N-acetyl-L-aspartic acid-N'-methylamide với sự định hướng của chuỗi bên có khả năng tạo liên kết hidro bên ngoài

Trong nghiên cứu này, chúng tôi đã tạo và phân tích các bề mặt năng lượng tiềm tàng của các dạng hình chuỗi bên cho từng dạng cấu trúc xương sống trong chín dạng có thể có của N-acetyl-L-aspartic acid-N'-methylamide. Chúng tôi đã tìm thấy tổng cộng 27 trong số 81 cấu trúc có thể tối ưu hóa ở mức lý thuyết B3LYP/6-31G(d). Năng lượng tương đối, cũng như năng lượng ổn định mà chuỗi bên tác động lên xương sống, đã được tính toán cho từng cấu trúc tối ưu hóa này ở mức lý thuyết này. Các liên kết hidro giữa xương sống-xương sống (N-H . . . O=C) và xương sống-chuỗi bên (N-H . . . O=C; N-H . . . OH) đã được phân tích. Sự xuất hiện của dạng cấu trúc xương sống mà thường không có thể được quy cho các liên kết hidro giữa chuỗi bên-xương sống (SC/BB) và xương sống-xương sống (BB/BB).