Biến động không gian của cấu trúc cộng đồng vi khuẩn trong trầm tích cửa sông Châu Giang

Biologia - Tập 66 - Trang 574-584 - 2011
Fu-Lin Sun1,2, You-Shao Wang1,2, Mei-Lin Wu1, Yu-Tu Wang1,2, Qian P. Li3
1State Key Laboratory of Oceanography in the Tropics, South China Sea Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Guangzhou, People’s Republic of China
2Marine Biology Research Station at Daya Bay, Chinese Academy of Sciences, Shenzhen, China
3Scripps Institution of Oceanography, University of California, San Diego, USA

Tóm tắt

Phương pháp điện di gel gradient biến tính (DGGE) và các phương pháp phân tích thống kê đa biến đã được áp dụng để khảo sát sự biến động không gian của cấu trúc cộng đồng vi khuẩn trong trầm tích cửa sông Châu Giang và để giải quyết mối quan hệ giữa thành phần cộng đồng vi sinh vật và hóa lý nước đáy tại mười điểm khác nhau. Kết quả sơ bộ từ phân tích chuỗi gen của các băng DGGE được cắt gợi ý rằng α-Proteobacteria, γ-Proteobacteria, Acidobacteria và Actinobacteria là các nhóm vi khuẩn chiếm ưu thế trong trầm tích cửa sông Châu Giang. Kết quả của phân tích quy mô nhiều chiều của những dữ liệu thực địa cho thấy thành phần của các cộng đồng vi khuẩn thay đổi tùy theo địa điểm lấy mẫu. Cuối cùng, phân tích tương ứng chính thức của dữ liệu các biến môi trường và cộng đồng vi khuẩn cho thấy rằng cấu trúc cộng đồng vi khuẩn bị ảnh hưởng đáng kể bởi những biến đổi của các yếu tố môi trường (phospho tổng, nitrit, amoni, oxy hòa tan, pH và độ mặn).

Từ khóa

#cộng đồng vi khuẩn #điện di gel gradient biến tính #trầm tích cửa sông Châu Giang #phân tích thống kê đa biến #biến động không gian

Tài liệu tham khảo

Benson D.A., Karsch-Mizrachi I., Lipman D.J., Ostell J. & Sayers E.W. 2010. GenBank. Nucleic Acids Res. 38: D46–D51.

Binnerup S.J., Jensen K., Revsbech N.P., Jensen M.H. & Sorensen J. 1992. Denitrification, dissimilatory reduction of nitrate to ammonium, and nitrification in a bioturbated estuarine sediment as measured with 15N and microsensor techniques. Appl. Environ. Microbiol. 58: 303–313.

Colwell F., Matsumoto R. & Reed D. 2004. A review of the gas hydrates, geology, and biology of the Nankai Trough. Chem. Geol. 205: 391–404.

Garrity G., Johnson K.L., Bell J.A. & Searles D.B. 2002. Taxonomic Outline of the Procaryotes. Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, 2nd Ed., Springer-Verlag, New York.

Kirchman D., Moss J. & Keil R. 1992. Nitrate uptake by heterotrophic bacteria: does it change the f-ratio. Ergeb. Limnol./ Adv. Limnol. 37: 129–138.

Wang Y.S., Lou Z.P., Sun C.C. & Sun S. 2008. Ecological environment changes in Daya Bay, China, from 1982 to 2004. Mar. Pollut. Bull. 56: 1871–1879.

Zhang G., Parker A., House A., Mai B., Li X., Kang Y. & Wang Z. 2002. Sedimentary records of DDT and HCH in the Pearl River Delta, South China. Environ. Sci. Technol. 36: 3671–3677.