Giới thiệu mothur: Phần mềm mã nguồn mở, độc lập với nền tảng, được cộng đồng hỗ trợ để mô tả và so sánh các cộng đồng vi sinh vật Dịch bởi AI Tập 75 Số 23 - Trang 7537-7541 - 2009
Patrick D. Schloss, Sarah L. Westcott, Thomas Ryabin, Justine R. Garcia, Martin Hartmann, Emily B. Hollister, Ryan A. Lesniewski, Brian B. Oakley, Donovan H. Parks, Courtney J. Robinson, Jason W. Sahl, Blaž Stres, Gerhard Thallinger, David J. Horn, Carolyn F. Weber
TÓM TẮT
mothur nhắm đến mục tiêu trở thành một gói phần mềm toàn diện cho phép người dùng sử dụng một phần mềm duy nhất để phân tích dữ liệu chuỗi cộng đồng. Phần mềm này xây dựng dựa trên các công cụ trước đó để cung cấp một gói phần mềm linh hoạt và mạnh mẽ cho việc phân tích dữ liệu giải trình tự. Như một nghiên cứu điển hình, chúng tôi đã sử dụng moth...... hiện toàn bộ Phân Loại Bayesian Điện Biên Để Gán Nhanh Trình Tự rRNA Vào Hệ Thống Phân Loại Vi Khuẩn Mới Dịch bởi AI Tập 73 Số 16 - Trang 5261-5267 - 2007
Qiong Wang, George M Garrity, James M. Tiedje, James R. Cole
TÓM TẮT Dự án Cơ Sở Dữ Liệu Ribosome (RDP) với bộ phân loại Bayesian đơn giản có thể nhanh chóng và chính xác phân loại các trình tự 16S rRNA của vi khuẩn vào hệ thống phân loại cấp cao hơn mới được đề xuất trong
Bản phác thảo phân loại vi khuẩn của Bergey
(Ấn bản thứ 2, phát hành 5.0, Springer-Verlag, New York, ...... hiện toàn bộ #Bộ phân loại RDP #rRNA 16S #phân loại vi khuẩn #biến V2 và V4 #pyrosequencing #so sánh cộng đồng vi sinh vật #biểu hiện khác biệt giữa các mẫu.
Greengenes, Cơ sở dữ liệu gen 16S rRNA được kiểm tra chimera và bàn làm việc tương thích với ARB Dịch bởi AI Tập 72 Số 7 - Trang 5069-5072 - 2006
Todd Z. DeSantis, Philip Hugenholtz, N. Larsen, Mark Rojas, Eoin Brodie, Kenneth H. Keller, Thomas Huber, Daniel Dalevi, Pengwei Hu, Gary L. Andersen
TÓM TẮT
Cơ sở dữ liệu gen 16S rRNA (
hiện toàn bộ
UniFrac: Một Phương Pháp Phân Tích Phân Giác Mới Để So Sánh Các Cộng Đồng Vi Khuẩn Dịch bởi AI Tập 71 Số 12 - Trang 8228-8235 - 2005
Catherine Lozupone, Rob Knight
TÓM TẮTChúng tôi giới thiệu một phương pháp mới để tính toán sự khác biệt giữa các cộng đồng vi khuẩn dựa trên thông tin phân giác. Phương pháp này, UniFrac, đo khoảng cách phân giác giữa các tập hợp thuế đóng trong một cây phân giác, thể hiện như một phần của chiều dài nhánh của cây dẫn đến các hậu duệ từ một môi trường này hoặc môi trường khác, nhưng không phải c...... hiện toàn bộ Sử dụng màng lọc Nuclepore để đếm vi khuẩn bằng kính hiển vi huỳnh quang Dịch bởi AI Tập 33 Số 5 - Trang 1225-1228 - 1977
John E. Hobbie, Ralph J. Daley, S. Jasper
Màng lọc Nuclepore polycarbonate có ưu thế hơn màng lọc cellulose trong việc đếm trực tiếp vi khuẩn vì chúng có kích thước lỗ đồng nhất và bề mặt phẳng giữ tất cả vi khuẩn ở trên bề mặt màng. Trong khi màng lọc cellulose cũng giữ tất cả vi khuẩn, nhiều vi khuẩn bị lọt vào bên trong màng, nơi không thể đếm được. Trước khi sử dụng, màng lọc Nuclepore phải được nhuộm màu với irgalan black để ...... hiện toàn bộ #nuclepore filters #cellulose filters #direct bacterial counting #fluorescence microscopy #lake water #ocean water #irgalan black #autofluorescence.
Mô hình hóa đường cong tăng trưởng của vi khuẩn Dịch bởi AI Tập 56 Số 6 - Trang 1875-1881 - 1990
M.H. Zwietering, I. Jongenburger, F.M. Rombouts, K. van ’t Riet
Nhiều hàm sigmoid (logistic, Gompertz, Richards, Schnute và Stannard) đã được so sánh để mô tả đường cong tăng trưởng của vi khuẩn. Chúng được so sánh một cách thống kê bằng cách sử dụng mô hình của Schnute, là một mô hình toàn diện, bao gồm tất cả các mô hình khác. Phép thử t và phép thử F đã được sử dụng. Với phép thử ... hiện toàn bộ