MrBayes 3: Suy luận phát sinh loài Bayesian dưới các mô hình hỗn hợp

Bioinformatics - Tập 19 Số 12 - Trang 1572-1574 - 2003
Fredrik Ronquist1, John P. Huelsenbeck2
1Department of Systematic Zoology, Evolutionary Biology Centre, Uppsala University, Norbyv. 18D, SE-752 36 Uppsala, Sweden.
2Section of Ecology, Behavior, and Evolution, Division of Biological Sciences, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093-0116 USA

Tóm tắt

Tóm tắt

Tóm lược: MrBayes 3 thực hiện phân tích phát sinh loài Bayesian kết hợp thông tin từ các phần dữ liệu hoặc các phân tập khác nhau tiến hóa dưới các mô hình tiến hóa ngẫu nhiên khác nhau. Điều này cho phép người dùng phân tích các tập dữ liệu không đồng nhất bao gồm các loại dữ liệu khác nhau—ví dụ: hình thái, nucleotide và protein—và khám phá nhiều loại mô hình cấu trúc kết hợp tham số duy nhất và chung của phần. Chương trình sử dụng MPI để song song hóa kết hợp Metropolis trên các cụm máy Macintosh hoặc UNIX.

Khả dụng: http://morphbank.ebc.uu.se/mrbayes

Liên hệ: [email protected]

* Địa chỉ thông tin liên lạc.

Từ khóa

#phân tích phát sinh loài Bayesian #mô hình hỗn hợp #dữ liệu không đồng nhất #song song hóa #phát sinh loài

Tài liệu tham khảo