Heredity

Trong những năm gần đây, một loạt các phương pháp cho phép tái cấu trúc những thay đổi về kích thước quần thể trong quá khứ từ dữ liệu toàn bộ genome đã được phát triển. Đồng thời, đã có một sự công nhận ngày càng tăng rằng cấu trúc quần thể có thể tạo ra dữ liệu di truyền tương tự như những dữ liệu được sản xuất theo các mô hình thay đổi kích thước quần thể. Gần đây, Mazet và cộng sự (Heredity 116:362–371, 2016) đã chỉ ra rằng, đối với bất kỳ mô hình cấu trúc quần thể nào, luôn có thể tìm thấy một mô hình panmictic với một chức năng cụ thể về những thay đổi kích thước quần thể, có phân phối chính xác giống như phân phối của mô hình có cấu trúc đối với T₂ (thời gian hòa hợp cho một mẫu kích thước hai). Họ gọi chức năng này là IICR (Tỷ lệ hòa hợp ngược tức thì) và cho thấy rằng nó không nhất thiết phải tương ứng với những thay đổi về kích thước quần thể theo các mô hình không panmictic. Ngoài ra, hầu hết các phương pháp phân tích dữ liệu dưới các mô hình cấu trúc quần thể thường cố định cấu trúc đó một cách tùy ý và giảm thiểu hoặc bỏ qua những thay đổi kích thước quần thể. Tại đây, chúng tôi mở rộng công trình nền tảng của Herbots (Luận án Tiến sĩ, Đại học London, 1994) về cấu trúc đồng bào và đề xuất một khung mới, đồng bào cấu trúc không đứng yên (NSSC), bao gồm các sự kiện nhân khẩu học (thay đổi trong dòng gen và/hoặc kích thước quần thể) vào các mô hình gần như bất kỳ độ phức tạp nào. Chúng tôi chỉ ra cách tính toán IICR dưới một gia đình rộng lớn các mô hình đứng yên và không đứng yên. Như một ví dụ, chúng tôi giải quyết câu hỏi về sự tiến hóa của con người và người Neanderthal và thảo luận cách mà khung NSSC cho phép diễn giải dữ liệu di truyền dưới góc nhìn mới này.