Các kiểu gen rotavirus đồng lưu hành ở châu Âu từ năm 2006 đến 2009 theo nghiên cứu của EuroRotaNet, một mạng lưới giám sát hợp tác về chủng virus trên toàn châu Âu

Epidemiology and Infection - Tập 139 Số 6 - Trang 895-909 - 2011
Miren Iturriza‐Gómara1, Tim Dallman2, Krisztián Bànyai3, Blenda Böttiger4, Javier Buesa5, Sabine Diedrich6, Lucia Fiore7, K Johansen8, Marion Koopmans9, Neli Korsun10, Dimitra Koukou11, Annelies Kroneman9, Brigitta László12, Maija Lappalainen13, Leena Maunula14, Andreas Mas Marques6, Jelle Matthijnssens15, Sofie Midgley4, Z. Mladenova10, Sameena Nawaz1, Mateja Poljšak‐Prijatelj16, Pierre Pothier17, Franco Maria Ruggeri7, Alicia Sánchez-Fauquier18, Andrej Steyer16, I. SIDARAVICIUTE-IVASKEVICIENE19, Vasiliki Syriopoulou11, Annelise Tran8, Vytautas Usonis19, Marc Van Ranst15, Alexis de Rougemont17, James Gray1
1Enteric Virus Unit, Virus Reference Department, Centre for Infections, Health Protection Agency (HPA), London, UK.
2Bioinformatics Unit: Statistics, Modelling & Bioinformatics, Centre for Infections, HPA, London, UK
3Veterinary Medical Research Institute
4Statens Serum Institut
5University of Valencia
6Robert Koch-Institut
7Istituto Superiore di Sanità
8Swedish Institute for Infectious Disease Control.
9National Institute for Public Health and the Environment, Bilthoven, The Netherlands
10National Center of Infectious and Parasitic Diseases Bulgaria
11First Department of Pediatrics, Athens University, Aghia Sophia Children's Hospital, Athens, Greece
12Department of Medical Microbiology, University of Debrecen, Debrecen, Hungary
13Helsinki University Hospital
14#N##TAB##TAB##TAB##TAB# University of Helsinki#N##TAB##TAB##TAB#
15Department of Microbiology and Immunology, Rega Institute for Medical Research, University of Leuven, Belgium
16University of Ljubljana
17CHI de Bocage
18Instituto de Salud Carlos III
19Vilnius University Centre of Paediatrics, Vilnius, Lithuania

Tóm tắt

TÓM TẮT

EuroRotaNet, một mạng lưới phòng thí nghiệm, đã được thành lập nhằm xác định sự đa dạng của các chủng rotavirus đồng lưu hành ở châu Âu qua ba mùa rotavirus trở lên từ năm 2006/2007 và hiện tại bao gồm 16 quốc gia. Báo cáo này nhấn mạnh sự đa dạng to lớn của các chủng rotavirus đồng lưu hành trong quần thể châu Âu trong ba năm giám sát kể từ năm 2006/2007 và chỉ ra những nguồn gốc có thể của các chủng này bao gồm sự tái phân bố gen và sự truyền bệnh giữa các loài. Hơn nữa, khả năng của mạng lưới trong việc xác định các chủng lưu hành với tỉ lệ ⩾1% đã cho phép phát hiện những chủng có khả năng nổi lên như G8 và G12 kể từ khi bắt đầu nghiên cứu; phân tích dữ liệu gần đây cho thấy tỉ lệ xuất hiện của chúng đang gia tăng. Việc triển khai tiêm vắc-xin rotavirus toàn cầu ở ít nhất hai trong số các quốc gia tham gia, và độ bao phủ vắc-xin một phần ở một số quốc gia khác có thể cung cấp dữ liệu về sự đa dạng được thúc đẩy bởi việc triển khai vắc-xin và khả năng thay thế chủng bệnh ở châu Âu.

Từ khóa

#Đồng lưu hành #rotavirus #chủng bệnh #đa dạng gen #giám sát sức khỏe cộng đồng

Tài liệu tham khảo

10.1002/jmv.21468

10.1007/s00705-008-0155-1

10.1016/j.virusres.2009.05.005

10.1086/605049

10.1006/viro.2000.0456

10.1128/JVI.76.13.6596-6601.2002

10.1016/j.virol.2009.01.040

10.3201/eid1202.050006

10.1128/JVI.02081-09

10.1371/journal.ppat.1000634

10.1007/BF01309632

10.1128/JVI.75.8.3696-3705.2001

10.3201/eid0905.020562

10.1128/JCM.39.10.3796-3798.2001

Unicomb, 1999, Evidence of high-frequency genomic reassortment of group A rotavirus strains in Bangladesh: emergence of type G9 in 1995, Jounal of Clinical Microbiology, 37, 1885, 10.1128/JCM.37.6.1885-1891.1999

10.1128/JCM.41.2.913-914.2003

Gombold, 1986, Analysis of reassortment of genome segments in mice mixedly infected with rotaviruses SA11 and RRV, Journal of Virology, 57, 110, 10.1128/JVI.57.1.110-116.1986

10.1007/s007050050206

10.1097/01.inf.0000214987.67522.78

10.1016/j.jcv.2008.02.011

10.1016/j.vetmic.2003.10.029

10.1016/j.virol.2008.11.026

10.1128/JCM.41.8.3566-3573.2003

10.1016/S0042-6822(03)00153-3

10.1128/JCM.42.6.2541-2547.2004

Greenberg, 1983, Serological analysis of the subgroup protein of rotavirus, using monoclonal antibodies, Infection and Immunity, 39, 91, 10.1128/IAI.39.1.91-99.1983

Iturriza-Gomara, 2004, Rotavirus genotyping: keeping up with an evolving population of human rotaviruses, Journal of Medical Virology, 31, 259

Iturriza-Gómara, 2000, Diversity within the VP4 gene of rotavirus P[8] strains: implications for reverse transcription-PCR genotyping, Journal of Clinical Microbiology, 38, 898, 10.1128/JCM.38.2.898-901.2000

10.1016/S0168-7069(03)09019-0

Santos, 1998, Detection of rotavirus types G8 and G10 among Brazilian children with diarrhea, Journal of Clinical Microbiology, 36, 2727, 10.1128/JCM.36.9.2727-2729.1998

10.1016/0042-6822(84)90381-7

10.1007/s00705-009-0439-0

Holmes, 1999, Characterization of unusual G8 rotavirus strains isolated from Egyptian children, Epidemiology and Infection, 123, 9