Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Đặc điểm cắt ghép trong sự biểu hiện của các gen cảm ứng của virus BCTIV (virus gây bệnh cong lá củ cải Iran)
Tóm tắt
Virus cong lá củ cải Iran (BCTIV) là một loại geminivirus đặc trưng đã được báo cáo từ các trang trại trồng củ cải đường tại Iran. Trong nghiên cứu này, vai trò của quá trình cắt ghép trong sự biểu hiện của các gen cảm ứng đối diện của BCTIV đã được khảo sát. RNA tổng hợp đã được chiết xuất từ mô nhiễm BCTIV, và vị trí intron dự đoán của các bản sao mRNA cảm ứng đối diện đã được khuếch đại bằng RT-PCR, sau đó là nhân bản các sản phẩm khuếch đại. Chuỗi xác nhận rằng cả mRNA đã cắt ghép và chưa cắt ghép đều được tổng hợp bởi cùng một đơn vị phiên mã. So sánh chuỗi cho thấy rằng một đoạn 155-nt (intron) tương ứng với nucleotid 1890–2044 của bộ gen virus đã bị loại bỏ từ bản sao sau đó, do đó việc hợp nhất các gen C1:C2 đã dẫn đến việc tạo ra một khung đọc liên tục cho khả năng sản xuất protein khởi đầu sao chép nguyên vẹn (Rep). Intron BCTIV chứa hầu hết các tín hiệu cắt ghép đồng thuận cần thiết cho quá trình cắt ghép ở sinh vật nhân thực và một số virus thực vật bao gồm mastre- và capulaviruses.
Từ khóa
#BCTIV #cắt ghép #gen cảm ứng #RNA #virus thực vật.Tài liệu tham khảo
G.P. Accotto, J. Donson, P.M. Mullineaux, EMBO J. 8, 1033–1039 (1989)
J.K. Brown, C.M. Fauquet, R.W. Briddon, M. Zerbini, E. Moriones, J. Navas-Castillo, in Virus taxonomy: classification and nomenclature of viruses: ninth report of the international committee on taxonomy of viruses, ed. by A.M.Q. King, M.J. Adams, E.B. Carstens, E.J. Lefkowitz (Elsevier Inc, London, 2012), pp. 351–373
P. Bernardo, B. Muhire, S. François, M. Deshoux, P. Hartnady, K. Farkas, S. Kraberger, D. Filloux, E. Fernandez, S. Galzi, R. Ferdinand, M. Granier, A. Marais, P.M. Blasco, T. Candresse, F. Escriu, A. Varsani, G.W. Harkins, D.P. Martin, P. Roumagnac, Virology 493, 142–153 (2016)
H.R. Bolok-Yazdi, J. Heydarnejad, H. Massumi, Virus Genes 36, 539–545 (2008)
M. Boulton, Physiol. Mol. Plant Pathol. 60, 243–255 (2002)
R. Breathnach, P. Chambon, Annu. Rev. Biochem. 50, 349–383 (1981)
R. Breathnach, C. Benoist, K. O’Hare, F. Gannon, P. Chambon, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 75, 4853–4857 (1978)
J.W.S. Brown, Plant J. 10, 771–780 (1996)
S. Chang, J. Puryear, J. Cairney, Plant Mol. Biol. Rep. 11, 113–116 (1993)
S. Clancy, Nat. Educ. 1, 31 (2008)
E.L. Dekker, C.J. Woolston, Y.B. Xue, B. Cox, P.M. Mullineaux, Nucl. Acids Res. 19, 4075–4081 (1991)
S. Gharouni Kardani, J. Heydarnejad, M. Zakiaghl, M. Mehrvar, S. Kraberger, A. Varsani, Virus Genes 46, 71–575 (2013)
E. Hosseini Abhari, J. Heydarnejad, H. Massumi, A. Hosseini Pour, K. Izadpanah, in Proceedings of the Second Asian Conference on Plant Pathology (National University of Singapore, Singapore, 2005), p. 62
J. Heydarnejad, E. Hosseini Abhari, H.R. Bolok-Yazdi, H. Massumi, J. Phytopathol. 125, 321–325 (2007)
J. Heydarnejad, N. Keyvani, S. Razavinejad, H. Massumi, A. Varsani, Arch. Virol. 158, 435–443 (2013)
H. Jeske, in Tomato yellow leaf curl virus disease, ed. by H. Czosnek (Springer, London, 2007), pp. 141–156
B. Krenz, J.R. Thompson, M. Fuchs, K.L. Perry, J. Virol. 86, 7715 (2012)
L. Liu, J.W. Davies, J. Stanley, J. Gen. Virol. 79, 2265–2274 (1998)
B.A.M. Morris, K.A. Richardson, A. Haley, X. Zhan, J.E. Thomas, Virology 187, 633–642 (1992)
P.M. Mullineaux, F. Guerineau, G.P. Accotto, Nucl. Acids Res. 18, 7259–7265 (1990)
X. Roca, A.R. Krainer, Brenner’s Encyclopedia of Genetics, vol. 6, 2nd edn. (Elsevier Inc, London, 2013), pp. 292–294
H.J. Schalk, V. Matzeit, B. Schiller, J. Schell, B. Gronenborn, EMBO J. 8, 359–364 (1989)
P.V. Shivaprasad, R. Akbergenov, D. Trinks, R. Rajeswaran, K. Veluthambi, T. Hohn, M.M. Pooggin, J. Virol. 79, 8149–8163 (2005)
M.R. Sudarshana, K.L. Perry, M.F. Fuchs, Phytopathology 105, 1026–1032 (2015)
A. Varma, V.G. Malathi, Ann. Appl. Biol. 142, 145–164 (2003)
A. Varsani, J. Navas-Castillo, E. Moriones, C. Hernández-Zepeda, A. Idris, J.K. Brown, F. Murilo Zerbini, D.P. Martin, Arch. Virol. 159, 2193–2203 (2014)
E.A. Wright, T. Heckel, J. Groenendijk, J.W. Davies, M.I. Boulton, Plant J. 12, 1285–1297 (1997)
Q. Wu, A.R. Krainer, Mol. Cell. Biol. 19, 3225–3226 (1999)
M.Q. Zhang, Hum. Mol. Genet. 7, 919–932 (1998)
Y.P. Zhang, J.K. Uyemoto, B.C. Kirkpatrick, J. Virol. Methods 71, 45–50 (1998)