Medicine (miscellaneous)Pharmacology, Toxicology and Pharmaceutics (miscellaneous)Biochemistry, Genetics and Molecular Biology (miscellaneous)Immunology and Microbiology (miscellaneous)
Charlotte Soneson, Michael I. Love, Mark D. Robinson
Phân tích RNA-seq trong các nghiên cứu transcriptome được sử dụng rộng rãi để
đặc trưng hóa bản sao của tế bào. Nhiều nghiên cứu transcriptomic nhằm mục đích
so sánh các mức độ phong phú hoặc thành phần transcriptome giữa các điều kiện
nhất định, và bước đầu tiên là sử dụng các đọc sequencer như cơ sở cho việc đo
lường độ phong phú của các đặc điểm transcriptome có liên quan, chẳng hạn như
gen hoặ... hiện toàn bộ
Phân tích trình tự DNA thường liên quan đến việc lập bản đồ các đọc (reads) tới
chỉ một bộ gen tham chiếu. Tuy nhiên, việc lập bản đồ tới nhiều bộ gen là cần
thiết khi bộ gen nguồn cần được xác nhận. Việc lập bản đồ tới nhiều bộ gen cũng
được khuyến nghị để phát hiện ô nhiễm hoặc nhận diện sự hoán đổi mẫu, điều này
nếu không được phát hiện có thể dẫn đến những kết luận thí nghiệm sai lầm. Do
đó, c... hiện toàn bộ
Felix Mölder, Kim Philipp Jablonski, Brice Letcher, Michael B. Hall, Christopher H. Tomkins-Tinch, Vanessa Sochat, Jan Förster, Soohyun Lee, Sven Twardziok, Alexander Kanitz, Andreas Wilm, Manuel Holtgrewe, Sven Rahmann, Sven Nahnsen, Johannes Köster
Phân tích dữ liệu thường bao gồm nhiều bước không đồng nhất, từ việc áp dụng các
công cụ dòng lệnh khác nhau đến việc sử dụng các ngôn ngữ kịch bản như R hoặc
Python để tạo ra các biểu đồ và bảng. Điều này được công nhận rộng rãi rằng phân
tích dữ liệu lý tưởng nên được thực hiện theo cách có thể tái lập. Tính tái lập
cho phép xác thực kỹ thuật và tái tạo kết quả trên dữ liệu gốc hoặc thậm chí
trê... hiện toàn bộ
Bệnh Alzheimer là nguyên nhân phổ biến nhất gây ra chứng mất trí nhớ trên toàn
thế giới, với tỷ lệ mắc bệnh tiếp tục gia tăng một phần do dân số thế giới đang
già đi. Quá trình bệnh lý thoái hóa thần kinh này được đặc trưng theo cách cổ
điển bởi hai bệnh lý điển hình: sự lắng đọng của mảng β-amyloid và các đám rối
sợi thần kinh của tau phosphoryl hóa quá mức. Chẩn đoán dựa trên việc xuất hiện
lâm ... hiện toàn bộ
#bệnh Alzheimer #chứng mất trí nhớ #bệnh lý thần kinh #chẩn đoán #điều trị #nghiên cứu lâm sàng
Chúng tôi giới thiệu phiên bản ứng dụng Cytoscape của công cụ suy diễn mạng lưới
liên kết của chúng tôi, CoNet. Mặc dù CoNet được phát triển với dữ liệu cộng
đồng vi sinh vật từ các thí nghiệm giải trình tự trong tâm trí, nhưng nó được
thiết kế để có tính tổng quát và có thể phát hiện các liên kết trong bất kỳ tập
dữ liệu nào mà trong đó các thực thể sinh học (như gen, metabolite hoặc loài) đã
đượ... hiện toàn bộ
Tính toán diện tích bề mặt có thể tiếp xúc với dung môi (SASA) là một phép tính
phổ biến trong sinh học cấu trúc. Mặc dù có nhiều chương trình có sẵn cho phép
tính này, nhưng không có công cụ mã nguồn mở độc lập nào được thiết kế cho việc
tích hợp dễ dàng vào chuỗi công cụ. FreeSASA là một thư viện C mã nguồn mở cho
các phép tính SASA, cung cấp cả giao diện dòng lệnh và Python bên cạnh API C của
n... hiện toàn bộ
David Papadopoli, Karine Boulay, Lawrence Kazak, Michaël Pollak, Frédérick A. Mallette, Ivan Topisirović, Laura Hulea
Yếu tố mục tiêu của rapamycin (mTOR) ở động vật có vú là một thành phần quan
trọng của chuyển hóa tế bào, tích hợp khả năng cảm nhận dinh dưỡng với các quá
trình tế bào thúc đẩy sự phát triển và nhân lên của tế bào. Mặc dù sự tham gia
của con đường mTOR trong việc điều hòa tuổi thọ và lão hóa đã được nghiên cứu
một cách sâu rộng trong thập kỷ qua, nhưng cơ chế nền tảng vẫn còn mơ hồ. Trong
bài tổn... hiện toàn bộ
U nội mạc tử cung là một rối loạn lành tính của tử cung, trong đó các tuyến và
mô đệm nội mạc được chứng minh bệnh lý trong cơ tử cung. Đây được coi là một
thực thể cụ thể trong phân loại PALM-COEIN FIGO (polyp; u nội mạc tử cung; u xơ
tử cung; ung thư và tăng sinh; rối loạn đông máu; rối loạn rụng trứng; nội mạc
tử cung; do y học; và chưa được phân loại – Liên đoàn Quốc tế về Sản phụ khoa và
Sản ... hiện toàn bộ
Một dòng Escherichia coli gây bệnh ngoài ruột (ExPEC) có tên là kiểu trình tự
(ST) 131, chịu trách nhiệm cho hàng triệu ca nhiễm kháng sinh toàn cầu mỗi năm.
Sinh thái quần thể chỉ ra rằng ST131 bao gồm các nhánh khác nhau (tức là A, B và
C); tuy nhiên, nhánh C hiện đang chiếm ưu thế nhất toàn cầu. Một nhánh phụ của
ST131, được gọi là C1-M27, đang nổi lên ở Nhật Bản và chịu trách nhiệm cho sự
gia ... hiện toàn bộ
Charity W. Law, Monther Alhamdoosh, Shian Su, Gordon K. Smyth, Matthew E. Ritchie
Khả năng phân tích dữ liệu RNA-sequencing một cách dễ dàng và hiệu quả là một
điểm mạnh chính của dự án Bioconductor. Bắt đầu với số liệu được tổng hợp ở cấp
độ gene, một phân tích điển hình bao gồm xử lý trước, phân tích dữ liệu khám
phá, thử nghiệm biểu hiện khác biệt và phân tích lộ trình, với các kết quả thu
được sẽ thông báo cho các thí nghiệm và nghiên cứu xác thực trong tương lai.
Trong bài... hiện toàn bộ