Khám phá các mẫu đồng tác giả trong khoa học xã hội của Việt Nam với các chỉ số mạng cơ bản từ dữ liệu Scopus 2008-2017. Dịch bởi AI F1000Research - Tập 6 - Trang 1559 - 2017
Tung Manh Ho, Ha Viet Nguyen, Thu-Trang Vuong, Quang-Minh Dam, Hiep-Hung Pham, Quan-Hoang Vuong
Bối cảnh: Hợp tác là một hiện tượng phổ biến trong giới khoa học Việt Nam; tuy
nhiên, những hiểu biết về sự hợp tác khoa học của Việt Nam vẫn còn hạn chế. Mặt
khác, việc áp dụng phân tích mạng xã hội trong nghiên cứu hợp tác khoa học đã
thu hút được nhiều sự chú ý trên toàn thế giới. Kỹ thuật này có thể được sử dụng
để khám phá cộng đồng khoa học Việt Nam. Phương pháp: Bài báo này sử dụng lý
thuyế... hiện toàn bộ
#Social network analysis #network characteristics #network visualization #research output. #science collaboration
DRIMSeq: a Dirichlet-multinomial framework for multivariate count outcomes in genomicsF1000Research - Tập 5 - Trang 1356
Małgorzata Nowicka, Mark D. Robinson
There are many instances in genomics data analyses where measurements are made
on a multivariate response. For example, alternative splicing can lead to
multiple expressed isoforms from the same primary transcript. There are
situations where differences (e.g. between normal and disease state) in the
relative ratio of expressed isoforms may have significant phenotypic
consequences or lead to progno... hiện toàn bộ
microbiomeDASim: Simulating longitudinal differential abundance for microbiome dataF1000Research - Tập 8 - Trang 1769
Justin Williams, Héctor Corrada Bravo, Jennifer Tom, Joseph N. Paulson
An increasing emphasis on understanding the dynamics of microbial communities in
various settings has led to the proliferation of longitudinal metagenomic
sampling studies. Data from whole metagenomic shotgun sequencing and marker-gene
survey studies have characteristics that drive novel statistical methodological
development for estimating time intervals of differential abundance. In
designing a ... hiện toàn bộ
High-Performance Mixed Models Based Genome-Wide Association Analysis with omicABEL softwareF1000Research - Tập 3 - Trang 200
Diego Fabregat‐Traver, Sodbo Sharapov, Caroline Hayward, Igor Rudan, Harry Campbell, Yurii S. Aulchenko, Paolo Bientinesi
To raise the power of genome-wide association studies (GWAS) and avoid
false-positive results in structured populations, one can rely on mixed model
based tests. When large samples are used, and when multiple traits are to be
studied in the ’omics’ context, this approach becomes computationally
challenging. Here we consider the problem of mixed-model based GWAS for
arbitrary number of traits, and ... hiện toàn bộ
KEGGscape: a Cytoscape app for pathway data integrationF1000Research - Tập 3 - Trang 144
Kozo Nishida, Keiichiro Ono, Shigehiko Kanaya, Koichi Takahashi
In this paper, we present KEGGscape a pathway data integration and visualization
app for Cytoscape (http://apps.cytoscape.org/apps/keggscape). KEGG is a
comprehensive public biological database that contains large collection of human
curated pathways. KEGGscape utilizes the database to reproduce the corresponding
hand-drawn pathway diagrams with as much detail as possible in Cytoscape.
Further, it... hiện toàn bộ
The biological significance of brain barrier mechanisms: help or hindrance in drug delivery to the central nervous system?F1000Research - Tập 5 - Trang 313
Norman Saunders, Mark D. Habgood, Kjeld Møllgård, Katarzyna M. Dzięgielewska
Barrier mechanisms in the brain are important for its normal functioning and
development. Stability of the brain’s internal environment, particularly with
respect to its ionic composition, is a prerequisite for the fundamental basis of
its function, namely transmission of nerve impulses. In addition, the
appropriate and controlled supply of a wide range of nutrients such as glucose,
amino acids, m... hiện toàn bộ
A reanalysis of mouse ENCODE comparative gene expression dataF1000Research - Tập 4 - Trang 121
Yoav Gilad, Orna Mizrahi-Man
Recently, the Mouse ENCODE Consortium reported that comparative gene expression
data from human and mouse tend to cluster more by species rather than by tissue.
This observation was surprising, as it contradicted much of the comparative gene
regulatory data collected previously, as well as the common notion that major
developmental pathways are highly conserved across a wide range of species, in
p... hiện toàn bộ
Mortality risk factors among National Football League players: An analysis using player career dataF1000Research - Tập 8 - Trang 2022
Justin Ehrlich, Brittany Kmush, Bhavneet Walia, Shane Sanders
In general, National Football League (NFL) players tend to live longer than the
general population. However, little information exists about the long-term
mortality risk in this population. Frequent, yet mild, head trauma may be
associated with early mortality in this group of elite athletes. Therefore,
career playing statistics can be used as a proxy for frequent head trauma. Using
data from Pro ... hiện toàn bộ
Xử lý proteolytic của đơn vị alpha11.2 kênh Ca2+ loại L trong tế bào thần kinh Dịch bởi AI F1000Research - Tập 6 - Trang 1166
Olivia R. Buonarati, Peter B. Henderson, Geoffrey G. Murphy, Mary C. Horne, Johannes Hell
Bối cảnh: Kênh Ca2+ loại L Cav1.2 là một yếu tố điều chỉnh nổi bật trong tính
kích thích của tế bào thần kinh, tính dẻo của synap và biểu hiện gen. Yếu tố
trung tâm của Cav1.2 là đơn vị α11.2 tạo lỗ. Đơn vị này tồn tại dưới hai dạng
kích thước chính, mà khối lượng phân tử của chúng đã được chứng minh là khó xác
định chính xác. Công trình nghiên cứu gần đây gợi ý rằng α11.2 bị cắt đứt
proteolytic ở... hiện toàn bộ