Các trình tự D-loop DNA ty thể cho thấy nguồn gốc Đông Nam Á và Ấn Độ của gà dân gian Zimbabwe

Animal Genetics - Tập 39 Số 6 - Trang 615-622 - 2008
F. C. Muchadeyi1,2, H. Eding1, Henner Simianer3, C. B. A. Wollny4, Eildert Groeneveld1, Steffen Weigend1
1Institute of Farm Animal Genetics, Friedrich-Loeffler-Institut, Höltystraße 10, 31535 Neustadt, Germany
2Present address: Department of Animal Science, Animal Breeding and Genetics, Stellenbosch University, Stellenbosch, South Africa.
3Institute of Animal Breeding and Genetics, Georg-August-Universität, Albrecht-Thaer-Weg 3, 37075 Göttingen, Germany
4Faculty Life Sciences, University of Applied Sciences, Berlinstrasse 109, 55411 Bingen, Germany

Tóm tắt

Tóm tắtNghiên cứu này nhằm đánh giá sự đa dạng DNA ty thể (mtDNA) và cấu trúc phát sinh địa lý của gà ở năm vùng sinh thái nông nghiệp của Zimbabwe. Bên cạnh đó, gà ở Zimbabwe được so sánh với các quần thể từ các khu vực địa lý khác (Malawi, Sudan và Đức) cũng như từ các hệ thống quản lý khác nhau (dòng gà thịt và gà đẻ thuần chủng). Cuối cùng, các haplotype của những con gà này được căn chỉnh với các trình tự gà được lấy từ GenBank, phản ánh các quần thể của những trung tâm thuần hóa có khả năng. Một đoạn 455 bp của khu vực D-loop của mtDNA đã được giải trình tự trong 283 con gà từ 14 quần thể. Ba mươi hai vị trí thay đổi đã xác định 34 haplotype. Trong gà Zimbabwe, sự đa dạng giữa các kiểu sinh thái chiếm 96,8% sự biến thiên, cho thấy có rất ít sự khác biệt giữa các kiểu sinh thái. Các haplotype này được phân loại thành ba nhóm ứng với (i) gà Zimbabwe và Malawi, (ii) dòng gà thịt và gà đẻ thuần chủng và gà Bắc Âu, và (iii) sự pha trộn của gà từ Zimbabwe, Sudan, Bắc Âu và các dòng thuần chủng. Đa dạng giữa các nhóm đã giải thích hơn 80% tổng sự biến thiên. Kết quả cho thấy sự tồn tại của hai dòng mẹ khác nhau phân bổ đều giữa năm kiểu sinh thái gà Zimbabwe. Đối với một trong những dòng này, gà từ Zimbabwe và Malawi chia sẻ các haplotype chính với các quần thể gà có nguồn gốc Đông Nam Á. Dòng mẹ thứ hai, có thể từ tiểu lục địa Ấn Độ, phổ biến ở cả năm kiểu sinh thái gà Zimbabwe, gà Sudanese và gà Bắc Âu cũng như các dòng gà thịt và gà đẻ thuần chủng. Một dòng mẹ thứ ba loại trừ gà Zimbabwe và các gà châu Phi khác và nhóm với các haplotype có khả năng có nguồn gốc từ miền Nam Trung Quốc.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1073/pnas.93.13.6792

10.1093/genetics/141.2.743

10.1046/j.1365-294x.2000.01020.x

Crawford R.D., 1990, Poultry Breeding and Genetics, 43

10.1016/0022-2836(90)90225-B

10.1111/j.1365-2656.2006.01186.x

Excoffier L., 2006, arlequinVersion 3.01: An Integrated Software Package for Population Genetics Data Analysis

10.1093/bib/5.2.150

10.1016/j.ympev.2005.09.014

10.1016/0305-4403(92)90019-Y

10.1017/S1014233900001425

10.1111/j.1365-2052.2007.01606.x

10.1073/pnas.70.12.3321

10.1111/j.1365-2052.2007.01604.x

Thông tin
Thông tin xuất bản

Animal Genetics

Tập 39 Số 6

615-622

Thông tin tác giả