Bioinformatics

Công bố khoa học tiêu biểu

* Dữ liệu chỉ mang tính chất tham khảo

Sắp xếp:  
Two-stage designs for experiments with a large number of hypotheses
Bioinformatics - Tập 21 Số 19 - Trang 3771-3777 - 2005
Sonja Zehetmayer, Péter Bauer, Martin Posch
QuickGO: a web-based tool for Gene Ontology searching
Bioinformatics - Tập 25 Số 22 - Trang 3045-3046 - 2009
David Binns, Emily Dimmer, Rachael P. Huntley, Daniel Barrell, Claire O’Donovan, Rolf Apweiler
Abstract Summary: QuickGO is a web-based tool that allows easy browsing of the Gene Ontology (GO) and all associated electronic and manual GO annotations provided by the GO Consortium annotation groups QuickGO has been a popular GO browser for many years, but after a recent redevelopment it is now able to offer a greater range of facilities including...... hiện toàn bộ
Q-SiteFinder: an energy-based method for the prediction of protein-ligand binding sites
Bioinformatics - Tập 21 Số 9 - Trang 1908-1916 - 2005
Alasdair T. R. Laurie, Robert M. Jackson
Multistructural hot spot characterization with FTProd
Bioinformatics - Tập 29 Số 3 - Trang 393-394 - 2013
Lane Votapka, Rommie E. Amaro
Abstract Summary: Computational solvent fragment mapping is typically performed on a single structure of a protein to identify and characterize binding sites. However, the simultaneous analysis of several mutant structures or frames of a molecular dynamics simulation may provide more realistic detail about the behavior of the sites. Here we present a...... hiện toàn bộ
Identification of cavities on protein surface using multiple computational approaches for drug binding site prediction
Bioinformatics - Tập 27 Số 15 - Trang 2083-2088 - 2011
Zengming Zhang, Yu Li, Biaoyang Lin, Michael Schroeder, Bingding Huang
Abstract Motivation: Protein–ligand binding sites are the active sites on protein surface that perform protein functions. Thus, the identification of those binding sites is often the first step to study protein functions and structure-based drug design. There are many computational algorithms and tools developed in recent decades, such as LIGSITEcs/c...... hiện toàn bộ
Characterization of the folding degree of proteins
Bioinformatics - Tập 18 Số 5 - Trang 697-704 - 2002
Ernesto Estrada
Abstract Motivation: The characterization of the folding degree of chains is central to the elucidation of structure--function relationships in proteins. Here we present a new index for characterizing the folding degree of a (protein) chain. This index shows a range of features that are desirable for the study of the relation between structure and fu...... hiện toàn bộ
Genome-wide midrange transcription profiles reveal expression level relationships in human tissue specification
Bioinformatics - Tập 21 Số 5 - Trang 650-659 - 2005
Itai Yanai, Hila Benjamin, Michael Shmoish, Vered Chalifa‐Caspi, Maxim Shklar, Ron Ophir, Arren Bar‐Even, Shirley Horn‐Saban, Marilyn Safran, Eytan Domany, Doron Lancet, Orit Shmueli
Abstract Motivation: Genes are often characterized dichotomously as either housekeeping or single-tissue specific. We conjectured that crucial functional information resides in genes with midrange profiles of expression. Results: To obtain such novel information genome-wide, we have determined the mRNA expression level...... hiện toàn bộ
Manta: rapid detection of structural variants and indels for germline and cancer sequencing applications
Bioinformatics - Tập 32 Số 8 - Trang 1220-1222 - 2016
Heyan Sun, Ole Schulz-Trieglaff, Richard J. Shaw, Bret Barnes, Felix Schlesinger, Morten Källberg, Anthony J. Cox, Semyon Kruglyak, Christopher T. Saunders
Summary: We describe Manta, a method to discover structural variants and indels from next generation sequencing data. Manta is optimized for rapid germline and somatic analysis, calling structural variants, medium-sized indels and large insertions on standard compute hardware in less than a tenth of the time that comparable methods require to identify only subsets of these variant types: f...... hiện toàn bộ
AmiGO: Truy cập trực tuyến vào dữ liệu ngữ nghĩa và ghi chú Dịch bởi AI
Bioinformatics - Tập 25 Số 2 - Trang 288-289 - 2009
Seth Carbon, Amelia Ireland, Chris Mungall, Shengqiang Shu, Brad Marshall, Suzanna Lewis
Tóm tắt AmiGO là một ứng dụng web cho phép người dùng truy vấn, duyệt và trực quan hóa các ngữ nghĩa học và dữ liệu ghi chú sản phẩm gen liên quan (liên kết). AmiGO có thể được sử dụng trực tuyến tại trang web Gene Ontology (GO) để truy cập dữ liệu do Liên minh GO cung cấp; nó cũng có thể được tải xuống và cài đặt để duyệt ngữ nghĩa học và ghi chú đị...... hiện toàn bộ
#AmiGO #ứng dụng web #ngữ nghĩa học #ghi chú sản phẩm gen #Liên minh GO #mã nguồn mở
Markov model recognition and classification of DNA/protein sequences within large text databases
Bioinformatics - Tập 21 Số 21 - Trang 4046-4053 - 2005
Jonathan D. Wren, William H. Hildebrand, S. Chandrasekaran, Ulrich Melcher
Tổng số: 211   
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 10