Chiến lược PCR đa mảnh để nhận diện nhanh chóng các loại cấu trúc và biến thể của yếu tố mec trong Staphylococcus aureus kháng methicillin

Antimicrobial Agents and Chemotherapy - Tập 46 Số 7 - Trang 2155-2161 - 2002
Duarte C. Oliveira1, Hermı́nia de Lencastre1
1The Rockefeller University, New York, New York 10021, and Instituto de Tecnologia Química e Biológica, ITQB/UNL, 2780 Oeiras, Portugal

Tóm tắt

TÓM TẮT

Việc đặc trưng đầy đủ vi khuẩn kháng methicillin Staphylococcus aureus (MRSA) không chỉ yêu cầu xác định nền gen vi khuẩn mà còn cả cấu trúc của yếu tố phức tạp và dị hợp tử mec mà các vi khuẩn này mang, yếu tố này liên quan đến gen xác định tính kháng thuốc mecA. Chúng tôi báo cáo về sự phát triển, xác thực và ứng dụng của một chiến lược PCR đa mảnh cho phép đặc trưng sơ bộ nhanh chóng các loại yếu tố mec dựa trên các đặc điểm cấu trúc đã được chứng minh là điển hình của các yếu tố mec mang bởi nhiều chủng MRSA. Chiến lược này đã được xác thực bằng cách sử dụng một bộ sưu tập đại diện của các chủng MRSA đại dịch, trong đó đầy đủ cấu trúc của các yếu tố mec liên quan đã được xác định trước đó bằng cách lai ghép và sàng lọc PCR cũng như bằng phương pháp giải trình tự DNA. Phương pháp này đã được kiểm tra cùng với phương pháp phân loại theo nhiều locus và các phương pháp phân loại khác để đặc trưng hóa 18 mẫu đại diện cho các chủng MRSA thu thập được trong một đợt bùng phát tại bệnh viện ở Barcelona, Tây Ban Nha. PCR đa mảnh đã được chứng minh là nhanh chóng, đáng tin cậy, và có khả năng trong một thử nghiệm xác định năm loại cấu trúc của yếu tố mec giữa các chủng này, ba biến thể chính và hai biến thể phụ, mỗi loại đều đã được phát hiện trong các nghiên cứu kháng MRSA trước đây. Kỹ thuật này có thể là một bổ sung hữu ích cho kho vũ khí các công cụ phân loại phân tử dùng cho việc đặc trưng các loại clonal MRSA và nhận diện nhanh chóng các biến thể cấu trúc của yếu tố mec.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1006/mcpr.1996.0066

10.1093/nar/16.23.11141

10.1073/pnas.161272898

10.1128/jcm.32.9.2081-2087.1994

Dubin, D. T., S. G. Chikramane, B. Inglis, P. R. Matthews, and P. R. Stewart. 1992. Physical mapping of the mec region of an Australian methicillin-resistant Staphylococcus aureus lineage and a closely related American strain. J. Gen. Microbiol.138:169-180.

10.1128/AAC.35.8.1661

10.1128/JCM.38.3.1008-1015.2000

10.1128/jcm.32.7.1768-1772.1994

10.2307/30105130

10.2144/97233rr01

10.1016/S0966-842X(01)02175-8

10.1128/AAC.45.5.1323-1336.2001

10.1128/AAC.43.6.1449

10.1093/jac/48.1.143

10.1128/AAC.44.6.1549-1555.2000

10.1053/jhin.1999.0631

10.1126/science.8093647

10.1128/AAC.46.4.1147-1152.2002

10.1093/jac/46.4.527

10.1128/AAC.44.2.231-238.2000

10.1128/JCM.39.9.3332-3338.2001

10.1128/JCM.38.3.1032-1035.2000

10.1128/JCM.37.10.3411-3414.1999

10.1016/S0732-8893(99)00021-8

10.1128/JCM.39.2.574-580.2001

10.1089/10766290152773365

10.1016/S1473-3099(02)00227-X

10.1128/AAC.44.7.1906-1910.2000

10.1086/515610

10.1099/00222615-46-9-773

10.1099/00222615-47-4-335

10.1128/AEM.66.4.1347-1353.2000

10.1128/JCM.37.11.3556-3563.1999

10.1016/0014-5793(87)80373-3

10.1128/jcm.33.9.2400-2404.1995

10.1128/jcm.33.11.2864-2867.1995