Đặc điểm đa dạng của vi khuẩn quang dưỡng trong các lớp vi sinh vật từ các suối nước nóng ở Bắc Cực (Greenland)

Wiley - Tập 9 Số 1 - Trang 26-38 - 2007
Guus Roeselers1, Tracy B. Norris2, Richard W. Castenholz2, Søren Rysgaard3, Ronnie N. Glud4, Michael Kühl4, Gerard Muyzer1
1Department of Biotechnology, Delft University of Technology, Julianalaan 67, NL 2628 BC Delft, The Netherlands
2Center for Ecology and Evolutionary Biology, Univ. of Oregon, Eugene, OR 97403 USA
3Greenland Institute of Natural Resources, Kivioq 2, Box 570, 3900 Nuuk, Greenland, Denmark.
4Marine Biological Laboratory, Institute of Biology, University of Copenhagen, Strandpromenaden 5, DK‐3000 Helsingør, Denmark

Tóm tắt

Tóm tắtChúng tôi đã nghiên cứu sự đa dạng kiểu gen của các vi sinh vật quang dưỡng có oxy và không có oxy trong các mẫu lớp vi sinh vật thu thập từ ba địa điểm suối nước nóng ở bờ đông Greenland. Những suối nước nóng này chứa các hệ sinh thái vi sinh vật Bắc Cực độc đáo chưa từng được nghiên cứu chi tiết trước đây. Các mồi oligonucleotide đặc hiệu cho vi khuẩn lam, vi khuẩn lưu huỳnh tím, vi khuẩn lưu huỳnh xanh và các vi khuẩn xanh không lưu huỳnh giống Choroflexus/Roseiflexus đã được sử dụng để khuếch đại chọn lọc các đoạn gen 16S rRNA. Sản phẩm khuếch đại được tách biệt bằng điện di gel độ dốc phân hủy (DGGE) và được giải mã trình tự. Ngoài ra, một số vi khuẩn lam đã được tách ra từ các mẫu lớp và phân loại bằng phương pháp hình thái học và dựa trên 16S rRNA. Các trình tự 16S rRNA vi khuẩn lam thu được từ DGGE đại diện cho một tập hợp đa dạng, đa nguồn gốc của vi khuẩn lam. Các cộng đồng lớp vi sinh vật chủ yếu được chi phối bởi vi khuẩn lam sợi có heterocyst và không có heterocyst. Kết quả của chúng tôi cho thấy thành phần cộng đồng vi khuẩn lam trong các mẫu này là khác nhau cho từng địa điểm lấy mẫu. Các lớp khác nhau của cùng một lớp vi sinh vật không đồng nhất thường chứa các cộng đồng vi khuẩn lam riêng biệt và khác nhau. Chúng tôi nhận thấy có mối quan hệ giữa thành phần cộng đồng vi khuẩn lam và nhiệt độ in situ của các phần khác nhau của lớp. Các lớp vi sinh vật Greenland thể hiện sự đa dạng thấp của vi sinh vật quang dưỡng không oxy so với các lớp vi sinh vật từ các suối nước nóng khác, điều này có thể liên quan đến điều kiện quang hóa học trong các lớp vi sinh vật do chế độ ánh sáng Bắc Cực gây ra.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1016/S0022-2836(05)80360-2

10.1128/mr.59.1.143-169.1995

10.1111/j.1529-8817.1969.tb02626.x

Castenholz R.W., 1988, Methods in Enzymology, 68

Castenholz R.W., 1996, Endemism and biodiversity of thermophilic cyanobacteria, Nova Hedwigia, 112, 33

Castenholz R.W., 2001, Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 474

Cockell C.S., 1997, Photosynthetic rhythmicity in an antarctic microbial mat and some considerations on polar circadian rhythms, Antarct J US, 32, 156

10.1111/j.1751-1097.1999.tb03274.x

Dubinina G.A., 1975, New filamentous photosynthesizing green bacteria with gas vacuoles, Mikrobiologiia, 44, 511

10.1128/AEM.69.9.5609-5621.2003

10.1128/AEM.62.3.1045-1050.1996

10.1023/A:1008327815105

10.1016/0025-3227(93)90146-M

10.1007/BF00492909

Gordon D.A., 2000, Origin and phylogeny of microbes living in permanent antarctic lake ice, Microb Ecol, 39, 197

Halliday G., 1974, Studies on the flora of the North Blosseville Kyst and on the hot springs of Greenland, Meddel Grønland, 199, 1

10.1099/00207713-45-4-676

Hanada S., 2002, Roseiflexus castenholzii gen. nov., sp. nov., a thermophilic, filamentous, photosynthetic bacterium that lacks chlorosomes, Int J Syst Bacteriol, 52, 187, 10.1099/00207713-52-1-187

Heide‐Jørgensen H.S., 1998, Puilassoq, the warmest homothermal spring of Disco Island, Ber Polarforschung, 330, 32

10.1099/00207713-48-4-1129

Kühl M., 2004, Zackenberg Ecological Research Operations, 9th Annual Report, 72

10.1890/06-0219

10.1016/j.femsec.2004.11.021

10.1128/AEM.71.7.3978-3986.2005

10.1128/AEM.60.5.1572-1580.1994

Nordenskjold O., 1907, On the geology and physical geography of East Greenland, Meddelelser orn Grønland, 28, 151

10.1128/AEM.63.8.3327-3332.1997

10.1128/AEM.67.9.4365-4371.2001

10.1128/AEM.68.9.4593-4603.2002

10.1007/s002030050744

10.1046/j.1462-2920.2003.00460.x

10.1126/science.280.5372.2095

Quesada A., 1997, Strategies of adaptation by Antarctic cyanobacteria to ultraviolet radiation, Eur J Phycol, 32, 335, 10.1080/09670269710001737269

10.1016/S0580-9517(01)30057-0

10.1128/AEM.66.7.2835-2841.2000

10.1016/j.femsre.2004.10.005

10.2307/1935310

10.1111/j.1469-8137.1995.tb03051.x

Stal L.J., 2000, The Ecology of Cyanobacteria. Their Diversity in Time and Space., 61

10.1007/978-3-642-78991-5

10.1073/pnas.0507513103

Strickland J.D.H., 1972, A Practical Handbook of Seawater Analysis

10.1128/AEM.69.9.5157-5169.2003

10.1017/S0954102000000420

10.1128/MMBR.62.4.1353-1370.1998

Thông tin
Thông tin xuất bản

Wiley

Tập 9 Số 1

26-38

Thông tin tác giả