The harmonizome: a collection of processed datasets gathered to serve and mine knowledge about genes and proteins

Wu C. MacLeod I. Su A.I. (2012) BioGPS and MyGene. info: organizing online, gene-centric information. Nucleic Acids Res., gks1114.

10.1093/nar/gku1055

10.1093/nar/gkp846

10.1093/nar/gkr968

10.1093/bioinformatics/btr260

10.1093/bioinformatics/bts366

10.1038/75556

10.1093/database/baq020

10.1093/nar/gkm895

10.1038/ng.f.217

10.1093/bioinformatics/bti1142

10.1186/1751-0473-6-1

10.1186/s12918-015-0173-z

10.1038/470163a

10.1093/nar/gkr1097

10.1038/nmeth.1637

10.1093/nar/gks1094

Gaudet, 2011, Towards BioDBcore: a community-defined information specification for biological databases, Database, 2011, baq027, 10.1093/database/baq027

10.1126/science.1180598

10.1016/j.tips.2014.07.001

Rouillard A.D. Wang Z. Ma’ayan A. (2015) Reprint of “Abstraction for data integration: Fusing mammalian molecular, cellular and phenotype big datasets for better knowledge extraction”. Comput. Biol. Chem.

10.1038/sdata.2014.35

10.1038/nbt0910-904

10.1073/pnas.1109363108

10.1073/pnas.012025199

10.1073/pnas.0400782101

10.1038/nature11003

10.1093/nar/gkq929

10.1093/nar/gkp995

10.1038/nature11005

10.1073/pnas.1018854108

Uhlen, 2015, Tissue-based map of the human proteome, Sci. Proteomics, 347, 1260419

10.1038/nbt.3080

10.1038/nature13302

10.1038/nature13319

10.1038/nbt1010-1045

10.1038/nature14248

10.1093/nar/gks1042

10.1038/nrn2722

10.1016/j.tins.2012.09.005

10.1038/ng.2653

10.1126/science.1262110

10.1038/ng.2764

10.1038/nature11405

10.1038/nature05453

10.1038/nature13185

10.7717/peerj.1054

10.1093/nar/gkn580

10.1093/nar/gku935

10.1093/nar/gkt1068

10.1093/nar/gkj067

10.1093/nar/gkt1143

10.1093/nar/gks1065

10.1093/nar/gkl923

10.1126/science.1132939

10.1093/nar/gks1193

10.1093/nar/30.1.207

Dudley, 2009, Disease signatures are robust across tissues and experiments, Mol. Syst. Biol, 5, 307., 10.1038/msb.2009.66

Duan Q. Flynn C. Niepel M. . (2014) LINCS Canvas Browser: interactive web app to query, browse and interrogate LINCS L1000 gene expression signatures. Nucleic Acids Res.,

10.1016/j.ymeth.2014.11.020

10.1038/ng0504-431

10.1093/nar/gkr1182

10.1002/pmic.200300772

10.1093/nar/gku1267

10.1093/nar/gkt1113

10.1093/nar/gkt1229

10.1093/nar/gkt1026

10.1038/ng0208-124

10.1093/nar/gkg047

10.1093/nar/gku967

10.1007/s00335-012-9421-3

10.1002/wsbm.44

10.1093/nar/30.1.52

10.1093/nar/gku1205

10.1093/nar/gkt1211

Mailman, 2007, The NCBI dbGaP database of genotypes and phenotypes, Nat. Genet, 39, 1181, 10.1038/ng1007-1181

10.1093/nar/gku1179

Mitchell, 2003, Gene indexing: characterization and analysis of NLM's GeneRIFs, AMIA Annu. Symp. Proc, 2003, 460

10.1093/database/bau012

10.1093/nar/gkm950

10.1093/nar/gkm900

10.1093/nar/gkt1103

10.1093/nar/27.1.29

10.1093/nar/gkt1076

10.1093/nar/gks1118

10.1093/nar/gkg115

10.1093/nar/gkn653

10.1093/nar/gkt1102

10.1093/nar/gki072

10.1093/nar/gkr1074

10.1093/nar/gkm936

10.1093/nar/gkp914

10.1016/j.cell.2011.05.006

10.1186/1752-0509-6-89

10.1093/database/bat045

10.1093/nar/gkr901

10.1093/nar/gkp1015

10.1073/pnas.0506580102

Chen E.Y. Tan C.M. Kou Y. . (2013) Enrichr: interactive and collaborative HTML5 gene list enrichment analysis tool. BMC Bioinformatics, 14,

10.1093/nar/gkg056

10.1093/database/baq037

10.1093/nar/gkj109

10.1093/nar/gku1204

10.1093/nar/gkh086

10.1093/nar/gkn892

10.1093/nar/gkh070

10.1093/nar/gkh052

10.1093/nar/gkr1088

10.1093/nar/gkq1039

10.1093/bioinformatics/btp026

10.1093/nar/gkq1107

10.1093/nar/gkt1266

10.1038/nsmb.2115

10.1016/j.molcel.2007.06.017

10.1101/gr.082701.108

10.1093/nar/gku1009

10.1093/bioinformatics/btq466

10.1126/science.1105136

10.1371/journal.pbio.1001046

10.1093/nar/gkt997

10.1093/nar/gkh012

10.1093/nar/gkg108

10.1093/nar/gkj143

10.1093/nar/gkn739

10.1093/nar/gku1243

10.1093/nar/29.1.37

10.1093/nar/gkh131

10.1093/nar/gku989

10.1093/nar/gkt1225

10.1186/1471-2105-13-156

Lai, 1995, Molecular genetic characterization of neuroendocrine lung cancer cell lines, Anticancer Res, 15, 225

Carney, 1985, Establishment and identification of small cell lung cancer cell lines having classic and variant features, Cancer Res, 45, 2913

10.1093/jnci/81.16.1223

10.1038/nature12831

10.1038/bjc.2013.813

Jane, 2015, Dinaciclib, a CDK inhibitor promotes proteasomal degradation of Mcl-1 and enhances ABT-737 mediated cell death in malignant human glioma cell lines, J. Pharmacol. Exp. Ther, 356, 354, 10.1124/jpet.115.230052

10.1097/CMR.0b013e328304974c

10.1158/1535-7163.MCT-09-0962

10.1158/1078-0432.CCR-11-2378

10.1021/jm3011433

Clare, 2010, Targeting ion channels for drug discovery, Discov. Med, 9, 253

10.1002/pmic.200900258

10.1007/s00335-012-9427-x

10.1038/nrd2518

10.1074/jbc.R115.675728

Stockert, 2015, Advancements in therapeutically targeting orphan GPCRs, Front. Pharmacol, 6, 100., 10.3389/fphar.2015.00100

10.1038/nature15699

10.1126/scisignal.aad0694

10.1016/j.tips.2015.04.005

10.1111/bph.13096

10.1093/nar/gkr1122

10.1093/bib/bbs034

10.1023/A:1010933404324