Epidemiology and Infection

Tỉ lệ sống sót, p, của một mẫu cấy được đo của Staph. aureus trong một thể tích tiêu chuẩn của máu đã được loại bỏ tiểu cầu, là một thước đo định lượng đáng tin cậy của sức mạnh diệt khuẩn của máu. Số lượng vi sinh vật sống trong mẫu cấy và trong hỗn hợp máu-khuẩn có thể được ước tính với độ chính xác cần thiết bằng cách đếm số lượng thuộc địa phát triển từ các thể tích đo được của chất lỏng được cho lên bề mặt của môi trường rắn. Agar Fildes là môi trường thích hợp nhất cho việc đếm số lượng sống trên bề mặt này, và nó được chọn dựa trên bốn tiêu chí; trong số các môi trường đã thử nghiệm, nó cho số lượng cao nhất, và số lượng này phù hợp nhất với chuỗi Poisson; và trên đó, kích thước thuộc địa trung bình là tối đa, và hệ số biến thiên kích thước thuộc địa là tối thiểu. Trên môi trường này, sự phù hợp chặt chẽ của các giá trị đếm riêng lẻ với chuỗi Poisson cho phép xác định sai số chuẩn của tỉ lệ sống sót từ một sự giản lược của biểu thức tổng quát cho sai số chuẩn của một tỉ lệ.

Số lượng thuộc địa phát triển từ một mẫu hỗn hợp máu-khuẩn có thể bị giảm, không phải do việc tiêu diệt từng vi khuẩn, mà là do sự kết tụ của chúng, hoặc bởi các agglutinin trong máu, hoặc trong bào tương của các bạch cầu có khả năng thực bào nhưng không diệt khuẩn. Có vẻ như những cơ chế này khó có khả năng hoạt động trong hỗn hợp máu-khuẩn có chứa một số lượng vi sinh vật tương đối ít; trong những hỗn hợp như vậy, tỉ lệ sống sót chỉ phản ánh sức mạnh diệt khuẩn.

1. Kích thước của các giọt bắn và nhân giọt bắn được sản xuất từ việc hắt hơi, ho và nói đã được nghiên cứu bằng cách đo vi mô 12.000 dấu vết giọt bắn trên các kính hiển vi được tiếp xúc trực tiếp với phun miệng, và 21.000 nhân giọt bắn chứa dấu vết được thu hồi từ không khí trên các kính hiển vi đã được bôi dầu, tiếp xúc trong bộ thu mẫu khe.

2. Từ các phép đo này, người ta đã tính toán rằng đường kính ban đầu của các giọt nước hô hấp dao động từ 1 đến 2000 μ, trong đó 95% có kích thước từ 2 đến 100 μ và phổ biến nhất là từ 4 đến 8 μ. Các phân bố kích thước tương tự cũng được thể hiện ở các giọt sản sinh từ việc hắt hơi, ho và nói, ngoại trừ trong trường hợp hắt hơi, các giọt nhỏ hơn là tương đối nhiều hơn.

3. Các nhân giọt bắn hô hấp có đường kính dao động từ ¼ đến 42 μ; 97% có kích thước từ ½ đến 12 μ; đường kính phổ biến nhất là từ 1 đến 2 μ.

4. Tỉ lệ các giọt bắn của mỗi kích thước chứa vi khuẩn, dù là vi khuẩn có lợi hay có hại, được xác định bởi kích thước của các giọt bắn và số lượng vi khuẩn trong các dịch tiết bị phun sương. Các phép tính dựa trên các phân bố kích thước thu được trong nghiên cứu này cho thấy rằng rất ít những giọt nhỏ hơn, và do đó rất ít nhân giọt, có khả năng chứa các sinh vật gây bệnh. Việc phun giọt bắn khó có thể gây ra trực tiếp nhiễm trùng trong không khí trừ khi có một lượng lớn sinh vật gây bệnh có mặt trong các dịch tiết của miệng phía trước.

5. Thời gian tồn tại của nhân giọt bắn trong không khí của một phòng 1700 cu.ft. và một buồng 70 cu.ft. đã được điều tra bằng cách lấy mẫu không khí với bộ thu mẫu khe ở các khoảng thời gian sau khi hắt hơi.

6. Khi không khí không bị khuấy động một cách nhân tạo bởi quạt, thời gian cần thiết để 90% nhân giọt mang vi khuẩn biến mất khỏi không khí dao động từ 30 đến 60 phút; các nhân lớn hơn 8 μ thường biến mất trong vòng 20 phút, và các nhân lớn hơn 4 μ trong vòng 90 phút; các nhân nhỏ hơn, trong đó có rất ít nhân chứa vi khuẩn, vẫn tồn tại trong không khí trong thời gian dài hơn nhiều, trong một lần là ít nhất 30 giờ. Khi một quạt được chạy trong suốt thí nghiệm, các nhân biến mất khỏi không khí nhanh hơn rất nhiều.

Trong nhiều năm qua, việc phân loại bằng phage đã chứng tỏ là một phương pháp không thể thiếu trong các nghiên cứu dịch tễ học về Salmonella typhi, S. paratyphi A và B, S. typhimurium cũng như một số kiểu serotype khác. Một hệ thống phân loại phage dành cho S. enteritidis được mô tả. Hệ thống này tính đến thời điểm hiện tại đã phân biệt được 27 loại với sự sử dụng của 10 phage phân loại.

Nhiễm trùng hoặc sự khuẩn lạc trong bệnh viện do enterococci với kháng thuốc vancomycin mức cao (nồng độ ức chế tối thiểu [MIC] từ 64 đến > 2000 mg/L) đã xảy ra ở 41 bệnh nhân mắc bệnh thận. Các enterococci kháng vancomycin này đã được phân lập từ nhiều nguồn, bao gồm cả máu. Tất cả trừ một chủng đều chứa một hoặc nhiều plasmid có trọng lượng phân tử từ 1·0 đến 40 Megadalton (MDa). Kháng vancomycin có thể được truyền qua quá trình kết hợp với một chủng nhận mẫn cảm của Enterococcus faecalis, nhưng điều này không luôn luôn liên quan đến DNA plasmid. Sự xuất hiện của kháng vancomycin mức cao có khả năng truyền được trong enterococci gây ra các nhiễm trùng lâm sàng đáng kể là đặc biệt quan trọng vì vancomycin được coi là một loại thuốc dự trữ cho việc quản lý các nhiễm trùng do các sinh vật Gram dương kháng đa kháng sinh.

Escherichia coli O157 trong 14 đàn bò đã được xác định thông qua nuôi cấy phân trong các khoảng thời gian khoảng 1 tháng kéo dài đến 13 tháng. Tỷ lệ hiện diện tổng thể là 1.0% (113/10832 mẫu phân) và 9 trong số 14 đàn bò được phát hiện là dương tính. Những đàn dương tính 2 năm trước đó (n=5) có tỷ lệ hiện diện bò dương tính cao hơn (trung vị=1.9%) so với những đàn đã có kết quả âm tính trong lần lấy mẫu trước (n=8, trung vị=0.2%). Những bò hé giai đoạn đã cai sữa có tỷ lệ hiện diện cao hơn (1.8%) so với những bê chưa cai sữa (0.9%) hoặc bò trưởng thành (0.4%). Đối với tất cả các đàn, tỷ lệ hiện diện cao nhất xảy ra trong mùa hè, dẫn đến hầu hết các mẫu phân dương tính được thu thập trong một số ít lần lấy mẫu.

Bệnh ho gà hay ho gà đã tồn tại và tái bùng phát mặc dù đã có vắc-xin và đã trở thành một trong những bệnh có thể phòng ngừa bằng vắc-xin phổ biến nhất ở các nước phương Tây. Tỷ lệ lưu hành cao của Bordetella pertussis đặt ra nguy cơ cho trẻ sơ sinh chưa được (hoàn toàn) tiêm phòng, đối với các em, bệnh ho gà là một bệnh nghiêm trọng, đe dọa đến tính mạng. Sự gia tăng bệnh ho gà chủ yếu được tìm thấy ở những nhóm tuổi mà miễn dịch đã giảm, điều này dẫn đến nhận thức rằng sự suy giảm miễn dịch là nguyên nhân chính hoặc duy nhất cho sự tái bùng phát của bệnh ho gà. Tuy nhiên, đã có những thay đổi đáng kể trong quần thể B. pertussis được ghi nhận sau khi vắc-xin được đưa vào sử dụng, cho thấy vai trò của sự thích nghi của tác nhân gây bệnh trong việc duy trì và tái bùng phát bệnh ho gà. Những thay đổi này bao gồm sự khác biệt kháng nguyên với các chủng vắc-xin và sản xuất toxin ho gà tăng lên. Sự khác biệt kháng nguyên sẽ ảnh hưởng đến cả khả năng hồi tưởng trí nhớ và hiệu quả của kháng thể, trong khi mức độ toxin ho gà cao hơn có thể làm tăng sự ức chế của hệ miễn dịch bẩm sinh và thích ứng. Chúng tôi đề xuất rằng những thích nghi này của B. pertussis đã giảm thời gian mà vắc-xin ho gà có hiệu quả và do đó tăng cường sự suy giảm miễn dịch. Chúng tôi kêu gọi một cách tiếp cận tổng thể hơn đối với vấn đề bệnh ho gà, bao gồm các đặc điểm của các loại vắc-xin, các quần thể B. pertussis và sự tương tác giữa hai yếu tố này.

Mục tiêu của nghiên cứu này là phát triển và áp dụng một mô hình toán học động về việc truyền bệnh virus varicella zoster (VZV) để dự đoán hiệu ứng của các chiến lược tiêm chủng khác nhau lên tỷ lệ mắc bệnh theo độ tuổi và kết quả của nhiễm trùng. Để thực hiện điều đó, một mô hình xác định thực tế có cấu trúc theo độ tuổi (RAS) đã được sử dụng, điều này tính đến tiềm năng tăng cao của việc lây truyền trong các nhóm tuổi đi học. Các kịch bản hiệu quả vaccine khác nhau, mức độ bao phủ vaccine và các chiến lược tiêm chủng đã được nghiên cứu và phân tích độ nhạy của các dự đoán về tỷ lệ mắc varicella với các tham số quan trọng đã được thực hiện. Mô hình dự đoán rằng tổng tỷ lệ mắc bệnh (tự nhiên và đột phá) và tỷ lệ mắc bệnh của varicella có thể sẽ giảm khi thực hiện tiêm chủng hàng loạt cho trẻ 12 tháng tuổi. Hơn nữa, việc thêm một chiến dịch bắt kịp trong năm đầu tiên cho trẻ từ 1 đến 11 tuổi có vẻ là chiến lược hiệu quả nhất để giảm cả tỷ lệ mắc varicella và tỷ lệ mắc bệnh (trong ngắn hạn và dài hạn), mặc dù có thể dẫn đến tác động bất lợi là làm tăng tỷ lệ mắc zona.

Các đàn gà thịt tại hai trang trại gia cầm ở Hà Lan đã được kiểm tra hàng tuần về sự hiện diện của Campylobacter trong phân hột tươi trong suốt tám chu kỳ sản xuất liên tiếp. Các mẫu từ trại ấp và chất độn mới được lấy vào đầu mỗi chu kỳ mới. Nước, thức ăn, côn trùng và phân của động vật trong nhà cũng được đưa vào việc lấy mẫu. Phương pháp phân loại serotype của Penner đã được sử dụng để xác định các yếu tố dịch tễ học góp phần vào sự xâm nhiễm Campylobacter ở các đàn gà thịt. Nhìn chung, các đàn gà thịt trở nên bị xâm nhiễm Campylobacter vào khoảng 3–4 tuần tuổi với tỷ lệ phân lập đạt 100%, và vẫn duy trì tình trạng xâm nhiễm cho đến lúc giết thịt. Một mẫu hình serotype tương tự đã được tìm thấy trong các chuồng gà khác nhau trên một trang trại trong suốt một chu kỳ sản xuất. Các đàn mới thường cho thấy một mẫu hình serotype mới. Hầu hết các serotype được phân lập từ gà đẻ, lợn, cừu và gia súc khác đều khác với các serotype được phân lập từ gà thịt trong cùng một khoảng thời gian. Các serotype Campylobacter từ bọ tối bên trong các chuồng gà thịt giống hệt với những serotype được phân lập từ gà thịt. Không có Campylobacter nào được phân lập từ bất kỳ mẫu nào của trại ấp, nước, thức ăn hoặc chất độn hiếm tươi. Bằng chứng kết luận về các con đường lây truyền chưa được tìm thấy, nhưng kết quả chắc chắn chỉ ra khả năng lây truyền ngang từ môi trường. Việc lây truyền ngang từ một đàn gà thịt này sang đàn khác qua sự ô nhiễm dai dẳng trong chuồng gà, cũng như việc lây truyền dọc từ các đàn giống qua trại ấp đến thế hệ con, dường như không có khả năng xảy ra cao.

EuroRotaNet, một mạng lưới phòng thí nghiệm, đã được thành lập nhằm xác định sự đa dạng của các chủng rotavirus đồng lưu hành ở châu Âu qua ba mùa rotavirus trở lên từ năm 2006/2007 và hiện tại bao gồm 16 quốc gia. Báo cáo này nhấn mạnh sự đa dạng to lớn của các chủng rotavirus đồng lưu hành trong quần thể châu Âu trong ba năm giám sát kể từ năm 2006/2007 và chỉ ra những nguồn gốc có thể của các chủng này bao gồm sự tái phân bố gen và sự truyền bệnh giữa các loài. Hơn nữa, khả năng của mạng lưới trong việc xác định các chủng lưu hành với tỉ lệ ⩾1% đã cho phép phát hiện những chủng có khả năng nổi lên như G8 và G12 kể từ khi bắt đầu nghiên cứu; phân tích dữ liệu gần đây cho thấy tỉ lệ xuất hiện của chúng đang gia tăng. Việc triển khai tiêm vắc-xin rotavirus toàn cầu ở ít nhất hai trong số các quốc gia tham gia, và độ bao phủ vắc-xin một phần ở một số quốc gia khác có thể cung cấp dữ liệu về sự đa dạng được thúc đẩy bởi việc triển khai vắc-xin và khả năng thay thế chủng bệnh ở châu Âu.

Nguyên nhân của nhiễm campylobacter sporadic đã được điều tra thông qua một nghiên cứu trường hợp và đối chứng đa trung tâm. Trong quá trình nghiên cứu, 598 trường hợp và các đối chứng của họ đã được phỏng vấn.

Phân tích hồi quy logistic có điều kiện của dữ liệu đã thu thập cho thấy rằng việc tiếp xúc nghề nghiệp với thịt sống (tỷ lệ Odds [OR] 9,37; khoảng tin cậy [CI] 95% 2,03, 43,3), có một hộ gia đình với thú cưng có triệu chứng tiêu chảy (OR 2,39; CI 1,09, 5,25), và việc tiêu thụ nước không xử lý từ hồ, sông và suối (OR 4,16; CI 1,45, 11,9) là những yếu tố nguy cơ độc lập quan trọng để mắc bệnh campylobacter. Việc xử lý bất kỳ con gà nguyên con nào trong bếp gia đình mà đã được mua sống với nội tạng, hoặc ăn bất kỳ món ăn nào được nấu từ loại gà này tại nhà (OR 0,41–0,44; CI 0,24, 0,79) và tiếp xúc nghề nghiệp với gia súc hoặc phân của chúng (OR 0,44; CI 0,21, 0,92) có mối liên hệ đáng kể với việc giảm nguy cơ mắc bệnh campylobacter.