneChips® Dịch bởi AI
Springer Science and Business Media LLC - Tập 5 - Trang 237-248 - 2012
Maria Stalteri, Andrew Harrison
Chúng tôi đã so sánh các chú thích của Affymetrix và Bioconductor cho bảng GeneChip® MOE430A (chuột). Việc ánh xạ các bộ đầu dò đến các định danh LocusLink (LocusIDs) được phát hiện là động, với nhiều thay đổi giữa các phiên bản chú thích liên tiếp của cả Affymetrix và Bioconductor. Có 49 bộ đầu dò được chỉ định cho một LocusID bởi Affymetrix và cho một LocusID khác bởi Bioconductor từ giữa năm 20...... hiện toàn bộ
#Microarray; Affymetrix; Bioconductor; Gene annotation; LocusIDs; RefSeq
Tổng số: 62   
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7