Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Kazachstania psychrophila sp. nov., một loài nấm men ưa lạnh mới được phân lập từ thịt bò đóng gói chân không
Tóm tắt
Năm dòng nấm men ascosporogenous mới (H382, H396, H409, H433T và H441) đã được phát hiện thông qua một cuộc khảo sát về vi sinh vật trong thịt bò đóng gói chân không. Phân tích trình tự vùng ITS và gen rRNA LSU cho thấy các dòng mới đại diện cho một nhánh riêng biệt trong chi Kazachstania, có quan hệ gần với Kazachstania lodderae (tỷ lệ đồng nhất 97,0%) và Kazachstania ichnusensis (tỷ lệ đồng nhất 96,1%). Sự khác biệt chính về các dòng H382, H396, H409, H433T và H441 so với các dòng của các loài Kazachstania đã biết là nhiệt độ tối đa cho sự phát triển, dưới 20 °C cho các dòng mới, trong khi các loài liên quan phát triển ở 25 °C. Hơn nữa, các dòng này khác với các loài Kazachstania đã biết về mẫu hình hấp thu và lên men của các nguồn carbon. Dựa trên những đặc điểm này, năm dòng được coi là đại diện cho một loài mới của chi Kazachstania, được đề xuất mang tên Kazachstania psychrophila sp. nov. Dòng chuẩn là H433T (DSM 26230T=CBS 12689T). Số Mycobank của dòng chuẩn là MB 803980.
Từ khóa
#Kazachstania psychrophila #nấm men #ưa lạnh #vi sinh vật #thịt bò #phân lậpTài liệu tham khảo
Altschul SF, Madden TL, Schaffer AA, Zhang JH, Zhang Z, Miller W, Lipman DJ (1997) Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs. Nucleic Acids Res 25:3389–3402
Araujo FV, Rosa CA, Freitas LF, Lachance MA, Vaughan-Martini A, Mendonca-Hagler LC, Hagler AN (2012) Kazachstania bromeliacearum sp nov., a yeast species from water tanks of bromeliads. Int J Syst Evol Microbiol 62:1002–1006
Bai M, Qing M, Guo Z, Zhang Y, Chen X, Bao Q, Zhang H, Tian-song S (2010) Occurrence and dominance of yeast species in naturally fermented milk from the Tibetan Plateau of China. Can J Microbiol 56:707–714
Cardinali G, Antonielli L, Corte L, Roscini L, Bagnetti A, Pelliccia C, Puddu G (2012) Kazachstania ichnusensis sp nov., a diploid homothallic ascomycetous yeast from Sardinian lentisk rhizosphere. Int J Syst Evol Microbiol 62:722–727
Chen R, Wei SC, Jiang YM, Wang QM, Bai FY (2010) Kazachstania taianensis sp nov., a novel ascomycetous yeast species from orchard soil. Int J Syst Evol Microbiol 60:1473–1476
Felsenstein J (1995) Confidence limits on phylogenies: an approach using bootstrap. Evolution 39:783–791
Imanishi Y, Ueda-Nishimura K, Mikata K (2007) Two new species of Kazachstania that form ascospores connected by a belt-like intersporal body: Kazachstania zonata and Kazachstania gamospora. FEMS Yeast Res 7:330–338
Kimura M (1980) A simple method for estimating evolutionary rate of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences. J Mol Evol 16:111–120
Kumura H, Tanoue Y, Tsukahara M, Tanaka T, Shimazaki K (2004) Screening of dairy yeast strains for probiotic applications. J Dairy Sci 87:4050–4056
Kurtzman CP (2003) Phylogenetic circumscription of Saccharomyces, Kluyveromyces and other members of the Saccharomycetaceae, and the proposal of the new genera Lachancea, Nakaseomyces, Naumovia, Vanderwaltozyma and Zygotorulaspora. FEMS Yeast Res 4:233–245
Kurtzman CP, Robnett CJ (1998) Identification and phylogeny of ascomycetous yeasts from analysis of nuclear large subunit (26S) ribosomal DNA partial sequences. Antonie Van Leeuwenhoek 73:331–371
Kurtzman CP, Robnett CJ, Ward JM, Brayton C, Gorelick P, Walsch TJ (2005) Multigene phylogenetic analysis of pathogenic Candida species in the Kazachstania (Arxiozyma) telluris complex and description of their ascosporic states as Kazachstania bovina sp. nov., K-heterogenica sp. nov., K-pintolopesii sp. nov., and K-slooffiae sp. nov. J Clin Microbiol 43:101–111
Kurtzman CP, Fell JW, Boekhout T (2011a) The yeasts, a taxonomic study. Elsevier, London
Kurtzman CP, Fell JW, Boehout T (2011b) Definition, classification and nomenclature of the yeasts. In: Kurtzman CP, Fell JW, Boekhout T (eds) The yeasts a taxonomic study, 5th edn. Elsevier, London, pp 3–5
Lee CF, Liu CH, Young SS, Chang KS (2008) Kazachstania jiainicus sp. nov., an ascomycetous yeast species isolated from soil in Taiwan. FEMS Yeast Res 8:114–118
Lee CF, Yao CH, Liu YR, Young SS, Chang KS (2009) Kazachstania wufongensis sp. nov., an ascosporogenous yeast isolated from soil in Taiwan. Antonie Van Leeuwenhoek 95:335–341
Libkind D, Brizzio S, Ruffini A, Gadanho M, van Broock M, Sampaio JP (2003) Molecular characterization of carotenogenic yeasts from aquatic environments in Patagonia, Argentina. Antonie Van Leeuwenhoek 84:313–322
Lu HZ, Ca YM, Wu ZW, Jia JH, Bai FY (2004) Kazachstania aerobia sp. nov., an ascomycetous yeast species from aerobically deteriorating corn silage. Int J Syst Evol Microbiol 54:2431–2435
Nisiotou AA, Nychas GJ (2008) Kazachstania hellenica sp. nov., a novel ascomycetous yeast from a Botrytis-affected grape must fermentation. Int J Syst Evol Microbiol 58:1263–1267
Suh SO, Zhou JJ (2011) Kazachstania intestinalis sp. nov., an ascosporogenous yeast from the gut of passalid beetle Odontotaenius disjunctus. Antonie Van Leeuwenhoek 100:109–115
Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, Kumar S (2011) MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol Biol Evol 28:2731–2739
Teixeira Magalhaes K, Pereira GV, Ribeiro DD, Freitas Schwan R (2010) Microbial communities and chemical changes during fermentation of sugary Brazilian kefir. World J Microbiol Biotechnol 26:1241–1250
Vaughan-Martini A, Lachance M-A, Kurtzman CP (2011) Kazachstania Zubkova (1971). In: Kurtzman CP, Fell JW, Boekhout T (eds) The yeasts a taxonomic study, vol 2, 5th edn., Elsevier, London, p 439–470
White TJ, Bruns T, Lee S, Taylor J (1990) Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In: Innis MA, Gelfand DH, Sninsky JJ, White TJ (eds) PCR protocols: a guide for methods and applications. Academic Press, New York, pp 315–322
Wu ZW, Bai FY (2005) Kazachstania aquatica sp. nov and Kazachstania solicola sp. nov., novel ascomycetous yeast species. Int J Syst Evol Microbiol 55:2219–2224
Yarrow D (1998) Methods for the isolation, maintenance and identification of yeasts. In: Kurtman CP, Fell JW (eds) The yeasts, a taxonomy study, 4th edn. Elsevier, Amsterdam, pp 77–102
Zubkova RD (1971) New genus of the family Saccharomycetaceae from Kazakhstan. Botanicheskie Materialy Gerbariya Instituta Botaniki Akademii Nauk Kazakhskoi SSR: 53-56
