DNA molecular markers in plant breeding: current status and recent advancements in genomic selection and genome editing

10.1146/annurev.ecolsys.34.030102.151717

10.1007/978-94-009-1840-5_5

Kebriyaee D, 2012, Not Sci Biol, 4, 116, 10.15835/nsb427501

10.1007/s10681-005-1681-5

10.5772/52583

10.1071/AR01067

10.1017/S1479262113000208

Bayley DC, 1983, Isozymes in plant genetics and breeding, 425, 10.1016/B978-0-444-42226-2.50029-3

10.1093/aob/mci055

10.3390/d1010019

Semagn K, 2006, Afr J Biotechnol, 25

Madhumati B, 2014, Int J Pure App Biosci, 2, 169

10.1101/SQB.1986.051.01.032

10.7439/ijbr.v2i1.83

He Q, 1994, Biotechniques, 17, 82

10.1101/gr.3.3.S30

10.1093/nar/18.22.6531

10.1093/nar/18.24.7213

10.1023/A:1009612517139

10.1007/BF00211058

10.1093/nar/23.21.4407

Lynch M, 1998, Genetics and analysis of quantitative traits

10.1016/S1360-1385(98)01363-6

10.1038/sj.jim.2900537

Litt M, 1989, Am J Hum Genet, 44, 397

10.1093/nar/17.16.6463

10.1038/354063a0

10.1016/0888-7543(92)90285-Z

10.1016/0888-7543(90)90195-Z

10.1016/S0169-5347(00)02097-8

10.1093/bioinformatics/btl547

10.1038/ng822

10.1046/j.0962-1083.2001.01418.x

10.1007/s10681-010-0286-9

Röder MS, 1998, Genetics, 149, 2007, 10.1093/genetics/149.4.2007

10.1111/j.1365-294X.2005.02504.x

10.1111/j.1755-0998.2008.02319.x

10.1371/journal.pone.0025836

10.1046/j.1365-294X.2003.01773.x

10.1093/nar/22.15.3257

Salazar JA, 2014, Agric Sci, 5, 430

10.1007/s001220100570

10.1016/j.scienta.2009.02.018

10.1006/geno.1994.1151

Gupta M, 1994, Theor Appl Genet, 89, 998, 10.1007/BF00224530

10.1007/s001220050577

10.1023/A:1018379805873

10.1007/BF00222949

Ng WL, 2015, ASM Sci J, 9, 30

10.1023/B:RUGE.0000016988.08342.c0

10.1007/s10709-005-7002-z

10.1016/0168-9525(89)90039-5

Grzebelus D, 2006, J Fruit Ornam Plant Res, 14, 21

10.1146/annurev.genet.33.1.479

10.1534/genetics.166.3.1437

10.1101/gr.10.7.908

10.1007/BF02257271

10.1128/9781555817954.ch26

10.1007/s13258-014-0252-3

10.1002/9781118500156.ch2

10.1038/hdy.2010.93

10.1007/s001220051124

10.1186/1746-4811-9-6

10.1038/nprot.2006.377

10.1007/s11295-013-0677-x

10.1046/j.1365-313x.1998.00334.x

10.1007/s00299-008-0507-z

10.1038/nprot.2006.408

10.1007/s00122-010-1398-2

10.1016/j.bse.2015.06.017

10.1016/0198-8859(90)90108-2

10.1007/BF00023565

10.1046/j.1365-313X.1998.00123.x

10.1021/jf061164n

10.2135/cropsci2003.1814

10.1007/BF00215038

10.1186/2193-1801-2-501

Bhagyawant SS, 2016, J Biosci Med, 4, 1

10.1016/j.fitote.2010.08.002

10.1017/S0033583502003797

10.1038/nrg3012

10.1016/j.ygeno.2015.11.003

10.1016/0022-2836(75)90213-2

Englund PT, 1971, J Biol Chem, 246, 3269, 10.1016/S0021-9258(18)62223-9

10.1016/0022-2836(72)90474-3

10.1073/pnas.74.12.5463

10.1016/0003-2697(88)90041-3

10.1101/gr.11.1.3

10.1002/elps.200500834

10.1006/abio.1996.0432

10.1126/science.281.5375.363

10.1038/nbt1486

10.1038/nature07517

10.1093/bfgp/elr045

10.1038/nature10242

10.3390/biology1030460

10.1038/nrg2626

10.1371/journal.pone.0019379

10.1146/annurev.genom.9.081307.164359

10.3835/plantgenome2012.05.0005

10.1534/genetics.112.147710

10.1079/9781845933920.0000

10.1016/j.forsciint.2004.10.020

10.1093/nar/29.4.e25

10.1073/pnas.0401076101

Huttner E, 2005, Discovery to delivery: BioVision Alexandria 2004; Proceedings of the 2004 Conference of the World Biological Forum, 145

10.1126/science.3576198

10.1007/s11434-010-0154-y

10.1007/s11434-011-4534-8

10.1007/s00606-014-1102-0

10.1016/j.bse.2017.02.008

10.1371/journal.pone.0035071

10.3906/tar-1607-30

10.1006/mgme.2000.3015

10.2135/cropsci1995.0011183X003500010019x

10.2135/cropsci2003.7970

10.1007/s00122-004-1858-7

10.1186/2193-1801-2-439

10.1007/s00122-013-2227-1

10.1038/srep40139

10.1186/s12864-017-3526-8

10.1007/978-94-017-1293-4_1

10.1007/978-94-017-1860-8_2

Künzel G, 2000, Genetics, 154, 397, 10.1093/genetics/154.1.397

10.1007/s10681-007-9356-z

10.2135/cropsci2014.09.0633

10.1007/s11240-005-9017-7

10.2135/cropsci2012.07.0451

Wu J, 2015, Plant Physiol, 169, 2700

Nawaz MA, 2016, Turk J Agri Food Sci Tech, 4, 700

Nawaz MA, 2013, Int J Agric Biol, 15, 362

10.1016/j.bse.2017.02.002

10.1016/j.jplph.2017.04.009

10.1371/journal.pone.0145990

10.1016/j.bse.2015.09.006

Tiwari JK, 2013, Afr J Biotechnol, 12, 1025

10.4238/2015.December.16.11

10.1371/journal.pone.0167821

10.1111/j.1469-185X.1993.tb01243.x

10.1038/sj.cr.7290332

10.2135/cropsci2011.04.0232

Angaji SA, 2009, Int J Appl Res Nat Prod, 2, 1

Paterson AH, 1996, Genome mapping in plants, 23

10.1023/A:1009651919792

Dhingani RM, 2015, Ann Plant Sci, 4, 1072

10.1371/journal.pone.0143890

10.1126/science.1536004

10.1146/annurev.ge.27.120193.001225

Lander ES, 1989, Genetics, 121, 185, 10.1093/genetics/121.1.185

10.1007/978-1-61779-785-9_6

10.1093/bioinformatics/btg112

10.1093/bioinformatics/btm494

Utz HF, 1996, J Quant Trait Loci, 2, 1

10.1023/A:1009604312050

10.1093/jhered/93.1.77

10.1007/s00122-003-1280-6

Haley CS, 1997, Genome mapping: a practical approach, 49, 10.1093/oso/9780199636310.003.0003

10.1023/A:1014896712447

10.1071/AR01031

10.1104/pp.123.3.795

10.1016/j.tplants.2005.04.008

10.3732/apps.1400092

Ochman H, 1988, Genetics, 120, 621, 10.1093/genetics/120.3.621

10.1101/gr.1.1.39

10.1016/j.jbiotec.2004.03.008

Young ND, 1992, Theor Appl Genet., 84, 839, 10.1007/BF00227394

10.1016/j.tplants.2006.03.006

10.1016/j.tplants.2004.05.006

10.1007/s10681-005-0892-0

Jannink JL, 2002, Quantitative genetics, genomics and plant breeding, 59, 10.1079/9780851996011.0059

Zhang P, 2016, Front Plant Sci, 7, 1202

10.3389/fpls.2016.01415

10.1007/s11032-005-1119-8

10.1016/j.pbi.2007.01.003

10.1007/s11103-005-0257-z

10.1016/S0960-9822(01)00348-7

10.1016/j.tplants.2006.12.001

10.1155/2008/574927

10.1093/bioinformatics/16.2.182

10.1093/bioinformatics/btm308

10.1007/978-3-319-27090-6_2

10.1038/nrg796

10.1146/annurev.genet.35.102401.090633

10.1385/1-59259-413-1:123

10.3389/fpls.2015.00832

10.1038/nature08800

Zargar SM, 2015, JCSB, 18, 293

10.1073/pnas.0903103106

10.1007/s00439-013-1377-1

10.1534/genetics.107.074245

10.1126/science.1174320

10.1016/j.pbi.2008.01.002

Darvasi A, 1995, Genetics, 141, 1199, 10.1093/genetics/141.3.1199

10.1186/1939-8433-6-11

10.1007/s11240-005-2387-z

Holland JB, 2004, New directions for a diverse planet; Proceedings of the 4th International Crop Science Congress; 2004 Sep 26–Oct 1

Charcosset A, 1997, Genetics, 147, 1469, 10.1093/genetics/147.3.1469

10.1098/rstb.2005.1670

10.1098/rstb.2007.2170

10.2135/cropsci2005.05-0088

Eathington SR, 2007, Crop Sci, 47, S154, 10.2135/cropsci2007.04.0015IPBS

10.1007/s11032-012-9742-7

10.1007/s11032-009-9359-7

Ye G, 2008, Int J Plant Breed, 2, 1, 10.3923/ijpbg.2008.1.8

10.1016/j.tplants.2003.09.010

10.1007/s11103-004-4681-2

10.1007/s00122-012-1829-3

10.1007/s10681-006-9184-6

10.1556/CRC.39.2011.3.5

10.1007/s00438-016-1180-5

10.1016/j.gene.2012.07.054

10.1104/pp.123.2.439

10.1007/s13353-011-0061-1

10.1111/j.1365-313X.2006.02670.x

10.4172/2329-9029.1000e116

10.1093/emboj/cdg546

Braae A, Thompson CE, Morgan K. Comparison of custom designed KASP and TaqMan genotyping assays for a rare genetic variant identified through resequencing GWAS loci. Available from: www.lgcgroup.com

Kumpatla SP, 2012, Genomics-assisted plant breeding in the 21st century: technological advances and progress

10.1007/s00122-016-2743-x

Meuwissen TH, 2001, Genetics, 157, 1819, 10.1093/genetics/157.4.1819

10.1007/978-1-4939-0446-4_10

10.1111/j.1439-0388.2007.00702.x

10.1111/j.1469-8137.2010.03593.x

Lorenz AJ, 2011, Advances in agronomy, 77

10.1016/j.tplants.2011.09.005

10.1126/science.325_380

10.1016/j.pbi.2013.01.001

10.1016/j.fcr.2010.12.017

10.1038/hdy.2015.113

10.1038/cr.2013.114

10.1038/nbt.2647

10.1016/j.tplants.2014.02.014

10.1016/j.cell.2013.02.022

10.7554/eLife.00471

10.1038/nrmicro2577

10.1038/nbt.2650

10.1080/15592324.2015.1044191

10.1104/pp.15.00793

10.1016/j.molp.2015.04.007

10.1038/nature09523

10.4161/rna.24203

10.1038/nrg2749

10.2135/cropsci2007.04.0191

10.3906/tar-1508-27

10.1016/j.bse.2014.12.002

10.1111/pbr.12296