Proteins: Structure, Function and Bioinformatics
Công bố khoa học tiêu biểu
* Dữ liệu chỉ mang tính chất tham khảo
Sắp xếp:
Bảng chữ cái cấu trúc cho các cấu trúc protein cục bộ: Các phương pháp dự đoán cải tiến Dịch bởi AI Tóm tắt Các cấu trúc protein ba chiều có thể được mô tả bằng một thư viện các mảnh 3D xác định một bảng chữ cái cấu trúc. Chúng tôi đã từng đề xuất một bảng chữ cái như vậy, bao gồm 16 mẫu của năm axit amin liên tiếp, được gọi là Protein Blocks (PBs). Các PB này đã được sử dụng để mô tả các xương sống protein và để dự đoán các cấu trúc cục bộ từ các trình tự protein... ... hiện toàn bộ
Proteins: Structure, Function and Bioinformatics - Tập 59 Số 4 - Trang 810-827 - 2005
Xếp chồng một cơ sở dữ liệu các lõi protein Dịch bởi AI Tóm tắt Chúng tôi trình bày một phân tích về 10 dự đoán mù được chuẩn bị cho một hội nghị gần đây, “Đánh giá cơ bản các kỹ thuật dự đoán cấu trúc protein.”1 Các chuỗi của những protein này không có sự tương đồng dễ phát hiện với bất kỳ protein nào trong cơ sở dữ liệu cấu trúc khi đó còn tồn tại, nhưng chúng tôi đã cố gắng sử dụng phương pháp xếp... ... hiện toàn bộ
Proteins: Structure, Function and Bioinformatics - Tập 23 Số 3 - Trang 356-369 - 1995
Dự đoán và xác định nhanh các giá trị pKa cho các phức hợp protein–ligand Dịch bởi AI Tóm tắt Phương pháp PROPKA để dự đoán các giá trị pK a của các dư lượng có khả năng ion hóa trong protein đã được mở rộng để bao gồm ảnh hưởng của các ligand không phải protein đối với các giá trị pK a của protein cũng như dự đoán sự thay đổi của các giá trị pK... ... hiện toàn bộ
Proteins: Structure, Function and Bioinformatics - Tập 73 Số 3 - Trang 765-783 - 2008
Phương pháp mô hình hóa so sánh: Ứng dụng cho họ các protease serine ở động vật có vú Dịch bởi AI Tóm tắt Các phương pháp mô hình hóa so sánh được mô tả có thể được sử dụng để xây dựng một cấu trúc mô hình ba chiều của một protein mới từ kiến thức về trình tự gen của nó và cấu trúc thực nghiệm cũng như trình tự của các thành viên khác trong gia đình đồng hóa của nó. Các phương pháp này được minh họa với họ protease serine ở động vật có vú, cho đến nay đã có bảy ... ... hiện toàn bộ
Proteins: Structure, Function and Bioinformatics - Tập 7 Số 4 - Trang 317-334 - 1990
Đánh giá mô hình đồng hình của Protease HIV Dịch bởi AI Tóm tắt Mô hình protease của virus gây suy giảm miễn dịch ở người (HIV-1) dựa trên cấu trúc tinh thể của protease virus Rous sarcoma (RSV) đã được so sánh với cấu trúc tinh thể gần đây được xác định của protease HIV-1 tổng hợp hóa học. Sự khác biệt tổng thể giữa mô hình và cấu trúc tinh thể là 1,4 Å độ lệch bình phương (rms) cho 86 nguyên tử Cα được chồng lên nhau. ... ... hiện toàn bộ
Proteins: Structure, Function and Bioinformatics - Tập 7 Số 2 - Trang 172-184 - 1990
Dự đoán cấu trúc protein đồng sinh dựa trên tìm kiếm cấu hình và năng lượng Dịch bởi AI Tóm tắt Một phương pháp “dựa trên tri thức” để dự đoán cấu trúc chưa biết của một protein từ cấu trúc biết trước đồng sinh sử dụng năng lượng để xác định hình dạng bên của chuỗi được đề xuất. Phương pháp này bao gồm việc hoán đổi các dư lượng trong cấu trúc đã biết cho chuỗi của protein chưa biết. Sau đó, một tìm kiếm hình dạng với sự tối thiểu hóa năng lượng cơ học... ... hiện toàn bộ
Proteins: Structure, Function and Bioinformatics - Tập 8 Số 1 - Trang 30-43 - 1990
HERA—Một chương trình vẽ sơ đồ cấu trúc thứ cấp của protein Dịch bởi AI Tóm tắt Chương trình được mô tả ở đây cho phép tạo ra các sơ đồ liên kết hydro của cấu trúc protein và tùy chọn vẽ vòng xoắn cũng như lưới xoắn. Chương trình cũng có thể được sử dụng đơn giản để tính toán các kết nối của các sợi β và tự động trích xuất các mô hình cấu trúc đơn giản như kẹp tóc hay chìa khóa Hy Lạp. Chương trình giúp giảm thiểu đáng kể nỗ lực cần thi... ... hiện toàn bộ
Proteins: Structure, Function and Bioinformatics - Tập 8 Số 3 - Trang 203-212 - 1990
Cơ sở dữ liệu các cấu trúc protein được suy diễn từ tính đồng cấu và ý nghĩa cấu trúc của việc căn chỉnh trình tự Dịch bởi AI Tóm tắt Cơ sở dữ liệu các cấu trúc ba chiều protein đã biết có thể được mở rộng đáng kể nhờ vào việc sử dụng tính đồng cấu trình tự, dựa trên những quan sát sau. (1) Cơ sở dữ liệu các trình tự đã biết, hiện có hơn 12.000 protein, lớn hơn hai bậc so với cơ sở dữ liệu các cấu trúc đã biết. (2) Phương pháp hiện tại mạnh nhất để dự đoán cấu trúc protein là xây dựng mô h... ... hiện toàn bộ
Proteins: Structure, Function and Bioinformatics - Tập 9 Số 1 - Trang 56-68 - 1991
Tính chất kỵ nước của các nhóm amino acid trong protein Dịch bởi AI Tóm tắt Các nghiên cứu về gập protein thường sử dụng diện tích và thể tích để đánh giá đóng góp kỵ nước vào năng lượng tự do cấu hình (Richards, F. M. Annu. Rev. Biophys. Bioeng. 6:151–176, 1977). Chúng tôi đã tính toán diện tích trung bình bị chôn vùi khi gập lại cho từng nhóm hóa học trong mỗi dư lượng của một tập hợp các protein được giải mã bằng tia X. Các phép ... ... hiện toàn bộ
Proteins: Structure, Function and Bioinformatics - Tập 8 Số 1 - Trang 6-13 - 1990
#chất kỵ nước #gập protein #diện tích chôn vùi #cấu trúc protein #nhóm hóa học
Mối tương quan yếu giữa khả năng dự đoán của các kiểu trình tự riêng lẻ và độ chính xác dự đoán tổng thể trong protein Dịch bởi AI Tóm tắt Các mẫu về tính chất axit amin (cực, kỵ nước, v.v.) đặc trưng cho các mô hình cấu trúc bậc hai được rút ra từ một cơ sở dữ liệu chứa 75 cấu trúc protein, với mục tiêu vượt qua các hạn chế do kích thước cơ sở dữ liệu gây ra nhằm tăng điểm dự đoán cấu trúc. Nhiều liên kết trình tự-cấu trúc như vậy có sức mạnh dự đoán nội tại cao được tìm thấy, và đúng 78% tron... ... hiện toàn bộ
Proteins: Structure, Function and Bioinformatics - Tập 9 Số 1 - Trang 69-78 - 1991
Tổng số: 161
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 10