Canadian Journal of Microbiology

A study of the internal structure of Aspergillus niger pellets, grown during submerged citric acid fermentation of ferrocyanide-treated beet molasses, was made using botanical microtechniques. Under optimum fermentation conditions, each pellet developed as a round mass of mycelium of uniform consistency during the first 24 hours of the fermentation (mash sparged with air); subsequently (mash sparged with oxygen), a dense crust of growth formed at the periphery of the pellet and autolysis of cells at the center began. At the end of fermentation (140 hours), the pellet consisted of a shell of mycelium occupying less than 50% of the pellet volume. Changes in fermentation conditions were reflected in the density of peripheral growth and in the rate and extent of autolysis.

A versatile nitrile-degrading bacterium was isolated by enrichment culture from the soil of a forest near Manali, Himachal Pradesh, India, and was identified as Nocardia globerula. This organism contains 3 enzymes with nitrile-degrading activity: nitrilase, nitrile hydratase, and amidase. Nocardia globerula NHB-2 cells grown on nutrient broth supplemented with 1% glucose and 0.1% yeast extract exhibited nitrile hydratase–amidase activity specific for saturated aliphatic nitriles or amide, while addition of acetonitrile in nutrient broth yielded cells with nitrile hydratase–amidase that in addition to saturated aliphatic nitriles–amide also hydrolyzed aromatic amide. Nocardia globerula NHB-2 cultivated on nutrient broth containing propionitrile exhibited nitrilase activity that hydrolyzed aromatic nitrile and unsaturated aliphatic nitrile. The versatility of this organism in the hydrolysis of various nitriles and amides makes it a potential bioresource for use in organic synthesis.Key words: Nocardia globerula NHB-2, nitrilase, nitrile hydratase, amidase, nitrile–amide degradation.

The two hydrolytic enzymes, acid (AcP; EC 3.1.3.2) and alkaline (A1P; EC 3.1.3.1) phosphatase, of the three types species of Capnocytophaga were examined. Both enzymes were produced constitutively, with their activity highest in C. ochracea strain 25. These two degradative enzymes (approximately 10% of the total activity) were released into the growth medium during the latter stages of growth, both as soluble and membrane-bound enzymes. When grown in the presence of high concentrations of organic phosphates, the synthesis and expression of AcP and AlP was unaltered. Cyto- and immuno-chemical localization situated the phosphatases in the periplasmic space, at the cell surface, and in membranous vesicles.

Cyanobacterial mats were characterized from pools of 45–60 °C in near-neutral pH, low-sulphide geothermal springs in the Philippines. Mat structure did not vary with temperature. All mats possessed highly ordered layers of airspaces at both the macroscopic and microscopic level, and these appear to be an adaptation to a free-floating growth habit. Upper mat layers supported biomass with elevated carotenoid:chlorophyll a ratios and an as yet uncharacterized waxy layer on the dorsal surface. Microscopic examination revealed mats comprised a single Fischerella morphotype, with abundant heterocysts throughout mats at all temperatures. Molecular analysis of mat community structure only partly matched morphological identification. All samples supported greater 16S rDNA-defined diversity than morphology suggested, with a progressive loss in the number of genotypes with increasing temperature. Fischerella-like sequences were recovered from mats occurring at all temperatures, but some mats also yielded Oscillatoria-like sequences, although corresponding phenotypes were not observed. Phylogenetic analysis revealed that Fischerella-like sequences were most closely affiliated with Fischerella major and the Oscillatoria-like sequences with Oscillatoria amphigranulata.Key words: cyanobacteria, Fischerella, geothermal springs, microbial mats, Oscillatoria.

We have isolated a 2.5-kb DNA fragment from plasmid pST5R7 encoding a sucrose utilization system from Escherichia coli B-62 which confers a sucrose-fermenting phenotype to transformed E. coli K-12 strains. DNA-sequence determination revealed one full-length open reading frame 98% identical to cscA, the sucrose-hydrolase (invertase) gene of the csc regulon from E. coli EC3132. Functional characterization indicates that high-level expression and limited periplasmic release of invertase is responsible for the sucrose-fermenting capacity of transformed E. coli K-12 strains carrying cscA.Key words: sucrose utilization, sucrose hydrolase, invertase, recombinant protein production.

Bài báo này thảo luận về mối quan hệ giữa sinh học phân tử của melanogenesis polyketide với các con đường không sản xuất melanin ở nhiều loại nấm và các sinh vật khác. Các phương pháp phân tích và đặc tính cơ bản của melanins được thảo luận và các đặc tính melanin nấm được so sánh với các đặc tính melanin của động vật và vi khuẩn. Quá trình phân hủy enzym của melanins bởi lignin peroxidases được mô tả.

We describe phenotypic and genotypic analyses carried out on multidrug-resistant Staphylococcus aureus isolated from domestic animals. The sequence type ST239 methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolated from dogs were highly resistant to fluoroquinolones, and new combinations of GyrA and GrlA mutations were identified. These findings are consistent with a role for animal carriage in the dissemination of important human pathogens in the community.

Chúng tôi đã nghiên cứu ảnh hưởng của hai loài thực vật khác nhau (ngô và đậu nành) và ba loại đất khác nhau đến cấu trúc cộng đồng vi sinh vật trong vùng rễ (rhizosphere). Giả thuyết làm việc của chúng tôi là hiệu ứng vùng rễ sẽ mạnh nhất đối với các vi sinh vật dị dưỡng hiếu khí phát triển nhanh, trong khi sẽ có ít hoặc không có hiệu ứng vùng rễ đối với các vi sinh vật oligotrophic và các vi sinh vật phát triển chậm khác. Vi khuẩn và nấm có thể nuôi cấy có mật độ quần thể cao hơn trong vùng rễ so với trong đất tổng thể. Các cộng đồng được đặc trưng bởi phân tích axit béo trong đất và bằng các thử nghiệm sử dụng mẫu nền cho vi khuẩn và nấm. Phân tích axit béo cho thấy có một hiệu ứng đất rất mạnh nhưng ít hiệu ứng thực vật đối với cộng đồng vi sinh vật, cho thấy cấu trúc cộng đồng vi sinh vật tổng thể không bị ảnh hưởng bởi vùng rễ. Có một hiệu ứng vùng rễ mạnh mẽ được phát hiện qua thử nghiệm sử dụng mẫu nền đối với cấu trúc cộng đồng vi sinh vật hiếu khí dị dưỡng phát triển nhanh, với các mẫu kiểm soát đất và mẫu vùng rễ được phân biệt rõ ràng với nhau. Có một hiệu ứng vùng rễ yếu hơn nhiều trên các cộng đồng nấm so với các cộng đồng vi khuẩn như đã được đo bằng các thử nghiệm sử dụng mẫu nền. Ở cấp độ phân tích cộng đồng thô này, cộng đồng vi sinh vật vùng rễ bị ảnh hưởng nhiều nhất bởi các hiệu ứng đất, và vùng rễ chỉ ảnh hưởng đến một phần nhỏ tổng số vi khuẩn. Từ khóa: vùng rễ, cộng đồng vi sinh vật, axit béo, sử dụng mẫu nền.

Nhiều môi trường được thiết kế để xác định số lượng vi sinh vật phân hủy dầu mỏ (MPN) đã được so sánh. Kết quả tốt nhất, tức là số lượng lớn nhất, đạt được khi sử dụng môi trường lỏng đệm (32 mM PO₄^≡) chứa 1% cơ chất hydrocarbon. Trong số 104 vi sinh vật dự đoán phân hủy dầu được thử nghiệm, 20 chủng phát triển trên môi trường thạch dầu nhưng không sử dụng dầu hay hỗn hợp hydrocarbon paraphin tinh khiết (C₁₀ đến C₁₆n-alkanes) trong môi trường lỏng (MPN). Độ đục nhìn thấy được trong môi trường lỏng có mối tương quan với việc sử dụng hydrocarbon. Số lượng vi sinh vật phân hủy dầu thu được bằng môi trường lỏng (MPN) trong hầu hết các trường hợp cao hơn so với số lượng thu được trên môi trường gel silica thêm dầu. Cả hai quy trình đều cho thấy ước lượng số lượng phân hủy dầu, và môi trường thạch thêm dầu cho phép sự phát triển của các sinh vật không phân hủy dầu thô. Tất cả các chủng vi sinh vật phân hủy dầu được kiểm tra trong nghiên cứu này đều có khả năng lipolytic, nhưng điều ngược lại không phải luôn đúng.

Khối lượng sinh khối vi sinh vật và tỷ lệ hô hấp của đất giảm sau khi áp dụng 150 kg NH₄NO₃–N∙ha⁻¹ cho các mẫu đất podzol của rừng thông khác nhau. Sự giảm này đã được phát hiện sau 3 tháng bón phân và vẫn rõ rệt sau 3–5 năm. Những thay đổi về pH, chất hữu cơ, hoặc độ ẩm trong đất không thể giải thích được những sự giảm này. Trong các thí nghiệm trong phòng thí nghiệm, một số mẫu đất rừng không bón phân được xử lý với 2 mg NH₄NO₃–N hoặc đạm urê∙g đất ẩm⁻¹. Việc bổ sung amoni nitrate dẫn đến sự suy giảm mạnh mẽ của tỷ lệ hô hấp trong suốt quá trình ủ và kéo dài đến 175 ngày, và sự giảm này đã được chứng kiến sau khoảng 1 tuần. Sự điều trị bằng urê ban đầu làm tăng tỷ lệ hô hấp của đất, nhưng điều này dường như chỉ là một hiệu ứng tạm thời.