Phát hiện số cụm cá thể bằng phần mềm structure: một nghiên cứu mô phỏng Dịch bởi AI Tập 14 Số 8 - Trang 2611-2620 - 2005
Guillaume Evanno, Sébastien Regnaut, Jérôme Goudet
Tóm tắtViệc xác định các nhóm cá thể đồng nhất về di truyền là một vấn đề lâu
dài trong di truyền học quần thể. Một thuật toán Bayesian gần đây được triển
khai trong phần mềm structure cho phép phát hiện các nhóm như vậy. Tuy nhiên,
khả năng của thuật toán này để xác định số lượng cụm thực sự (K) trong một mẫu
cá thể khi các mô hình phân tán giữa các quần thể không đồng nhất chưa được kiểm
tra. Mụ... hiện toàn bộ
#genetically homogeneous groups #Bayesian algorithm #population genetics #structure software #simulation study #dispersal scenarios #hierarchical structure #genetic markers #AFLP #microsatellite #population samples
ITS primers with enhanced specificity for basidiomycetes ‐ application to the identification of mycorrhizae and rusts Tập 2 Số 2 - Trang 113-118 - 1993
Monique Gardes, Thomas D. Bruns
AbstractWe have designed two taxon‐selective primers for the internal
transcribed spacer (ITS) region in the nuclear ribosomal repeat unit. These
primers, ITS1‐F and ITS4‐B, were intended to be specific to fungi and
basidiomycetes, respectively. We have tested the specificity of these primers
against 13 species of ascomycetes, 14 of basidiomycetes, and 15 of plants. Our
results showed that ITS4‐B,... hiện toàn bộ
Revising how the computer program cervus accommodates genotyping error increases success in paternity assignment Tập 16 Số 5 - Trang 1099-1106 - 2007
Steven T. Kalinowski, Mark L. Taper, Tristan Marshall
AbstractGenotypes are frequently used to identify parentage. Such analysis is
notoriously vulnerable to genotyping error, and there is ongoing debate
regarding how to solve this problem. Many scientists have used the computer
program cervus to estimate parentage, and have taken advantage of its option to
allow for genotyping error. In this study, we show that the likelihood equations
used by versi... hiện toàn bộ
Statistical confidence for likelihood‐based paternity inference in natural populations Tập 7 Số 5 - Trang 639-655 - 1998
Tristan Marshall, Jon Slate, Loeske E. B. Kruuk, J. M. Pemberton
Paternity inference using highly polymorphic codominant markers is becoming
common in the study of natural populations. However, multiple males are often
found to be genetically compatible with each offspring tested, even when the
probability of excluding an unrelated male is high. While various methods exist
for evaluating the likelihood of paternity of each nonexcluded male,
interpreting these l... hiện toàn bộ
Comparative phylogeography and postglacial colonization routes in Europe Tập 7 Số 4 - Trang 453-464 - 1998
Pierre Taberlet, Luca Fumagalli, ANNE‐GABRIELLE WUST‐SAUCY, Jean‐François Cosson
The Quaternary cold periods in Europe are thought to have heavily influenced the
amount and distribution of intraspecific genetic variation in both animals and
plants. The phylogeographies of 10 taxa, including mammals (Ursus arctos, Sorex
spp., Crocidura suaveolens, Arvicola spp.), amphibians (Triturus spp.),
arthropods (Chorthippus parallelus), and plants (Abies alba, Picea abies, Fagus
sylvatic... hiện toàn bộ
Chiến lược cô lập vi vệ tinh: Một đánh giá Dịch bởi AI Tập 11 Số 1 - Trang 1-16 - 2002
Lorenzo Zane, Luca Bargelloni, Tomaso Patarnello
Tóm tắtTrong vài năm gần đây, vi vệ tinh đã trở thành một trong những dấu ấn
phân tử phổ biến nhất được sử dụng với nhiều ứng dụng trong nhiều lĩnh vực khác
nhau. Độ biến thể cao và sự dễ dàng tương đối trong việc đánh giá là hai đặc
điểm chính khiến vi vệ tinh rất được quan tâm trong nhiều nghiên cứu di truyền.
Nhược điểm chính của vi vệ tinh là chúng cần được cô lập de novo từ các loài
được nghi... hiện toàn bộ
#vi vệ tinh #dấu ấn phân tử #đa dạng di truyền #cô lập <jats:italic>de novo</jats:italic> #nghiên cứu di truyền
A simulated annealing approach to define the genetic structure of populations Tập 11 Số 12 - Trang 2571-2581 - 2002
Isabelle Dupanloup, Stefan Schneider, Laurent Excoffier
AbstractWe present a new approach for defining groups of populations that are
geographically homogeneous and maximally differentiated from each other. As a
by‐product, it also leads to the identification of genetic barriers between
these groups. The method is based on a simulated annealing procedure that aims
to maximize the proportion of total genetic variance due to differences between
groups of... hiện toàn bộ
Comparison of different nuclear DNA markers for estimating intraspecific genetic diversity in plants Tập 13 Số 5 - Trang 1143-1155 - 2004
Hilde Nybom
AbstractA compilation was made of 307 studies using nuclear DNA markers for
evaluating among‐ and within‐population diversity in wild angiosperms and
gymnosperms. Estimates derived by the dominantly inherited markers (RAPD, AFLP,
ISSR) are very similar and may be directly comparable. STMS analysis yields
almost three times higher values for within‐population diversity whereas
among‐population dive... hiện toàn bộ
The role of hybridization in evolution Tập 10 Số 3 - Trang 551-568 - 2001
Nick Barton
AbstractHybridization may influence evolution in a variety of ways. If hybrids
are less fit, the geographical range of ecologically divergent populations may
be limited, and prezygotic reproductive isolation may be reinforced. If some
hybrid genotypes are fitter than one or both parents, at least in some
environments, then hybridization could make a positive contribution. Single
alleles that are a... hiện toàn bộ