Mô hình PLS/OPLS trong chuyển hóa: ảnh hưởng của việc hoán vị các hàng trong tập dữ liệu đến các tham số chất lượng kiểm định chéo K-gập

Royal Society of Chemistry (RSC) - Tập 11 Số 1 - Trang 13-19
Mohamed N. Triba1,2,3,4,5, Laurence Le Moyec6,7,8,9,10, Roland Amathieu11,12,13,14,15, Corentine Goossens1,2,3,4,5, France Mentré1,2,3,4,5, Pierre Nahon16,11,8,17,18, Douglas N. Rutledge19,20,8,21, Philippe Savarin1,2,3,4,5
1Laboratoire Chimie
2Propriétés de Biomatériaux et d'Agents Thérapeutiques (CSPBAT)
3Sorbonne Paris Cité
4Structures
5Université Paris 13,
691025 Evry Cedex
7Bd François Mitterrand
8France
9Unité de Biologie Intégrative des Adaptations à l'Exercice (UBIAE), U902, INSERM
10Université d'Evry Val d'Essonne
11Assistance Publique des Hôpitaux de Paris (AP-HP)
12Créteil
13hôpital Henri Mondor
14Service d'Anesthésie et des Réanimations Chirurgicales
15Université Paris 12
1693143 Bondy Cedex
17Hôpital, Jean Verdier
18Service d'Hépatologie et Université Paris 13
1975231 Paris
20AgroParisTech
21Laboratoire de Chimie Analytique, AgroParisTech, 16 rue Claude Bernard, 75231 Paris, France

Tóm tắt

Trong một số trường hợp, giá trị tham số chất lượng (số lượng thành phần quan trọng, Q2, giá trị p-ANOVA CV,…) của các mô hình PLS/OPLS được tính toán bằng phương pháp kiểm định chéo K-gập có thể bị ảnh hưởng mạnh bởi thành phần của các tập con kiểm định khác nhau.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

Worley, 2013, Curr. Metabolomics, 1, 92

Mevik, 2007, Journal of Statistical Software, 18, 1, 10.18637/jss.v018.i02

Xia, 2012, Nucleic Acids Res., 40, 127, 10.1093/nar/gks374

Worley, 2014, ACS Chem. Biol., 9, 1138, 10.1021/cb4008937

Tapp, 2009, TrAC, Trends Anal. Chem., 28, 1322, 10.1016/j.trac.2009.08.006

Kemsley, 2009, J. Chemom., 23, 263, 10.1002/cem.1217

Marcoulides, 2006, Management Information Systems Quarterly, 30, iii, 10.2307/25148727

L. Eriksson , E.Johansson, N.Kettaneh-Wold, J.Trygg, C.Wikström and S.Wold, Multi- and Megavariate Data Analysis, Part I: Basic Principles and Applications, Umetrics AB, Umeå, Sweden, 2006

Westerhuis, 2008, Metabolomics, 4, 81, 10.1007/s11306-007-0099-6

Cai, 2012, J. Proteome Res., 11, 4338, 10.1021/pr300459d

Dong, 2013, Clin. Biochem., 46, 346, 10.1016/j.clinbiochem.2012.11.012

Eriksson, 2008, J. Chemom., 22, 594, 10.1002/cem.1187

Wheelock, 2013, Mol. BioSyst., 9, 2589, 10.1039/c3mb70194h

C. Goossens , M. N.Triba, L.Le Moyec, O.Seror, P.Nahon and P.Savarin, 2014, in preparation

Dieterle, 2006, Anal. Chem., 78, 4281, 10.1021/ac051632c

Trygg, 2002, J. Chemom., 16, 119, 10.1002/cem.695

Nahon, 2012, Clin. Cancer Res., 18, 6714, 10.1158/1078-0432.CCR-12-1099

Kell, 2000, Trends Biotechnol., 18, 93, 10.1016/S0167-7799(99)01407-9

Golbraikh, 2002, J. Mol. Graphics Modell., 20, 269, 10.1016/S1093-3263(01)00123-1

Martens, 1998, Chemom. Intell. Lab. Syst., 44, 99, 10.1016/S0169-7439(98)00167-1

Smit, 2007, Anal. Chim. Acta, 592, 210, 10.1016/j.aca.2007.04.043

Stone, 1974, Journal of the Royal Statistical Society: Series B (Statistical Methodology), 36, 111, 10.1111/j.2517-6161.1974.tb00994.x

Xu, 2004, J. Chemom., 18, 112, 10.1002/cem.858

Broadhurst, 2006, Metabolomics, 2, 171, 10.1007/s11306-006-0037-z