ISME Journal
SCIE-ISI SCOPUS (2007-2023)
1751-7362
1751-7370
Anh Quốc
Cơ quản chủ quản: Nature Publishing Group , Springer Nature
Lĩnh vực:
Ecology, Evolution, Behavior and SystematicsMicrobiology
Các bài báo tiêu biểu
Phân tích cộng đồng vi sinh vật với năng suất cực cao trên nền tảng Illumina HiSeq và MiSeq Dịch bởi AI Tóm tắt
Giải trình tự DNA tiếp tục giảm chi phí, với Illumina HiSeq2000 có thể tạo ra tới 600 Gb dữ liệu đọc cặp 100 nucleotide trong một chu kỳ mười ngày. Trong nghiên cứu này, chúng tôi trình bày một giao thức cho việc giải trình tự amplicon cộng đồng trên các nền tảng HiSeq2000 và MiSeq của Illumina, và áp dụng giao thức này để giải trình tự 24 cộ... ... hiện toàn bộ
Tập 6 Số 8 - Trang 1621-1624 - 2012
Một hệ thống phân loại Greengenes cải tiến với các cấp bậc rõ ràng cho các phân tích sinh thái và tiến hóa của vi khuẩn và archaea Dịch bởi AI Tóm tắt
Các hệ thống phân loại tham chiếu là rất quan trọng để cung cấp một khung phân loại cho việc giải thích các khảo sát gene đánh dấu và metagenomic, vốn đang tiếp tục phát hiện ra các loài mới với tốc độ đáng kể. Greengenes là một cơ sở dữ liệu gene 16S rRNA toàn bộ chuyên dụng, cung cấp cho người dùng một hệ thống phân loại được chỉnh sửa dựa ... ... hiện toàn bộ
Tập 6 Số 3 - Trang 610-618 - 2012
Cộng đồng vi sinh vật đất và nấm qua gradient pH trong đất trồng trọt Dịch bởi AI Tóm tắt
Đất được thu thập qua một thí nghiệm đã bón vôi lâu dài (pH 4.0–8.3), trong đó sự biến đổi của các yếu tố khác ngoài pH đã được giảm thiểu, được sử dụng để khảo sát ảnh hưởng trực tiếp của pH lên sự phong phú và thành phần của hai nhóm chính trong vi sinh vật đất: nấm và vi khuẩn. Chúng tôi giả thuyết rằng các cộng đồng vi khuẩn sẽ bị ảnh hư... ... hiện toàn bộ
Tập 4 Số 10 - Trang 1340-1351 - 2010
#vi khuẩn #nấm #pH #vi sinh vật đất #đa dạng #thành phần #đất nông nghiệp #biến đổi #PCR định lượng #tuần tự song song có mã vạch
Các biến thể trình tự chính xác nên thay thế các đơn vị phân loại hoạt động trong phân tích dữ liệu gene đánh dấu Dịch bởi AI Tóm tắt
Những tiến bộ gần đây đã cho phép phân tích dữ liệu giải trình tự gene đánh dấu có độ thông lượng cao mà không cần phải xây dựng các đơn vị phân loại hoạt động phân tử (OTU) như thông thường: các cụm các đọc giải trình tự khác biệt dưới một ngưỡng khác biệt cố định. Các phương pháp mới kiểm soát lỗi đủ mức để các biến thể trình tự amplicon (A... ... hiện toàn bộ
Tập 11 Số 12 - Trang 2639-2643 - 2017
UniFrac: an effective distance metric for microbial community comparison
Tập 5 Số 2 - Trang 169-172 - 2011
Sự chuyển tiếp trong các cộng đồng vi khuẩn dọc theo gradient độ mặn 2000 km của Biển Baltic Dịch bởi AI Tóm tắt
Độ mặn là yếu tố chính điều khiển sự phân bố của sinh vật trong hệ thống thủy sinh, và hầu hết các sinh vật đa bào thủy sinh đều thích ứng với cuộc sống trong điều kiện nước mặn hoặc nước ngọt. Do đó, các khu vực pha trộn nước mặn và nước ngọt ở các vùng ven biển hoặc cửa sông có sự đa dạng về động thực vật hạn chế. Mặc dù sự thay đổi về đa d... ... hiện toàn bộ
Tập 5 Số 10 - Trang 1571-1579 - 2011
Sử dụng phân tích mạng để khám phá các mẫu đồng tồn tại trong cộng đồng vi sinh vật trong đất Dịch bởi AI Tóm tắt
Khám phá các tập dữ liệu môi trường lớn được tạo ra bởi các công nghệ giải trình tự DNA nhanh đòi hỏi những phương pháp phân tích mới để vượt ra ngoài các mô tả cơ bản về thành phần và đa dạng của các cộng đồng vi sinh vật tự nhiên. Để điều tra các tương tác tiềm năng giữa các taxa vi sinh vật, phân tích mạng của các mẫu đồng tồn tại của taxa... ... hiện toàn bộ
Tập 6 Số 2 - Trang 343-351 - 2012
Định lượng quy trình hình thành cộng đồng và xác định các đặc điểm tác động đến chúng Dịch bởi AI Tóm tắt
Sự thay đổi không gian trong thành phần của các cộng đồng sinh học được điều khiển bởi (sinh thái học) Trôi dạt, Lựa chọn và Phân tán. Các công cụ thống kê được áp dụng phổ biến không thể ước lượng định lượng các quá trình này, cũng như không xác định được các yếu tố vô sinh áp đặt lên các quá trình này. Để kiểm tra các cộng đồng vi sinh vật ... ... hiện toàn bộ
Tập 7 Số 11 - Trang 2069-2079 - 2013
Quy trình lắp ráp ngẫu nhiên và xác định trong các cộng đồng vi sinh vật dưới bề mặt Dịch bởi AI
Tập 6 Số 9 - Trang 1653-1664 - 2012
Mục tiêu chính của sinh thái học cộng đồng vi sinh vật là hiểu các lực lượng cấu thành nên thành phần cộng đồng. Lựa chọn xác định bởi các yếu tố môi trường cụ thể đôi khi quan trọng, nhưng trong những trường hợp khác, các quy trình ngẫu nhiên hoặc trung tính sinh thái chiếm ưu thế. Thiếu một khuôn khổ khái niệm thống nhất nhằm hiểu tại sao các quy trình xác định chiếm ưu thế trong một số bối cảnh...... hiện toàn bộ
Sự hình thành vi sinh vật trong rễ bị ảnh hưởng bởi sự phát triển của cây trồng Dịch bởi AI Tóm tắt
Có sự hiểu biết chung về khả năng của các chất tiết từ rễ ảnh hưởng đến cấu trúc của cộng đồng vi sinh vật trong rễ. Tuy nhiên, kiến thức của chúng ta về mối liên hệ giữa sự phát triển của cây, sự tiết rễ và sự tập hợp vi sinh vật còn hạn chế. Ở đây, chúng tôi đã phân tích cấu trúc của cộng đồng vi khuẩn trong rễ liên quan đến Arabidopsis tại... ... hiện toàn bộ
Tập 8 Số 4 - Trang 790-803 - 2014