Chiến lược cô lập vi vệ tinh: Một đánh giá

Molecular Ecology - Tập 11 Số 1 - Trang 1-16 - 2002
Lorenzo Zane1, Luca Bargelloni1, Tomaso Patarnello2,1
1Dipartimento di Biologia, Università di Padova, Via Ugo Bassi 58/B, 35121 Padova, Italy
2Agripolis/Facoltà di Veterinaria, Università di Padova 35020, Legnaro (Pd), Italy

Tóm tắt

Tóm tắt

Trong vài năm gần đây, vi vệ tinh đã trở thành một trong những dấu ấn phân tử phổ biến nhất được sử dụng với nhiều ứng dụng trong nhiều lĩnh vực khác nhau. Độ biến thể cao và sự dễ dàng tương đối trong việc đánh giá là hai đặc điểm chính khiến vi vệ tinh rất được quan tâm trong nhiều nghiên cứu di truyền. Nhược điểm chính của vi vệ tinh là chúng cần được cô lập de novo từ các loài được nghiên cứu lần đầu tiên. Mục tiêu của bài báo này là đánh giá các phương pháp cô lập vi vệ tinh đa dạng được miêu tả trong tài liệu với mục đích cung cấp hướng dẫn hữu ích trong việc đưa ra lựa chọn thích hợp trong số lượng lớn các lựa chọn hiện có. Ngoài ra, chúng tôi đề xuất một giao thức nhanh chóng và dễ dàng, kết hợp từ các phương pháp được công bố khác nhau.

Từ khóa

#vi vệ tinh #dấu ấn phân tử #đa dạng di truyền #cô lập <jats:italic>de novo</jats:italic> #nghiên cứu di truyền

Tài liệu tham khảo

10.1006/geno.1995.1224

10.1093/hmg/3.4.599

10.1139/f99-271

10.1093/nar/23.18.3802

10.1086/302574

10.1046/j.1365-294X.1997.00242.x

10.1046/j.1365-294X.1999.00655_7.x

10.2144/96205bm04

10.1038/ng1295-360

10.1046/j.1365-294X.1996.00083.x

10.1093/nar/24.21.4369

FitzSimmons NN, 1995, Conservation and dynamics of microsatellite loci over 300 million years of marine turtle evolution, Molecular Biology and Evolution, 12, 432

10.2144/99273st03

Hancock JM, 1999, Microsatellites. Evolution and Applications, 1

10.1016/0169-5347(96)10049-5

10.1073/pnas.91.1.88

10.1093/nar/21.16.3911

Kijas JM, 1994, Enrichment of microsatellites from the citrus genome using biotinylated oligonucleotide sequences bound to streptavidin‐coated magnetic particles, Biotechniques, 16, 656

10.1038/ng0498-338

10.1073/pnas.86.16.6196

10.1093/nar/24.11.2190

Litt M, 1989, A hypervariable microsatellite revealed by in vitro amplification of a dinucleotide repeat within the cardiac muscle actin gene, American Journal of Human Genetics, 44, 397

Liu BH, 1997, Statistical Genomics: Linkage, Mapping and QTL Analysis

Lunt DH, 1999, An efficient method for PCR‐based identification of microsatellite arrays (PIMA), Molecular Ecology, 8, 893

10.1016/0888-7543(91)90448-N

10.1006/geno.1998.5460

10.1073/pnas.89.8.3419

Paetkau D, 1999, Microsatellites obtained using strand extension: An enrichment protocol, Biotechniques, 26, 690, 10.2144/99264st05

Primmer CR, 1996, A wide‐ranging survey of cross‐species amplification in birds, Molecular Ecology, 5, 365, 10.1111/j.1365-294X.1996.tb00327.x

10.1002/elps.1150120205

10.1002/elps.1150180905

10.1093/nar/23.18.3798

10.1098/rspb.1996.0083

10.1038/ng0795-337

Sambrook J, 1989, Molecular Cloning: a Laboratory Manual

10.1038/354063a0

10.1093/nar/20.2.211

10.1126/science.274.5287.540

Scribner KT, 2000, Molecular Methods in Ecology, 235

10.2141/jpsa.33.292

10.1093/nar/17.16.6463

10.1094/PHYTO.1999.89.9.748

TothG GáspariZ JurkaJ(2000)Microsatellites in different eukaryotic genomes: survey and analysis.Genome Research967–981.

10.1002/yea.320090709

10.1111/j.1365-2699.2006.01462.x

Waldbieser GC, 1995, PCR‐based identification of AT‐rich tri and tetranucleotide repeat loci in an enriched plasmid library, Biotechniques, 19, 742

Weber JL, 1989, Abundant class of human DNA polymorphisms which can be typed using the polymerase chain reaction, American Journal of Human Genetics, 44, 388

10.1093/oxfordjournals.molbev.a003814

10.1093/nar/18.22.6531

10.1093/nar/22.15.3257

10.1073/pnas.92.25.11549

Thông tin
Thông tin xuất bản

Molecular Ecology

Tập 11 Số 1

1-16

Thông tin tác giả