Applied and Environmental Microbiology
SCIE-ISI SCOPUS (1976-2025)
0099-2240
1098-5336
Mỹ
Cơ quản chủ quản: AMER SOC MICROBIOLOGY , American Society for Microbiology
Lĩnh vực:
BiotechnologyEcologyFood ScienceApplied Microbiology and Biotechnology
Các bài báo tiêu biểu
Giới thiệu mothur: Phần mềm mã nguồn mở, độc lập với nền tảng, được cộng đồng hỗ trợ để mô tả và so sánh các cộng đồng vi sinh vật Dịch bởi AI
Tập 75 Số 23 - Trang 7537-7541 - 2009
TÓM TẮT mothur nhắm đến mục tiêu trở thành một gói phần mềm toàn diện cho phép
người dùng sử dụng một phần mềm duy nhất để phân tích dữ liệu chuỗi cộng đồng.
Phần mềm này xây dựng dựa trên các công cụ trước đó để cung cấp một gói phần mềm
linh hoạt và mạnh mẽ cho việc phân tích dữ liệu giải trình tự. Như một nghiên
cứu điển hình, chúng tôi đã sử dụng mothur để cắt, sàng lọc và căn chỉnh các
chuỗi;...
Phân Loại Bayesian Điện Biên Để Gán Nhanh Trình Tự rRNA Vào Hệ Thống Phân Loại Vi Khuẩn Mới Dịch bởi AI
Tập 73 Số 16 - Trang 5261-5267 - 2007
TÓM TẮT Dự án Cơ Sở Dữ Liệu Ribosome (RDP) với bộ phân loại Bayesian đơn giản có
thể nhanh chóng và chính xác phân loại các trình tự 16S rRNA của vi khuẩn vào hệ
thống phân loại cấp cao hơn mới được đề xuất trong Bản phác thảo phân loại vi
khuẩn của Bergey (Ấn bản thứ 2, phát hành 5.0, Springer-Verlag, New York, NY,
2004). Nó cung cấp các phân công phân loại từ miền xuống chi, với ước tính độ
tin ...
#Bộ phân loại RDP #rRNA 16S #phân loại vi khuẩn #biến V2 và V4 #pyrosequencing #so sánh cộng đồng vi sinh vật #biểu hiện khác biệt giữa các mẫu.
Phân tích các quần thể vi sinh vật phức tạp bằng phân tích điện di gel gradient biến tính của các gen được khuếch đại bởi phản ứng chuỗi polymerase mã hóa cho 16S rRNA Dịch bởi AI
Tập 59 Số 3 - Trang 695-700 - 1993
Chúng tôi mô tả một phương pháp phân tử mới để phân tích đa dạng di truyền của
các quần thể vi sinh vật phức tạp. Kỹ thuật này dựa trên việc tách biệt các đoạn
gene mã hóa cho 16S rRNA, có cùng chiều dài, được khuếch đại bằng phản ứng chuỗi
polymerase (PCR) thông qua điện di gel gradient biến tính (DGGE). Phân tích DGGE
của các cộng đồng vi sinh vật khác nhau cho thấy sự hiện diện của tối đa 10 bă...
Greengenes, Cơ sở dữ liệu gen 16S rRNA được kiểm tra chimera và bàn làm việc tương thích với ARB Dịch bởi AI
Tập 72 Số 7 - Trang 5069-5072 - 2006
TÓM TẮT Cơ sở dữ liệu gen 16S rRNA ( http://greengenes.lbl.gov ) giải quyết
những hạn chế của các kho dữ liệu công cộng bằng cách cung cấp kiểm tra chimera,
căn chỉnh chuẩn và phân loại thuế bằng nhiều phân loại đã được công bố. Đã phát
hiện ra rằng có sự không nhất quán trong thuật ngữ phân loại giữa các người quản
lý ngay cả ở cấp độ ngành. Các chimera có khả năng đã được xác định trong 3% các
t...
UniFrac: Một Phương Pháp Phân Tích Phân Giác Mới Để So Sánh Các Cộng Đồng Vi Khuẩn Dịch bởi AI
Tập 71 Số 12 - Trang 8228-8235 - 2005
TÓM TẮTChúng tôi giới thiệu một phương pháp mới để tính toán sự khác biệt giữa
các cộng đồng vi khuẩn dựa trên thông tin phân giác. Phương pháp này, UniFrac,
đo khoảng cách phân giác giữa các tập hợp thuế đóng trong một cây phân giác, thể
hiện như một phần của chiều dài nhánh của cây dẫn đến các hậu duệ từ một môi
trường này hoặc môi trường khác, nhưng không phải cả hai. UniFrac có thể được sử
dụn...
Phát triển Chiến lược Giải trình Gấp Đôi và Quy trình Chỉnh sửa để Phân tích Dữ liệu Chuỗi Amplicon trên Nền tảng Giải trình MiSeq của Illumina Dịch bởi AI
Tập 79 Số 17 - Trang 5112-5120 - 2013
TÓM TẮT Sự tiến bộ nhanh chóng trong công nghệ giải trình đã thay đổi cảnh quan
thực nghiệm của sinh thái vi sinh vật. Trong 10 năm qua, lĩnh vực này đã chuyển
từ việc giải trình hàng trăm đoạn gen 16S rRNA mỗi nghiên cứu thông qua thư viện
nhân bản sang việc giải trình hàng triệu đoạn mỗi nghiên cứu bằng các công nghệ
giải trình thế hệ tiếp theo từ 454 và Illumina. Khi những công nghệ này tiến bộ...
#sinh thái vi sinh vật #giải trình gen #công nghệ giải trình thế hệ tiếp theo #gen 16S rRNA #nền tảng MiSeq #amplicon
Sử dụng màng lọc Nuclepore để đếm vi khuẩn bằng kính hiển vi huỳnh quang Dịch bởi AI
Tập 33 Số 5 - Trang 1225-1228 - 1977
Màng lọc Nuclepore polycarbonate có ưu thế hơn màng lọc cellulose trong việc đếm
trực tiếp vi khuẩn vì chúng có kích thước lỗ đồng nhất và bề mặt phẳng giữ tất
cả vi khuẩn ở trên bề mặt màng. Trong khi màng lọc cellulose cũng giữ tất cả vi
khuẩn, nhiều vi khuẩn bị lọt vào bên trong màng, nơi không thể đếm được. Trước
khi sử dụng, màng lọc Nuclepore phải được nhuộm màu với irgalan black để loại bỏ
...
#nuclepore filters #cellulose filters #direct bacterial counting #fluorescence microscopy #lake water #ocean water #irgalan black #autofluorescence.
Mô hình hóa đường cong tăng trưởng của vi khuẩn Dịch bởi AI
Tập 56 Số 6 - Trang 1875-1881 - 1990
Nhiều hàm sigmoid (logistic, Gompertz, Richards, Schnute và Stannard) đã được so
sánh để mô tả đường cong tăng trưởng của vi khuẩn. Chúng được so sánh một cách
thống kê bằng cách sử dụng mô hình của Schnute, là một mô hình toàn diện, bao
gồm tất cả các mô hình khác. Phép thử t và phép thử F đã được sử dụng. Với phép
thử t, khoảng tin cậy cho các tham số có thể được tính toán và có thể được sử
dụng...
Phát triển các bộ mồi được thiết kế để sử dụng với PCR nhằm khuếch đại các gen bảo tồn từ nấm xử lý sợi (filamentous ascomycetes) Dịch bởi AI
Tập 61 Số 4 - Trang 1323-1330 - 1995
Chúng tôi đã xây dựng chín bộ mồi oligonucleotide dựa trên kết quả lai DNA của
các gen đã nhân bản từ Neurospora crassa và Aspergillus nidulans với các hệ gen
của một số ascomycetes sợi và deuteromycetes (có quan hệ với ascomycete sợi).
Chín bộ mồi đã được thiết kế để khuếch đại các đoạn DNA có chứa một hoặc nhiều
intron trong các gen bảo tồn. Việc khuếch đại DNA bằng PCR với chín bộ mồi này
kết h...
Hoạt động Kháng khuẩn của Hạt Bạc Nanoscale có Phụ thuộc vào Hình Dạng Của Hạt Không? Nghiên Cứu Vi Khuẩn Gram âm Escherichia coli Dịch bởi AI
Tập 73 Số 6 - Trang 1712-1720 - 2007
TÓM TẮT Trong nghiên cứu này, chúng tôi đã điều tra các đặc tính kháng khuẩn của
các hạt nano bạc có hình dạng khác nhau chống lại vi khuẩn gram âm Escherichia
coli , cả trong hệ thống lỏng và trên đĩa thạch. Hình ảnh kính hiển vi điện tử
truyền qua lọc năng lượng cho thấy sự thay đổi đáng kể trong màng tế bào sau khi
xử lý, dẫn đến cái chết của tế bào. Các tấm nanobạc tam giác cụt với mặt phẳng
m...
#Kháng khuẩn #hạt nano bạc #Escherichia coli #vi khuẩn gram âm #hình dạng hạt #kính hiển vi điện tử truyền qua lọc năng lượng #mặt phẳng {111}.