Tách biệt và đặc trưng một phage ly giải giống T7 cho Pseudomonas fluorescens

Springer Science and Business Media LLC - Tập 8 - Trang 1-11 - 2008
Sanna Sillankorva1,2, Peter Neubauer2, Joana Azeredo3
1IBB-Institute for Biotechnology and Bioengineering, Centre of Biological Engineering, Universidade do Minho, Braga, Portugal
2Bioprocess Engineering Laboratory, Department of Process and Environmental Engineering and Biocenter Oulu, University of Oulu, Oulu, Finland
3IBB – Institute for Biotechnology and Bioengineering, Centre of Biological Engineering, Universidade do Minho, Braga, Portugal

Tóm tắt

Mặc dù Pseudomonas fluorescens đã được chứng minh là sinh vật gây hư hỏng trong sữa, thịt tươi và sản phẩm thực phẩm bảo quản mát, và tiềm năng đã được công nhận của phage như là chất khử trùng, đến nay không có phage nào được xác định cụ thể cho các loại P. fluorescens từ ngành công nghiệp sữa đã được mô tả gần đây về hiệu quả ly giải của chúng. Chúng tôi mô tả việc tách biệt và đặc trưng một phage ly giải có khả năng nhiễm một loạt các kiểu P. fluorescens được tách biệt từ ngành công nghiệp sữa Bồ Đào Nha và Hoa Kỳ. Nhiều phage đã được tách biệt, cho thấy phổ chủ thể khác nhau và hiệu quả ly giải khác nhau. Một trong số các phage, phage ϕIBB-PF7A, đã được nghiên cứu chi tiết do hiệu quả ly giải của nó đối với nhiều kiểu và ribotype P. fluorescens. Phage ϕIBB-PF7A với đường kính đầu khoảng 63 nm và kích thước đuôi khoảng 13 × 8 nm thuộc về họ Podoviridae và giống một phage kiểu T7 điển hình, như đã được phân tích bằng kính hiển vi điện tử truyền qua (TEM). Chu kỳ phát triển của phage với thời gian tiềm ẩn phát hiện là 15 phút, thời gian tối thui là 10 phút, kích thước bùng nổ là 153 đơn vị tạo đốm trên mỗi tế bào nhiễm, kích thước genome khoảng 42 kbp, và kích thước cùng trình tự N-terminal của một trong các dải protein, cho thấy sự tương đồng với protein vỏ chính 10A, đều phải đảm bảo với phân loại này. Phage giống T7 được tách biệt, phage ϕIBB-PF7A, nhanh chóng và hiệu quả trong việc ly giải các kiểu P. fluorescens khác nhau và có thể là một ứng viên tốt để được sử dụng như một chất khử trùng nhằm kiểm soát sự xuất hiện của các kiểu P. fluorescens gây hư hỏng trong môi trường thực phẩm và sữa.

Từ khóa

#Pseudomonas fluorescens #phage ly giải #Podoviridae #vi sinh vật gây hư hỏng #môi trường thực phẩm

Tài liệu tham khảo

Arnaut-Rollier I, De Zutter L, Van Hoof J: Identities of the Pseudomonas spp. in flora from chilled chicken. International Journal of Food Microbiology. 1999, 48: 87-96. 10.1016/S0168-1605(99)00038-0.

Dogan B, Boor KJ: Genetic diversity and spoilage potentials among Pseudomonas spp. isolated from fluid milk products and dairy processing plants. Applied and Environmental Microbiology. 2003, 69: 130-138. 10.1128/AEM.69.1.130-138.2003.

Peneau S, Chassaing D, Carpentier B: First evidence of division and accumulation of viable but nonculturable Pseudomonas fluorescens cells on surfaces subjected to conditions encountered at meat processing premises. Applied and Environmental Microbiology. 2007, 73: 2839-2846. 10.1128/AEM.02267-06.

Buckling A, Wei Y, Massey RC, Brockhurst MA, Hochberg ME: Antagonistic coevolution with parasites increases the cost of host deleterious mutations. Proceedings of the Royal Society B-Biological Sciences. 2006, 273: 45-49. 10.1098/rspb.2005.3279.

Brockhurst MA, Buckling A, Rainey PB: Spatial heterogeneity and the stability of host-parasite coexistence. Journal of Evolutionary Biology. 2006, 19: 374-379. 10.1111/j.1420-9101.2005.01026.x.

Craven HM, Macauley BJ: Microorganisms in Pasteurized Milk After Refrigerated Storage .1. Identification of Types. Australian Journal of Dairy Technology. 1992, 47: 38-45.

Wiedmann M, Weilmeier D, Dineen SS, Ralyea R, Boor KJ: Molecular and phenotypic characterization of Pseudomonas spp. isolated from milk. Applied and Environmental Microbiology. 2000, 66: 2085-2095. 10.1128/AEM.66.5.2085-2095.2000.

Kovalyova IV, Kropinski AM: The complete genomic sequence of lytic bacteriophage gh-1 infecting Pseudomonas putida – evidence for close relationship to the T7 group. Virology. 2003, 311: 305-315. 10.1016/S0042-6822(03)00124-7.

Pajunen M, Kiljunen S, Skurnik M: Bacteriophage phi YeO3-12, specific for Yersinia enterocolitica serotype O : 3, is related to coliphages T3 and T7. Journal of Bacteriology. 2000, 182: 5114-5120. 10.1128/JB.182.18.5114-5120.2000.

Barry GT, Goebel WF: The Effect of Chemical and Physical Agents on the Phage Receptor of Phase-Ii Shigella sonnei. Journal of Experimental Medicine. 1951, 94: 387-400. 10.1084/jem.94.5.387.

Arnaut-Rollier I, Vauterin L, De Vos P, Massart DL, Devriese LA, De Zutter L, Van Hoof J: A numerical taxonomic study of the Pseudomonas flora isolated from poultry meat. Journal of Applied Microbiology. 1999, 87: 15-28. 10.1046/j.1365-2672.1999.00785.x.

Cromie S: Psychrotrophs and Their Enzyme Residues in Cheese Milk. Australian Journal of Dairy Technology. 1992, 47: 96-100.

Sorhaug T, Stepaniak L: Psychrotrophs and their enzymes in milk and dairy products: Quality aspects. Trends in Food Science & Technology. 1997, 8: 35-41. 10.1016/S0924-2244(97)01006-6.

Atterbury RJ, Van Bergen MA, Ortiz F, Lovell MA, Harris JA, De Boer A, Wagenaar JA, Allen VM, Barrow PA: Bacteriophage therapy to reduce salmonella colonization of broiler chickens. Appl Environ Microbiol. 2007, 73: 4543-4549. 10.1128/AEM.00049-07.

Loc Carrillo C, Atterbury RJ, el-Shibiny A, Connerton PL, Dillon E, Scott A, Connerton IF: Bacteriophage therapy to reduce Campylobacter jejuni colonization of broiler chickens. Appl Environ Microbiol. 2005, 71: 6554-6563. 10.1128/AEM.71.11.6554-6563.2005.

Lavigne R, Burkal'tseva MV, Robben J, Sykilinda NN, Kurochkina LP, Grymonprez B, Jonckx B, Krylov VN, Mesyanzhinov VV, Volckaert G: The genome of bacteriophage phi KMV, a T7-like virus infecting Pseudomonas aeruginosa. Virology. 2003, 312: 49-59. 10.1016/S0042-6822(03)00123-5.

Ceyssens PJ, Lavigne R, Mattheus W, Chibeu A, Hertveldt K, Mast J, Robben J, Volckaert G: Genomic analysis of Pseudomonas aeruginosa phages LKD16 and LKA1: Establishment of the phiKMV subgroup within the T7 supergroup. Journal of Bacteriology. 2006, 188: 6924-6931. 10.1128/JB.00831-06.

Park SC, Shimamura I, Fukunaga M, Mori KI, Nakai T: Isolation of bacteriophages specific to a fish pathogen, Pseudomonas plecoglossicida, as a candidate for disease control. Applied and Environmental Microbiology. 2000, 66: 1416-1422. 10.1128/AEM.66.4.1416-1422.2000.

Park SC, Nakai T: Bacteriophage control of Pseudomonas plecoglossicida infection in ayu Plecoglossus altivelis. Diseases of Aquatic Organisms. 2003, 53: 33-39. 10.3354/dao053033.

Adams MH: Bacteriophages. 1959, New York: Interscience Publishers

Laemmli UK: Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. Nature. 1970, 227: 680-685. 10.1038/227680a0.