AmiGO: Truy cập trực tuyến vào dữ liệu ngữ nghĩa và ghi chú

Bioinformatics - Tập 25 Số 2 - Trang 288-289 - 2009
Seth Carbon1, Amelia Ireland1, Chris Mungall1, Shengqiang Shu1, Brad Marshall1, Suzanna Lewis1
1#N# Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA, 2GO Editorial Office, European Bioinformatics Institute, Hinxton, Cambridge CB10 1SD, UK and 3Department of Energy Joint Genome Institute, Walnut Creek, CA 94598, USA

Tóm tắt

Tóm tắt AmiGO là một ứng dụng web cho phép người dùng truy vấn, duyệt và trực quan hóa các ngữ nghĩa học và dữ liệu ghi chú sản phẩm gen liên quan (liên kết). AmiGO có thể được sử dụng trực tuyến tại trang web Gene Ontology (GO) để truy cập dữ liệu do Liên minh GO cung cấp; nó cũng có thể được tải xuống và cài đặt để duyệt ngữ nghĩa học và ghi chú địa phương. AmiGO là một phần mềm mã nguồn mở được phát triển và duy trì bởi Liên minh GO. Khả dụng: http://amigo.geneontology.org Tải về: http://sourceforge.net/projects/geneontology/ Liên hệ: [email protected]

Từ khóa

#AmiGO #ứng dụng web #ngữ nghĩa học #ghi chú sản phẩm gen #Liên minh GO #mã nguồn mở

Tài liệu tham khảo

Altschul, 1990, Basic local alignment search tool, J. Mol. Biol., 215, 403, 10.1016/S0022-2836(05)80360-2

Boyle, 2004, GO::TermFinder—open source software for accessing Gene Ontology information and finding significantly enriched Gene Ontology terms associated with a list of genes, Bioinformatics, 20, 3710, 10.1093/bioinformatics/bth456

Gene Ontology Consortium, 2000, Gene Ontology: tool for the unification of biology, Nature Genet, 25, 25, 10.1038/75556

Thông tin
Thông tin xuất bản

Bioinformatics

Tập 25 Số 2

288-289

Thông tin tác giả