Bioinformatics
Công bố khoa học tiêu biểu
* Dữ liệu chỉ mang tính chất tham khảo
Sắp xếp:
MCScanX-transposed: detecting transposed gene duplications based on multiple colinearity scansAbstract
Summary: Gene duplication occurs via different modes such as segmental and single-gene duplications. Transposed gene duplication, a specific form of single-gene duplication, ‘copies’ a gene from an ancestral chromosomal location to a novel location. MCScanX is a toolkit for detection and evolutionary analysis of gene colinearity. We have dev... ... hiện toàn bộ
Bioinformatics - Tập 29 Số 11 - Trang 1458-1460 - 2013
Haploview: phân tích và trực quan hóa bản đồ LD và haplotype Dịch bởi AI Tóm tắt Tóm lược: Nghiên cứu trong vài năm qua đã tiết lộ cấu trúc haplotype đáng kể trong bộ gen người. Việc mô tả các mẫu hình này, đặc biệt trong bối cảnh các nghiên cứu liên kết di truyền y học, đang trở thành một hoạt động nghiên cứu thường xuyên. Haploview là một gói phần mềm cung cấp tính toán các thống kê mất cân bằng liên kết cũng như các mẫu haplotype quầ... ... hiện toàn bộ
Bioinformatics - Tập 21 Số 2 - Trang 263-265 - 2005
#Haploview #haplotype #linkage disequilibrium #giao diện trực quan #dữ liệu kiểu gen #nghiên cứu liên kết di truyền y học
A novel hybrid gene prediction method employing protein multiple sequence alignmentsAbstract Motivation: As improved DNA sequencing techniques have increased enormously the speed of producing new eukaryotic genome assemblies, the further development of automated gene prediction methods continues to be essential. While the classification of proteins into families is a task heavily relying on correct gene predictions, it can at the sa... ... hiện toàn bộ
Bioinformatics - Tập 27 Số 6 - Trang 757-763 - 2011
edgeR: một gói Bioconductor cho phân tích biểu hiện khác biệt của dữ liệu biểu hiện gen số Dịch bởi AI Tóm tắt
Tóm tắt: Dự kiến các công nghệ biểu hiện gen số (DGE) mới nổi sẽ vượt qua công nghệ chip vi thể trong tương lai gần cho nhiều ứng dụng trong gen học chức năng. Một trong những nhiệm vụ phân tích dữ liệu cơ bản, đặc biệt cho các nghiên cứu biểu hiện gen, liên quan đến việc xác định liệu có bằng chứng cho thấy sự khác biệt ở số lượng của một bả... ... hiện toàn bộ
Bioinformatics - Tập 26 Số 1 - Trang 139-140 - 2010
Trimmomatic: một công cụ cắt linh hoạt cho dữ liệu chuỗi Illumina Dịch bởi AI Tóm tắt
Động lực: Mặc dù đã có nhiều công cụ xử lý dữ liệu đọc từ giải trình tự thế hệ mới (NGS), chúng tôi vẫn không tìm thấy công cụ nào hoặc sự kết hợp của các công cụ đáp ứng yêu cầu của chúng tôi về tính linh hoạt, khả năng xử lý chính xác dữ liệu cặp đầu và hiệu suất cao. Chúng tôi đã phát triển Trimmomatic như một công cụ xử lý dữ liệu đầu vào... ... hiện toàn bộ
Bioinformatics - Tập 30 Số 15 - Trang 2114-2120 - 2014
PEDSTATS: descriptive statistics, graphics and quality assessment for gene mapping data
Bioinformatics - Tập 21 Số 16 - Trang 3445-3447 - 2005
AmiGO: Truy cập trực tuyến vào dữ liệu ngữ nghĩa và ghi chú Dịch bởi AI Tóm tắt
AmiGO là một ứng dụng web cho phép người dùng truy vấn, duyệt và trực quan hóa các ngữ nghĩa học và dữ liệu ghi chú sản phẩm gen liên quan (liên kết). AmiGO có thể được sử dụng trực tuyến tại trang web Gene Ontology (GO) để truy cập dữ liệu do Liên minh GO cung cấp; nó cũng có thể được tải xuống và cài đặt để duyệt ngữ nghĩa học và ghi chú đị... ... hiện toàn bộ
Bioinformatics - Tập 25 Số 2 - Trang 288-289 - 2009
#AmiGO #ứng dụng web #ngữ nghĩa học #ghi chú sản phẩm gen #Liên minh GO #mã nguồn mở
ClustalW-MPI: Phân tích ClustalW sử dụng tính toán phân tán và song song Dịch bởi AI Tóm tắt Tóm lược: ClustalW là một công cụ để căn chỉnh nhiều chuỗi protein hoặc nucleotide. Việc căn chỉnh này được thực hiện thông qua ba bước: căn chỉnh từng cặp, tạo cây hướng dẫn và căn chỉnh tiến dần. ClustalW-MPI là một triển khai phân tán và song song của ClustalW. Cả ba bước đều đã được thực hiện song song để giảm thời gian thực hiện. Phần mềm sử dụng một t... ... hiện toàn bộ
Bioinformatics - Tập 19 Số 12 - Trang 1585-1586 - 2003
#ClustalW #căn chỉnh chuỗi #tính toán phân tán #tính toán song song #MPI #protein #nucleotide
MRBAYES: Xác suất Bayes Suy luận cây tiến hóa Dịch bởi AI Tóm tắt Tóm tắt: Chương trình MRBAYES thực hiện suy luận Bayes của phả hệ bằng cách sử dụng một biến thể của thuật toán Monte Carlo chuỗi Markov. Khả dụng: MRBAYES, bao gồm mã nguồn, tài liệu, các tệp dữ liệu mẫu và một tệp thực thi, có sẵn tại http://brahms.biology.rochester.edu/software.html.
Bioinformatics - Tập 17 Số 8 - Trang 754-755 - 2001
#Bayesian inference #phylogeny #Markov chain Monte Carlo #MRBAYES #software availability
Tổng số: 210
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 10