Current Genetics

Two mitochondrial genomes of Coprinus cinereus, H and J, were found to have alternative 1.23 kb insertions. Using the Neurospora crassa cytochrome oxidase-1 (co-1) gene as a probe, the “J” insertion site was shown to be located within the Coprinus co-1 gene, whereas the “H” insertion was some 2 kb distant. The insertions showed biased inheritance following mitochondrial genome recombination. Recombination between H and J genomes was detected using the mitochondrial gene mutations acu-10, which causes a cytochrome oxidase defect, and cap-1, which confers chloramphenicol resistance. Fourteen of fifteen independently derived recombinants for these two genes were shown to have both DNA insertions. In a second series of H x J crosses, intragenic recombination between different cap-1 alleles was detected. These mutations are assumed to be in the large ribosomal RNA gene some 6 kb distant from the nearest insertion site. Each of eight independently derived cap-1 + recombinants had both DNA insertions. Despite their similar size and similar behaviour following recombination the insertions do not share extensive sequence homology.

An efficiently expressed “tagged” gene system was used to study promoter sequence elements in genes encoding the U3 snoRNAs of Schizosaccharomyces pombe. Transcription was found dependent on two previously thought, mutually exclusive elements, a TATA-box, as found in other S. pombe snRNA gene promoters, and a Homol D-box, often considered a TATA-box analogue in the promoters of genes that encode ribosomal proteins. The Homol D-box is critical while the TATA-box strongly influences transcription efficiency but is not essential. The results suggest that the U3 snoRNA promoter may represent the fusion of two promoter systems reflecting the special role of this RNA in ribosome biogenesis. Steady state measurements of cellular RNAs support such a coordinated regulation of the U3 snoRNA.

In filamentous ascomycetes, glucose repression is mediated by CRE1, a zinc-finger protein related to Mig1p from yeast. Five putative AMPK phosphorylation motifs identified in the glucose repressor from the phytopathogenic fungus Sclerotinia sclerotiorum were mutated in a GFP::CRE1 translational fusion. Complementation experiments in Aspergillus nidulans and fluorescence microscopy analyses showed that mutation of one site (Ser266) abolishes the repressor activity of the fusion protein but not its nuclear targeting, suggesting that an AMPK protein kinase may be involved in the function of the fungal glucose repressor.

There are at least three alcohol dehydrogenases in Aspergillus nidulans. ADHIII has no obvious physiological function. We describe here the cloning of the ADHIII gene (alcC), its mapping on linkage group VII by “reverse genetics”, and the properties of multicopy transformants tested for their ability to grow on a range of alcohols (butan-1-ol being the best substrate tested for growth). We were unable to detect any obvious alteration in phenotype of a strain carrying a disrupted copy of the ADHIII gene.

Of S. cerevisiae UAA specific suppressors three leucine-insertors have been remaining unmapped. Mapping of them was attempted by using a set of eight strains that contained a total of 60 markers distributing over the entire genome; the markers were about 30 cM apart and they covered about 70% of the genome. Two supressors, SUP28 and SUP33, were localized on the right arm of chromosome XIV and on the left arm of chromosome XI, respectively. The other suppressor, SUP32, was not mapped, but its location was confined to a few regions in the genome. The present result and the previously available informations clearly show that the UAA suppressor loci are dispersedly distributing ovet the entire S. cerevisiae genome.

Năm dòng đơn bội monokaryon của nấm Basidiomycete Coprinus cinereus đã được biết đến là không thể hình thành sclerotia (cấu trúc nghỉa sinh vô tính) trên mycelium đơn bội sinh dưỡng. Phân tích di truyền đã cho thấy bốn gen khác nhau (ký hiệu là scl) được biểu hiện, tất cả đều là “dị tính” đối với các alen tạo sclerotium của chúng. Trong nghiên cứu được báo cáo, các dikaryon đồng alen đã được tạo ra và tác động của các gen âm tính sclerotium lên sự hình thành quả thể được điều tra. Trong trạng thái đồng alen, các gen khuyết điểm này ngăn cản sự hình thành cả sclerotia và quả thể bởi dikaryon. Điều này chứng tỏ rằng hai cấu trúc này chia sẻ một con đường khởi đầu chung. Cũng cho thấy rằng sự biểu hiện của các tác động của gen scl lên sự trưởng thành quả thể trong các dikaryon dị alen chịu ảnh hưởng của các gen điều chỉnh. Các chế độ tác động khả thi của các gen điều chỉnh và của các gen scl được thảo luận và một con đường phát triển quả thể được trình bày.

The complete mitochondrial genome sequences of Brassica species have provided insight into inter- and intraspecific variation of plant mitochondrial genomes. However, the size of mitochondrial genome sequenced for Brassica oleracea hitherto does not match to its physical mapping data. This fact led us to investigate B. oleracea mitochondrial genome in detail. Here we report novel B. oleracea mitochondrial genome, derived from var. capitata, a cabbage cultivar ‘‘Fujiwase’’. The genome was assembled into a 219,952-bp circular sequence that is comparable to the mitochondrial genomes of other Brassica species (ca. 220–232 kb). This genome contained 34 protein-coding genes, 3 rRNA genes and 17 tRNA genes. Due to absence of a large repeat (140 kb), the mitochondrial genome of ‘‘Fujiwase’’ is clearly smaller than the previously reported mitochondrial genome of B. oleracea accession ‘‘08C717’’ (360 kb). In both mitotypes, all genes were identical, except cox2-2, which was present only in the Fujiwase type. At least two rearrangement events via large and small repeat sequences have contributed to the structural differences between the two mitotypes. PCR-based marker analysis revealed that the Fujiwase type is predominant, whereas the 08C717 type coexists at low frequency in all B. oleracea cultivars examined. Intraspecific variations in the mitochondrial genome in B. oleracea may occur because of heteroplasmy, coexistence of different mitotypes within an individual, and substoichiometric shifting. Our data indicate that the Fujiwase-type genome should be used as the representative genome of B. oleracea.

cDNA mã hóa cho enzym endoglucanase EGII của P. janthinellum đã được nhân bản và giải trình tự. Khung đọc mở bao gồm 1230 nucleotide và trình tự axit amin suy diễn cho thấy độ tương đồng tổng thể là 63% với egl2 của T. reesei. Miền gắn cellulose của EGII đại diện cho một thành viên điển hình của gia đình A của các enzym cellulase. Gen egl2 chỉ được kích thích bởi cellulose hoặc cellobiose mà không phải bởi sophorose. Một đoạn promoter dài 1 kb đã được nhân bản và giải trình tự. Ba điểm khởi đầu phiên mã chính đã được xác định. Năm motif phù hợp với vị trí liên kết của chất ức chế catabolite carbon CREA của A. nidulans đã được phát hiện. Tác động tiềm năng của chúng trong việc ức chế đã được phân tích qua các thử nghiệm bandshift.