ISME Journal
SCIE-ISI SCOPUS (2007-2025)
1751-7362
1751-7370
Anh Quốc
Cơ quản chủ quản: Nature Publishing Group , Springer Nature
Lĩnh vực:
Ecology, Evolution, Behavior and SystematicsMicrobiology
Các bài báo tiêu biểu
Phân tích cộng đồng vi sinh vật với năng suất cực cao trên nền tảng Illumina HiSeq và MiSeq Dịch bởi AI
Tập 6 Số 8 - Trang 1621-1624 - 2012
Tóm tắt Giải trình tự DNA tiếp tục giảm chi phí, với Illumina HiSeq2000 có thể
tạo ra tới 600 Gb dữ liệu đọc cặp 100 nucleotide trong một chu kỳ mười ngày.
Trong nghiên cứu này, chúng tôi trình bày một giao thức cho việc giải trình tự
amplicon cộng đồng trên các nền tảng HiSeq2000 và MiSeq của Illumina, và áp dụng
giao thức này để giải trình tự 24 cộng đồng vi sinh vật từ các môi trường liên
kết v...
Một hệ thống phân loại Greengenes cải tiến với các cấp bậc rõ ràng cho các phân tích sinh thái và tiến hóa của vi khuẩn và archaea Dịch bởi AI
Tập 6 Số 3 - Trang 610-618 - 2012
Tóm tắt Các hệ thống phân loại tham chiếu là rất quan trọng để cung cấp một
khung phân loại cho việc giải thích các khảo sát gene đánh dấu và metagenomic,
vốn đang tiếp tục phát hiện ra các loài mới với tốc độ đáng kể. Greengenes là
một cơ sở dữ liệu gene 16S rRNA toàn bộ chuyên dụng, cung cấp cho người dùng một
hệ thống phân loại được chỉnh sửa dựa trên việc suy diễn cây kiểu de novo. Chúng
tôi đ...
Cộng đồng vi sinh vật đất và nấm qua gradient pH trong đất trồng trọt Dịch bởi AI
Tập 4 Số 10 - Trang 1340-1351 - 2010
Tóm tắt Đất được thu thập qua một thí nghiệm đã bón vôi lâu dài (pH 4.0–8.3),
trong đó sự biến đổi của các yếu tố khác ngoài pH đã được giảm thiểu, được sử
dụng để khảo sát ảnh hưởng trực tiếp của pH lên sự phong phú và thành phần của
hai nhóm chính trong vi sinh vật đất: nấm và vi khuẩn. Chúng tôi giả thuyết rằng
các cộng đồng vi khuẩn sẽ bị ảnh hưởng mạnh bởi pH hơn là các cộng đồng nấm. Để
xác ...
#vi khuẩn #nấm #pH #vi sinh vật đất #đa dạng #thành phần #đất nông nghiệp #biến đổi #PCR định lượng #tuần tự song song có mã vạch
Các biến thể trình tự chính xác nên thay thế các đơn vị phân loại hoạt động trong phân tích dữ liệu gene đánh dấu Dịch bởi AI
Tập 11 Số 12 - Trang 2639-2643 - 2017
Tóm tắt Những tiến bộ gần đây đã cho phép phân tích dữ liệu giải trình tự gene
đánh dấu có độ thông lượng cao mà không cần phải xây dựng các đơn vị phân loại
hoạt động phân tử (OTU) như thông thường: các cụm các đọc giải trình tự khác
biệt dưới một ngưỡng khác biệt cố định. Các phương pháp mới kiểm soát lỗi đủ mức
để các biến thể trình tự amplicon (ASV) có thể được phân giải chính xác, xuống
đến c...
UniFrac: an effective distance metric for microbial community comparison
Tập 5 Số 2 - Trang 169-172 - 2011
Sự chuyển tiếp trong các cộng đồng vi khuẩn dọc theo gradient độ mặn 2000 km của Biển Baltic Dịch bởi AI
Tập 5 Số 10 - Trang 1571-1579 - 2011
Tóm tắt Độ mặn là yếu tố chính điều khiển sự phân bố của sinh vật trong hệ thống
thủy sinh, và hầu hết các sinh vật đa bào thủy sinh đều thích ứng với cuộc sống
trong điều kiện nước mặn hoặc nước ngọt. Do đó, các khu vực pha trộn nước mặn và
nước ngọt ở các vùng ven biển hoặc cửa sông có sự đa dạng về động thực vật hạn
chế. Mặc dù sự thay đổi về đa dạng và sự suy giảm số lượng loài trong nước lợ đ...
Sử dụng phân tích mạng để khám phá các mẫu đồng tồn tại trong cộng đồng vi sinh vật trong đất Dịch bởi AI
Tập 6 Số 2 - Trang 343-351 - 2012
Tóm tắt Khám phá các tập dữ liệu môi trường lớn được tạo ra bởi các công nghệ
giải trình tự DNA nhanh đòi hỏi những phương pháp phân tích mới để vượt ra ngoài
các mô tả cơ bản về thành phần và đa dạng của các cộng đồng vi sinh vật tự
nhiên. Để điều tra các tương tác tiềm năng giữa các taxa vi sinh vật, phân tích
mạng của các mẫu đồng tồn tại của taxa có ý nghĩa có thể giúp làm sáng tỏ cấu
trúc của...
Định lượng quy trình hình thành cộng đồng và xác định các đặc điểm tác động đến chúng Dịch bởi AI
Tập 7 Số 11 - Trang 2069-2079 - 2013
Tóm tắt Sự thay đổi không gian trong thành phần của các cộng đồng sinh học được
điều khiển bởi (sinh thái học) Trôi dạt, Lựa chọn và Phân tán. Các công cụ thống
kê được áp dụng phổ biến không thể ước lượng định lượng các quá trình này, cũng
như không xác định được các yếu tố vô sinh áp đặt lên các quá trình này. Để kiểm
tra các cộng đồng vi sinh vật dưới mặt đất phân bố ở hai cấu trúc địa chất khá...
Quy trình lắp ráp ngẫu nhiên và xác định trong các cộng đồng vi sinh vật dưới bề mặt Dịch bởi AI
Tập 6 Số 9 - Trang 1653-1664 - 2012
Mục tiêu chính của sinh thái học cộng đồng vi sinh vật là hiểu các lực lượng cấu
thành nên thành phần cộng đồng. Lựa chọn xác định bởi các yếu tố môi trường cụ
thể đôi khi quan trọng, nhưng trong những trường hợp khác, các quy trình ngẫu
nhiên hoặc trung tính sinh thái chiếm ưu thế. Thiếu một khuôn khổ khái niệm
thống nhất nhằm hiểu tại sao các quy trình xác định chiếm ưu thế trong một số
bối cảnh...
Sự hình thành vi sinh vật trong rễ bị ảnh hưởng bởi sự phát triển của cây trồng Dịch bởi AI
Tập 8 Số 4 - Trang 790-803 - 2014
Tóm tắt Có sự hiểu biết chung về khả năng của các chất tiết từ rễ ảnh hưởng đến
cấu trúc của cộng đồng vi sinh vật trong rễ. Tuy nhiên, kiến thức của chúng ta
về mối liên hệ giữa sự phát triển của cây, sự tiết rễ và sự tập hợp vi sinh vật
còn hạn chế. Ở đây, chúng tôi đã phân tích cấu trúc của cộng đồng vi khuẩn trong
rễ liên quan đến Arabidopsis tại bốn thời điểm khác nhau tương ứng với các giai
...