Canadian Journal of Microbiology

Chúng tôi mô tả các phân tích về kiểu hình và kiểu gen được thực hiện trên Staphylococcus aureus kháng đa thuốc được phân lập từ động vật nuôi. Các dòng ST239 của Staphylococcus aureus kháng methicillin được phân lập từ chó có khả năng kháng fluoroquinolone rất cao, và đã xác định được các tổ hợp đột biến GyrA và GrlA mới. Những phát hiện này phù hợp với vai trò của việc mang mầm bệnh ở động vật trong việc phát tán các mầm bệnh quan trọng đối với con người trong cộng đồng.

Chúng tôi đã tách chiết một đoạn DNA dài 2,5 kb từ plasmid pST5R7 mã hóa cho hệ thống sử dụng sucrose từ chủng Escherichia coli B-62, hệ thống này mang lại kiểu hình lên men sucrose cho các chủng E. coli K-12 đã chuyển gen. Việc xác định trình tự DNA cho thấy có một khung đọc mở hoàn chỉnh có độ tương đồng 98% với cscA, gen sucrose-hydrolase (invertase) của regulon csc từ E. coli EC3132. Đặc điểm chức năng chỉ ra rằng việc biểu hiện ở mức cao và việc giải phóng giới hạn invertase vào không gian ngoài màng góp phần vào khả năng lên men sucrose của các chủng E. coli K-12 đã chuyển gen mang cscA. Từ khóa: sử dụng sucrose, sucrose hydrolase, invertase, sản xuất protein tái tổ hợp.

Các thảm vi khuẩn lam đã được đặc trưng từ các ao nước có nhiệt độ 45–60 °C trong các nguồn suối địa nhiệt có pH gần trung tính và chứa sulfide thấp ở Philippines. Cấu trúc thảm không thay đổi theo nhiệt độ. Tất cả các thảm đều có các lớp không gian chứa không khí được sắp xếp một cách có trật tự ở cả cấp độ vĩ mô và vi mô, và điều này dường như là một sự thích nghi cho thói quen sinh trưởng nổi. Các lớp thảm phía trên hỗ trợ sinh khối với tỷ lệ carotenoid:chlorophyll a cao và một lớp sáp chưa được đặc trưng trên bề mặt lưng. Kiểm tra vi mô cho thấy các thảm bao gồm một hình thái Fischerella duy nhất, với sự hiện diện phong phú của heterocyst trên tất cả các thảm ở tất cả các nhiệt độ. Phân tích phân tử về cấu trúc cộng đồng thảm chỉ phần nào khớp với xác định hình thái. Tất cả các mẫu đều hỗ trợ sự đa dạng được xác định bởi 16S rDNA lớn hơn so với hình thái đã chỉ ra, với sự mất mát tiến bộ về số lượng kiểu gen khi nhiệt độ tăng. Các trình tự tương tự Fischerella đã được phục hồi từ các thảm ở tất cả các nhiệt độ, nhưng một số thảm cũng thu được trình tự tương tự Oscillatoria, mặc dù các kiểu hình tương ứng không được quan sát. Phân tích phát sinh chủng loại cho thấy rằng các trình tự tương tự Fischerella có liên quan gần nhất với Fischerella major và các trình tự tương tự Oscillatoria có liên quan đến Oscillatoria amphigranulata.

Hai enzyme thủy phân, phosphatase axit (AcP; EC 3.1.3.2) và phosphatase kiềm (AlP; EC 3.1.3.1), của ba loài Capnocytophaga đã được khảo sát. Cả hai enzyme đều được sản xuất một cách liên tục, với hoạt động cao nhất ở chủng C. ochracea số 25. Hai enzyme phân hủy này (khoảng 10% tổng hoạt động) được giải phóng vào môi trường tăng trưởng trong giai đoạn sau của sự phát triển, cả dưới dạng enzyme hòa tan và liên kết với màng. Khi được nuôi cấy trong điều kiện có nồng độ cao của phosphat hữu cơ, sự tổng hợp và biểu hiện của AcP và AlP không bị thay đổi. Định vị hóa học tế bào và miễn dịch đã chỉ ra rằng các phosphatase nằm ở không gian peri-plasm, trên bề mặt tế bào và trong các túi màng.

Một chủng vi khuẩn phân hủy nitrile đa năng đã được phân lập từ môi trường nuôi cấy làm giàu từ đất của một khu rừng gần Manali, Himachal Pradesh, Ấn Độ, và được xác định là Nocardia globerula. Tổ chức này chứa 3 enzym có hoạt tính phân hủy nitrile: nitrilase, nitrile hydratase và amidase. Tế bào Nocardia globerula NHB-2 được nuôi trên môi trường canh thác bổ sung 1% glucose và 0.1% chiết xuất men cho thấy hoạt tính nitrile hydratase–amidase đặc hiệu cho nitrile hoặc amide aliphatic bão hòa, trong khi việc bổ sung acetonitrile vào môi trường canh thác đã tạo ra các tế bào có hoạt tính nitrile hydratase–amidase có khả năng phân hủy không chỉ nitrile–amide aliphatic bão hòa mà còn các amide thơm. Nocardia globerula NHB-2 được nuôi trên môi trường canh thác chứa propionitrile đã thể hiện hoạt tính nitrilase có khả năng phân hủy nitrile thơm và nitrile aliphatic không bão hòa. Tính đa năng của tổ chức này trong việc thủy phân các nitrile và amide khác nhau khiến nó trở thành một nguồn tài nguyên sinh học tiềm năng cho việc tổng hợp hữu cơ.

Nghiên cứu cấu trúc bên trong của các hạt Aspergillus niger, được phát triển trong quá trình lên men axit citric ngập từ mật đường củ cải đã được xử lý bằng ferrocyanide, đã được thực hiện bằng các kỹ thuật vi sinh thực vật. Dưới điều kiện lên men tối ưu, mỗi hạt phát triển thành một khối tròn của mycelium có độ đồng nhất. Trong 24 giờ đầu của quá trình lên men (bã được thổi khí), sau đó (bã được thổi oxy), một lớp vỏ dày của sự phát triển hình thành ở viền ngoài của hạt và quá trình tự phân giải tế bào ở trung tâm bắt đầu. Vào cuối quá trình lên men (140 giờ), hạt bao gồm một lớp mycelium chiếm chưa đến 50% thể tích của hạt. Những thay đổi trong điều kiện lên men được phản ánh qua độ dày của sự phát triển ở ngoại vi và tỷ lệ cùng phạm vi của sự tự phân giải.

Four crude oils (Prudhoe Bay, Norman Wells, Atkinson Point, and Lost Horse Hill) of different chemical composition were tested as to their biodegradability under mesophilic and psychrophilic conditions. Changes in bacterial numbers and chemical composition of the oils were monitored using a plate count and chromatographic technique respectively. Populations induced under psychrophilic conditions readily metabolized similar quality oils under mesophilic conditions. Mesophilic populations, however, only showed a limited metabolic capability on similar quality oils under psychrophilic conditions. Gram-negative rods were predominant in all the populations obtained under these experimental conditions. The ability of the mixed populations to use crude oil as a sole carbon source was dependent not only on the composition and amount of the n-saturate fraction but also on that of the asphaltene and NSO (i.e. nitrogen-, sulfur-, and oxygen-containing) fraction. Growth on an oil which lacked a normal n-alkane component indicated that the aromatic fraction of oil was capable of sustaining bacterial growth. Oil quality and temperature of incubation affected the generic composition of populations obtained which would use crude oil. The isoprenoids, phytane and pristane, while readily used under mesophilic conditions, were more resistant to bacterial metabolism under psychrophilic conditions.

Bài báo này thảo luận về mối quan hệ giữa sinh học phân tử của melanogenesis polyketide với các con đường không sản xuất melanin ở nhiều loại nấm và các sinh vật khác. Các phương pháp phân tích và đặc tính cơ bản của melanins được thảo luận và các đặc tính melanin nấm được so sánh với các đặc tính melanin của động vật và vi khuẩn. Quá trình phân hủy enzym của melanins bởi lignin peroxidases được mô tả.

Chúng tôi đã nghiên cứu ảnh hưởng của hai loài thực vật khác nhau (ngô và đậu nành) và ba loại đất khác nhau đến cấu trúc cộng đồng vi sinh vật trong vùng rễ (rhizosphere). Giả thuyết làm việc của chúng tôi là hiệu ứng vùng rễ sẽ mạnh nhất đối với các vi sinh vật dị dưỡng hiếu khí phát triển nhanh, trong khi sẽ có ít hoặc không có hiệu ứng vùng rễ đối với các vi sinh vật oligotrophic và các vi sinh vật phát triển chậm khác. Vi khuẩn và nấm có thể nuôi cấy có mật độ quần thể cao hơn trong vùng rễ so với trong đất tổng thể. Các cộng đồng được đặc trưng bởi phân tích axit béo trong đất và bằng các thử nghiệm sử dụng mẫu nền cho vi khuẩn và nấm. Phân tích axit béo cho thấy có một hiệu ứng đất rất mạnh nhưng ít hiệu ứng thực vật đối với cộng đồng vi sinh vật, cho thấy cấu trúc cộng đồng vi sinh vật tổng thể không bị ảnh hưởng bởi vùng rễ. Có một hiệu ứng vùng rễ mạnh mẽ được phát hiện qua thử nghiệm sử dụng mẫu nền đối với cấu trúc cộng đồng vi sinh vật hiếu khí dị dưỡng phát triển nhanh, với các mẫu kiểm soát đất và mẫu vùng rễ được phân biệt rõ ràng với nhau. Có một hiệu ứng vùng rễ yếu hơn nhiều trên các cộng đồng nấm so với các cộng đồng vi khuẩn như đã được đo bằng các thử nghiệm sử dụng mẫu nền. Ở cấp độ phân tích cộng đồng thô này, cộng đồng vi sinh vật vùng rễ bị ảnh hưởng nhiều nhất bởi các hiệu ứng đất, và vùng rễ chỉ ảnh hưởng đến một phần nhỏ tổng số vi khuẩn. Từ khóa: vùng rễ, cộng đồng vi sinh vật, axit béo, sử dụng mẫu nền.

Nhiều môi trường được thiết kế để xác định số lượng vi sinh vật phân hủy dầu mỏ (MPN) đã được so sánh. Kết quả tốt nhất, tức là số lượng lớn nhất, đạt được khi sử dụng môi trường lỏng đệm (32 mM PO₄^≡) chứa 1% cơ chất hydrocarbon. Trong số 104 vi sinh vật dự đoán phân hủy dầu được thử nghiệm, 20 chủng phát triển trên môi trường thạch dầu nhưng không sử dụng dầu hay hỗn hợp hydrocarbon paraphin tinh khiết (C₁₀ đến C₁₆n-alkanes) trong môi trường lỏng (MPN). Độ đục nhìn thấy được trong môi trường lỏng có mối tương quan với việc sử dụng hydrocarbon. Số lượng vi sinh vật phân hủy dầu thu được bằng môi trường lỏng (MPN) trong hầu hết các trường hợp cao hơn so với số lượng thu được trên môi trường gel silica thêm dầu. Cả hai quy trình đều cho thấy ước lượng số lượng phân hủy dầu, và môi trường thạch thêm dầu cho phép sự phát triển của các sinh vật không phân hủy dầu thô. Tất cả các chủng vi sinh vật phân hủy dầu được kiểm tra trong nghiên cứu này đều có khả năng lipolytic, nhưng điều ngược lại không phải luôn đúng.