Springer Science and Business Media LLC

Bằng cách sử dụng dữ liệu trình tự toàn bộ gen, chúng tôi đã nhằm mục đích mô tả một bức tranh dân số của Klebsiella pneumoniae sản xuất carbapenemase được phân lập từ bệnh nhân nội trú tại Đức trong khoảng thời gian từ 2008 đến 2014.

Chúng tôi đã chọn một nhóm đại diện gồm 107 chủng Klebsiella pneumoniae lâm sàng sản xuất carbapenemase sở hữu bốn loại carbapenemase phổ biến nhất ở Đức (KPC-2, KPC-3, OXA-48, NDM-1). Các mẫu được xử lý qua công nghệ giải trình tự NGS của illumina. Dữ liệu được phân tích bằng nhiều phương pháp lập bản đồ dựa trên SNP và lắp ghép de-novo. Những thông tin liên quan đã được trích xuất từ dữ liệu NGS (các yếu tố kháng kháng sinh, gen wzi/ kiểu cps, các gen độc lực). Dữ liệu NGS từ nghiên cứu này cũng được so sánh với 238 dữ liệu gen từ hai nghiên cứu quốc tế trước đây về Klebsiella pneumoniae.

Phân tích dựa trên NGS cho thấy sự phổ biến của các chủng ST258 sản xuất KPC-2 và các chủng ST512 sản xuất KPC-3. OXA-48, là loại carbapenemase phổ biến nhất ở Đức, đã được liên kết với nhiều kiểu chủng Klebsiella pneumoniae khác nhau; hầu hết trong số đó có các bản sao plasmid IncL/M cho thấy sự lan truyền ưa thích của bla_OXA-48 thông qua loại plasmid nổi tiếng này. Các cụm ST15, ST147, ST258 và ST512 cho thấy một cấu trúc tập hợp lồng ghép gồm các chủng Klebsiella pneumoniae tại Đức và các nước Châu Âu khác. ST23, loại MLST phổ biến nhất ở Châu Á, chỉ được tìm thấy một lần duy nhất tại Đức. Chủng này chứa một bộ gen độc lực gần như hoàn chỉnh và một vỏ K1 cho thấy sự hiện diện của một chủng ST23 hypervirulent sản xuất OXA-48 tại Đức.

Kết quả nghiên cứu của chúng tôi cho thấy sự phổ biến của các kiểu chủng “cổ điển” Klebsiella pneumoniae liên quan đến các gen carbapenemase được phân phối rộng rãi như ST258/KPC-2 hoặc ST512/KPC-3 cũng ở Đức. Phát hiện về một chủng ST23 được cho là hypervirulent và sản xuất OXA-48 ngoài Châu Á là điều rất đáng lo ngại và yêu cầu phải có sự giám sát phân tử chặt chẽ.

Đại trà sử dụng kháng sinh rất phổ biến trong cộng đồng và trong bệnh viện, với tỷ lệ đáng kể việc sử dụng có thể không thích hợp. Việc lạm dụng kháng sinh làm gia tăng nguy cơ độc tính, tăng chi phí chăm sóc sức khỏe và sự chọn lọc tình trạng kháng thuốc. Mục tiêu chính của đánh giá hệ thống này là tóm tắt tình trạng hiện tại của bằng chứng về việc thực hiện và kết quả của các chương trình quản lý kháng sinh (ASP) cho trẻ em trên toàn cầu.

Các cơ sở dữ liệu MEDLINE, Embase và Thư viện Cochrane đã được tìm kiếm một cách có hệ thống để xác định các nghiên cứu báo cáo về ASP ở trẻ em từ 0-18 tuổi và được thực hiện trong các thiết lập ngoại trú hoặc nội trú. Ba nhà nghiên cứu đã độc lập xem xét các bài báo đã xác định để đưa vào và rút trích dữ liệu liên quan.

Từ 41,916 nghiên cứu được sàng lọc, 113 nghiên cứu đủ điều kiện đưa vào nghiên cứu này. Phần lớn các nghiên cứu có nguồn gốc từ Hoa Kỳ (52.2%), trong khi một số ít được thực hiện ở châu Âu (24.7%) hoặc châu Á (17.7%). Bảy mươi bốn (65.5%) nghiên cứu sử dụng thiết kế trước và sau, và mười sáu (14.1%) là thử nghiệm ngẫu nhiên. Phần lớn (81.4%) mô tả các ASP trong bệnh viện với một nửa các can thiệp ở các khoa nhi hỗn hợp và mười (8.8%) ở phòng cấp cứu. Chỉ có mười sáu (14.1%) nghiên cứu tập trung vào chi phí của các ASP. Gần như tất cả các nghiên cứu (79.6%) cho thấy sự giảm đáng kể trong các đơn thuốc không phù hợp. Độ tuân thủ sau khi thực hiện ASP đã gia tăng. Mười sáu trong số các nghiên cứu được đưa vào đã định lượng lượng tiết kiệm chi phí liên quan đến can thiệp với hầu hết các mức giảm là do tần suất sử dụng thuốc thấp hơn. Bảy nghiên cứu cho thấy độ nhạy cảm gia tăng của vi khuẩn được phân tích với sự giảm trong các nhà sản xuất beta-lactamase phổ rộng E. colivà K. pneumoniae;giảm trong tỷ lệ kháng carbapenem của P. aeruginosađược quan sát sau khi tỷ lệ ngày dùng kháng sinh giảm; và, trong hai nghiên cứu ở thiết lập ngoại trú, sự gia tăng của S. pyogenesnhạy cảm với erythromycin theo sau sự giảm trong việc sử dụng macrolides.

Các ASP cho trẻ em có tác động đáng kể đến việc giảm sử dụng kháng sinh mục tiêu và thực nghiệm, chi phí chăm sóc sức khỏe, và tình trạng kháng kháng sinh trong cả môi trường nội trú và ngoại trú. Các ASP cho trẻ em hiện đã được triển khai rộng rãi tại Hoa Kỳ, nhưng cần rất nhiều sự điều chỉnh hơn nữa để tạo điều kiện cho việc áp dụng của chúng ở châu Âu, châu Á, châu Mỹ La-tinh và châu Phi.