Sự cách ly và đặc trưng hóa các locus microsatellite ở Melicope quadrilocularis (Rutaceae), một loài thực vật đặc hữu của quần đảo Bonin, Nhật Bản, và khả năng khuếch đại giữa các loài ở các taxa có liên quan gần gũi

Springer Science and Business Media LLC - Tập 8 - Trang 1487-1490 - 2007
Saeko Katoh1, Shingo Kaneko2, Yuji Isagi3, Noriaki Murakami1, Hidetoshi Kato1
1Department of Biological Sciences, Graduate Schools of Science and Engineering, Tokyo Metropolitan University, Tokyo, Japan
2Graduate School of International Development and Cooperation, Hiroshima University, Higashi-Hiroshima, Japan
3Laboratory of Forest Biology, Division of Forest and Biomaterials Science, Graduate School of Agriculture, Kyoto University, Kyoto, Japan

Tóm tắt

Mười hai locus microsatellite đã được cách ly và đặc trưng hóa cho Melicope quadrilocularis, một loài cây đặc hữu ở quần đảo Bonin. Số lượng allele quan sát được tại mỗi locus dao động từ 1 đến 18. Phạm vi độ đa hình kỳ vọng là 0.0000–0.9445. Khả năng áp dụng giữa các loài của những locus này đã được đánh giá bằng cách phân tích hai loài đặc hữu khác và một giống đặc hữu của Melicope cũng được phân bố trên quần đảo Bonin. Tất cả các cặp mồi cho 12 locus đã được thử nghiệm đã thành công trong việc khuếch đại các locus ở tất cả các taxa, ngoại trừ các mồi cho bốn locus ở M. nishimurae.

Từ khóa

#microsatellite #Melicope quadrilocularis #loài đặc hữu #quần đảo Bonin #khuếch đại giữa các loài

Tài liệu tham khảo

Environment Agency of Japan (2000) Threatened wildlife of Japan. Red Data Book, 2nd ed. vol. 8, Vascular Plants. Wildlife Research Center, Tokyo Hartley TG (2001) On the taxonomy and biogeography of Euodia and Melicope (Rutaceae). Allertonia 8:1–328 Kobayashi S, Ono M (1987) A revised list of vascular plants indigenous and introduced to the Bonin (Ogasawara) and the Volcano (Kazan) Islands. Ogasawara Res 13:1–55 Lian C, Hogetsu T (2002) Development of microsatellite markers in black locust (Robinia pseudoacasia) using a dual-suppression-PCR technique. Mol Ecol Notes 2:211–213 Lian C, Wadud MA, Geng Q, Shimatani K, Hougetsu T (2006) An improved technique for isolating codominant compound microsatellite markers. J Plant Res 119:415–517 Raymond M, Rousset F (1995) GENEPOP (version 1.2): population genetics software for exact tests and ecumenicism. J Heredity 86:248–249 Shimizu Y (2003) The nature of Ogasawara and its conservation. Global Environ Res 7:3–14