Phát triển các bộ mồi được thiết kế để sử dụng với PCR nhằm khuếch đại các gen bảo tồn từ nấm xử lý sợi (filamentous ascomycetes)
Tóm tắt
Chúng tôi đã xây dựng chín bộ mồi oligonucleotide dựa trên kết quả lai DNA của các gen đã nhân bản từ Neurospora crassa và Aspergillus nidulans với các hệ gen của một số ascomycetes sợi và deuteromycetes (có quan hệ với ascomycete sợi). Chín bộ mồi đã được thiết kế để khuếch đại các đoạn DNA có chứa một hoặc nhiều intron trong các gen bảo tồn. Việc khuếch đại DNA bằng PCR với chín bộ mồi này kết hợp với DNA toàn thể từ các ascomycetes, deuteromycetes, basidiomycetes và thực vật đã cho thấy rằng năm trong số các bộ mồi này chỉ khuếch đại sản phẩm từ DNA của các ascomycetes sợi và deuteromycetes. Năm bộ mồi này được xây dựng từ các gen của N. crassa cho histone 3, histone 4, beta-tubulin và ATPase màng plasma. Với năm bộ mồi này, đã quan sát thấy các biến thể ở cả kích thước và vị trí enzyme giới hạn trong các sản phẩm khuếch đại từ các ascomycetes sợi. Các bộ mồi được mô tả ở đây có thể cung cấp các công cụ hữu ích cho các nghiên cứu phát sinh loài và phân tích hệ gen trong các ascomycetes sợi và deuteromycetes (có quan hệ với ascomycete), cũng như cho việc phân biệt nhanh chóng các loài nấm bằng PCR.