Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Mối quan hệ phát sinh chủng loại giữa các loài hàng năm và lâu năm của chi Cicer được suy diễn từ chuỗi ITS của DNA ribosome hạt nhân
Tóm tắt
Phân tích phân loại học của các chuỗi DNA của các spacer nội truyền (ITS1 và ITS2) của các cistron ribosome cho 20 loài Cicer L. (trong đó có tất cả các loài hàng năm), cho thấy rằng các phân chi khác nhau của chi này không phải là đơn ngành. Các loài hàng năm không hình thành một nhánh: C. arietinum thực chất có mối quan hệ gần gũi với cả C. echinospermum và C. reticulatum, trong khi đó C. bijugum, C. judaicum và C. pinnatifidum hình thành một nhánh riêng. Loài C. cuneatum hàng năm là nhóm chị em với loài C. canariense lâu năm và cả hai đều là các loài cổ trong chi này. Ngược lại, C. yamashitae là loài hàng năm duy nhất thuộc về một nhóm loài lâu năm, trong đó có mối quan hệ gần gũi rõ rệt giữa C. graecum và C. montbretii cũng như giữa một nhóm loài chủ yếu là châu Á.
Từ khóa
#Cicer #phân loại học #ITS #DNA ribosome #loài hàng năm #loài lâu nămTài liệu tham khảo
Aceto, S., Caputo, P., Cozzolino, S., Gaudio, L., Moretti, A.: Phylogeny and evolution of Orchis and allied genera based on ITS DNA variation: morphological gaps and molecular continuity.-Mol. Phylogenet. Evol. 13: 67–76, 1999.
Ahmad, F.: Random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis reveals genetic relationships among the annual Cicer species.-Theor. appl. Genet. 98: 657–663, 1999.
Ahmad, F., Gaur, P.M., Slinkard, A.E.: Isozyme polymorphism and phylogenetic interpretations in the genus Cicer L.-Theor. appl. Genet. 83: 620 627, 1992.
Ahmad, F., Slinkard, A.E.: Genetic relationships in the genus Cicer L. as revealed by polyacrylamide gel electrophoresis of seed storage proteins.-Theor. appl. Genet. 84: 688–692, 1992.
Choumane, W., Winter, P., Weigand, F., Kahl, G.: Conservation and variability of sequence tagged microsatellite sites (STMSs) from chickpea (Cicer arietinum L.) within the genus Cicer.-Theor. appl. Genet. 101: 269–278, 2000.
Felsenstein, J.: Confidence limits on phylogenies: an approach using the bootstrap.-Evolution 39: 783–791, 1985.
Felsenstein, J.: PHYLIP (Phylogeny Inference Package) version 3.5c.-Department of Genetics, University of Washington, Seattle 1993.
Galasso, I., Frediani, M., Maggiani, M., Cremonini, R., Pignone, D.: Chromatin characterization by banding techniques, in situ hybridization, and nuclear DNA content in Cicer L. (Leguminosae).-Genome 39: 258–265, 1996.
Iruela, M., Rubio, J., Cubero, J.I., Gil, I., Millan, T.: Phylogenetic analysis in the genus Cicer and cultivated chickpea using RAPD and ISSR markers.-Theor. appl. Genet. 104: 643–651, 2002.
Jukes, T.H., Cantor, C.R.: Evolution of protein molecules.-In: Munro, H.N. (ed.): Mammalian Protein Metabolism. Pp. 21–132. Academic Press, New York 1969.
Kazan, K., Muehlbauer, F.J.: Allozyme variation and phylogeny in annual species of Cicer (Leguminosae).-Plant Syst. Evol. 175: 11–21, 1991.
Labdi, M., Robertson, L.D., Singh, K.B., Charrier, A.: Genetic diversity and phylogenetic relationships among the annual Cicer species as revealed by isozyme polymorphism.-Euphytica 88: 181–188, 1996.
Ladizinsky, G., Pickersgill, G.B., Yamamoto, K.: Exploitation of wild relatives of the food legumes.-In: Summerfield, R.J. (ed.): World Crops: Cool Season Food Legumes. Pp. 967–978. Kluwer Academic Press, Dordrecht 1988.
Maggini, F., Barsanti, P., Marazia, T.: Individual variation of the nucleolus organizer regions in Allium cepa and A. sativum.-Chromosoma 66: 173–183, 1978.
Ocampo, B., Venora, G., Errico, A., Singh, K.B., Saccardo, F.: Karyotype analysis in the genus Cicer.-J. Genet. Breed. 46: 229–240, 1992.
Pearson, W.R., Lipman, D.J.: Improved tools for biological sequence comparison.-Proc. nat. Acad. Sci. USA 85: 2444–2448, 1988.
Rajesh, P.N., Sant, V.J., Gupta, V.S., Muehlbauer, F.J., Ranjekar, P.K.: Genetic relationships among annual and perennial wild species of Cicer using inter simple sequence repeat (ISSR) polymorphism.-Euphytica 129: 15–23, 2002.
Robertson, L.D., Ocampo, B., Singh, K.B.: Morphological variation in wild annual Cicer species in comparison to the cultigen.-Euphytica 95: 309–319, 1997.
Singh, K.B., Malhotra, R.S., Halila, H., Knights. E.J., Verma M.M.: Current status and future strategy in breeding chickpea for resistance to biotic and abiotic stresses.-Euphytica 73: 137–149, 1994.
Singh, K.B., Ocampo, B.: Exploitation of wild Cicer species for yield improvement in chickpea.-Theor. appl. Genet. 95: 418–423, 1997.
Staginnus, C., Winter, P., Desel, C., Schmidt, T., Kahl, G.: Molecular structure and chromosomal localization of major repetitive DNA families in the chickpea (Cicer arietinum L.) genome.-Plant mol. Biol. 39: 1037–1050, 1999.
Sudupak, M.A.: Inter and intra-species Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) variations in the genus Cicer.-Euphytica 135: 229–238, 2004.
Sudupak, M.A., Akkaya, M.S., Kence, A.: Analysis of genetic relationships among perennial and annual Cicer species growing in Turkey using RAPD markers.-Theor. appl. Genet. 105: 1220–1228, 2002.
Sudupak, M.A., Akkaya, M.S., Kence, A.: Genetic relationships among perennial and annual Cicer species growing in Turkey assessed by AFLP fingerprinting.-Theor. appl. Genet. 108: 937–944, 2004.
Tayyar, R.I., Lukaszewsky, A.J., Waines, J.G.: Chromosome banding patterns in the annual species of Cicer.-Genome 37: 656–663, 1994.
Tayyar, R.I., Waines, J.G.: Genetic relationships among annual species of Cicer (Fabaceae) using isozyme variation.-Theor. appl. Genet. 92: 245–254, 1996.
Thompson, J.D., Higgins, D.G., Gibson, T.J.: CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, positions-specific gap penalties and weight matrix choice.-Nucl. Acids Res. 22: 4673–4680, 1994.
Van der Maesen, L.J.G.: Origin, history and taxonomy of chickpea.-In: Saxena, M.C., Singh, K.B. (ed.): The Chickpea. Pp. 11–34. CAB Int. Publ., Wallington 1987.
Van der Maesen, L.J.G., Pundir, R.P.S.: Availability and use of wild Cicer germplasm.-Plant Genet. Res. Newslett. 57: 19–24, 1984.
Venora, G., Blangiforti, S., Frediani, M., Maggini, F., Gelati, M.T., Ruffini Castiglione, M., Cremonini, R.: Nuclear DNA contents, rDNAs, chromatin organization and karyotype evolution in Vicia sect. Faba.-Protoplasma 213: 118–125, 2000.