F1000Research

Công bố khoa học tiêu biểu

* Dữ liệu chỉ mang tính chất tham khảo

Sắp xếp:  
Altered functional connectivity in posttraumatic stress disorder with versus without comorbid major depressive disorder: a resting state fMRI study
F1000Research - Tập 2 - Trang 289
Mitzy Kennis, Arthur R. Rademaker, Sanne J.H. van Rooij, René S. Kahn, Elbert Geuze
Posttraumatic stress disorder (PTSD) is an anxiety disorder that is often diagnosed with comorbid depressive disorder. Therefore, neuroimaging studies investigating PTSD typically include both patients with and without comorbid depression. Differences in activity of the anterior cingulate cortex (ACC) and insula have been shown to differentiate PTSD patients with and without major depressive disor... hiện toàn bộ
DRIMSeq: a Dirichlet-multinomial framework for multivariate count outcomes in genomics
F1000Research - Tập 5 - Trang 1356
Małgorzata Nowicka, Mark D. Robinson
There are many instances in genomics data analyses where measurements are made on a multivariate response. For example, alternative splicing can lead to multiple expressed isoforms from the same primary transcript. There are situations where differences (e.g. between normal and disease state) in the relative ratio of expressed isoforms may have significant phenotypic consequences or lead to progno... hiện toàn bộ
microbiomeDASim: Simulating longitudinal differential abundance for microbiome data
F1000Research - Tập 8 - Trang 1769
Justin Williams, Héctor Corrada Bravo, Jennifer Tom, Joseph N. Paulson
An increasing emphasis on understanding the dynamics of microbial communities in various settings has led to the proliferation of longitudinal metagenomic sampling studies. Data from whole metagenomic shotgun sequencing and marker-gene survey studies have characteristics that drive novel statistical methodological development for estimating time intervals of differential abundance. In designing a ... hiện toàn bộ
High-Performance Mixed Models Based Genome-Wide Association Analysis with omicABEL software
F1000Research - Tập 3 - Trang 200
Diego Fabregat‐Traver, Sodbo Sharapov, Caroline Hayward, Igor Rudan, Harry Campbell, Yurii S. Aulchenko, Paolo Bientinesi
To raise the power of genome-wide association studies (GWAS) and avoid false-positive results in structured populations, one can rely on mixed model based tests. When large samples are used, and when multiple traits are to be studied in the ’omics’ context, this approach becomes computationally challenging. Here we consider the problem of mixed-model based GWAS for arbitrary number of traits, and ... hiện toàn bộ
KEGGscape: a Cytoscape app for pathway data integration
F1000Research - Tập 3 - Trang 144
Kozo Nishida, Keiichiro Ono, Shigehiko Kanaya, Koichi Takahashi
In this paper, we present KEGGscape a pathway data integration and visualization app for Cytoscape (http://apps.cytoscape.org/apps/keggscape). KEGG is a comprehensive public biological database that contains large collection of human curated pathways. KEGGscape utilizes the database to reproduce the corresponding hand-drawn pathway diagrams with as much detail as possible in Cytoscape. Further, it... hiện toàn bộ
The biological significance of brain barrier mechanisms: help or hindrance in drug delivery to the central nervous system?
F1000Research - Tập 5 - Trang 313
Norman Saunders, Mark D. Habgood, Kjeld Møllgård, Katarzyna M. Dzięgielewska
Barrier mechanisms in the brain are important for its normal functioning and development. Stability of the brain’s internal environment, particularly with respect to its ionic composition, is a prerequisite for the fundamental basis of its function, namely transmission of nerve impulses. In addition, the appropriate and controlled supply of a wide range of nutrients such as glucose, amino acids, m... hiện toàn bộ
A reanalysis of mouse ENCODE comparative gene expression data
F1000Research - Tập 4 - Trang 121
Yoav Gilad, Orna Mizrahi-Man
Recently, the Mouse ENCODE Consortium reported that comparative gene expression data from human and mouse tend to cluster more by species rather than by tissue. This observation was surprising, as it contradicted much of the comparative gene regulatory data collected previously, as well as the common notion that major developmental pathways are highly conserved across a wide range of species, in p... hiện toàn bộ
Mortality risk factors among National Football League players: An analysis using player career data
F1000Research - Tập 8 - Trang 2022
Justin Ehrlich, Brittany Kmush, Bhavneet Walia, Shane Sanders
In general, National Football League (NFL) players tend to live longer than the general population. However, little information exists about the long-term mortality risk in this population. Frequent, yet mild, head trauma may be associated with early mortality in this group of elite athletes. Therefore, career playing statistics can be used as a proxy for frequent head trauma. Using data from Pro ... hiện toàn bộ
Xử lý proteolytic của đơn vị alpha11.2 kênh Ca2+ loại L trong tế bào thần kinh Dịch bởi AI
F1000Research - Tập 6 - Trang 1166
Olivia R. Buonarati, Peter B. Henderson, Geoffrey G. Murphy, Mary C. Horne, Johannes Hell
Bối cảnh: Kênh Ca2+ loại L Cav1.2 là một yếu tố điều chỉnh nổi bật trong tính kích thích của tế bào thần kinh, tính dẻo của synap và biểu hiện gen. Yếu tố trung tâm của Cav1.2 là đơn vị α11.2 tạo lỗ. Đơn vị này tồn tại dưới hai dạng kích thước chính, mà khối lượng phân tử của chúng đã được chứng minh là khó xác định chính xác. Công trình nghiên cứu gần đây gợi ý rằng α11.2 bị cắt đứt proteolytic ở... hiện toàn bộ
Phân tích dữ liệu bền vững với Snakemake Dịch bởi AI
F1000Research - Tập 10 - Trang 33
Felix Mölder, Kim Philipp Jablonski, Brice Letcher, Michael B. Hall, Christopher H. Tomkins-Tinch, Vanessa Sochat, Jan Förster, Soohyun Lee, Sven Twardziok, Alexander Kanitz, Andreas Wilm, Manuel Holtgrewe, Sven Rahmann, Sven Nahnsen, Johannes Köster
Phân tích dữ liệu thường bao gồm nhiều bước không đồng nhất, từ việc áp dụng các công cụ dòng lệnh khác nhau đến việc sử dụng các ngôn ngữ kịch bản như R hoặc Python để tạo ra các biểu đồ và bảng. Điều này được công nhận rộng rãi rằng phân tích dữ liệu lý tưởng nên được thực hiện theo cách có thể tái lập. Tính tái lập cho phép xác thực kỹ thuật và tái tạo kết quả trên dữ liệu gốc hoặc thậm chí trê... hiện toàn bộ
Tổng số: 42   
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5