Evaluation and Reparametrization of the OPLS-AA Force Field for Proteins via Comparison with Accurate Quantum Chemical Calculations on Peptides

Journal of Physical Chemistry B - Tập 105 Số 28 - Trang 6474-6487 - 2001
George A. Kaminski, Richard A. Friesner, Julian Tirado‐Rives, William L. Jorgensen

Tóm tắt

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

Mayo S. L., 1990, J. Phys. Chem., 94, 8897, 10.1021/j100389a010

Elcock A. H., 1996, J. Am. Chem. Soc., 118, 3787, 10.1021/ja954061m

Ben-Tal N., 1997, Biophys. J., 73, 1717, 10.1016/S0006-3495(97)78203-1

Sham Y. Y., 1997, J. Phys. Chem. B, 101, 4458, 10.1021/jp963412w

Banks J. L., 1999, J. Chem. Phys., 110, 741, 10.1063/1.478043

Jorgensen W. L., 1990, J. Am. Chem. Soc., 113, 4768, 10.1021/ja00168a022

Kaminski G., 1994, J. Phys. Chem., 98, 13077, 10.1021/j100100a043

Kaminski G., 1996, J. Phys. Chem., 100, 18010, 10.1021/jp9624257

McDonald N. A., 1998, J. Phys. 6487 Chem. B, 102, 8049, 10.1021/jp981200o

Rizzo R. C., 1999, J. Am. Chem. Soc., 121, 4827, 10.1021/ja984106u

Essex J. W., 1997, J. Phys. Chem. B, 101, 9663, 10.1021/jp971990m

Maxwell D. S., 1995, J. Comput. Chem., 16, 984, 10.1002/jcc.540160807

Jaguar, 1998, version 3.5

Murphy R. B., 1997, J. Chem. Phys., 106, 5073, 10.1063/1.473553

Beachy M. D., 1997, J. Am. Chem. Soc., 119, 5908, 10.1021/ja962310g

Greeley B. H., 1994, J. Chem. Phys., 101, 4028, 10.1063/1.467520

Won Y., 1991, J. Chem. Phys., 94, 8152, 10.1063/1.460097

Murphy R. B., 1995, J. Chem. Phys., 103, 1481, 10.1063/1.469769

Jorgensen W. L. BOSS, 1997, version 3.8

Jorgensen W. L., 1984, J. Am. Chem. Soc., 106, 6638, 10.1021/ja00334a030

Kim K., 1997, J. Am. Chem. Soc., 119, 12952, 10.1021/ja971836d