Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
So sánh phương pháp phân loại huyết thanh, ribotype và điện di gel trường xung cho việc phân biệt các chủng Streptococcus nhóm A được phân lập tại Albania
Tóm tắt
Phương pháp phân loại huyết thanh thông thường cho các kháng nguyên T, phân tích độ dài đoạn giới hạn gen rRNA (ribotyping) và điện di gel trường xung đã được so sánh để phân biệt giữa các Streptococcus nhóm A được phân lập tại Albania trong giai đoạn 1980–1982 và năm 1995. Tổng cộng có mười hai huyết thanh chủng được xác định từ bảy mươi chủng GAS. Ribotyping đã phát hiện tám và mười một mẫu riêng biệt sau khi tiêu hóa bằng HindIII và PvuII tương ứng. Hai mươi ba chủng thuộc huyết thanh T12 được phân chia thành 10 ribotype và 11 chủng thuộc huyết thanh T2 được phân biệt thành 5 ribotype. So với đó, PFGE tạo ra 37 mẫu sau khi tiêu hóa bằng SmaI. Chỉ số phân biệt, sử dụng công thức Hunter-Gaston, đã được áp dụng để đánh giá giá trị của những phương pháp này trong việc diễn giải dữ liệu dịch tễ học. Đối với phân loại huyết thanh, giá trị của chỉ số là 0.85. Hệ thống ribotyping cho thấy ID là 0.83 khi kết hợp công nghệ HindIII và PvuII. Chỉ số này đạt 0.97 cho PFGE. Các phương pháp được sử dụng là hữu ích trong việc phân nhóm các chủng GAS.
Từ khóa
#serotyping #ribotyping #pulsed-field gel electrophoresis #group A Streptococcus #epidemiological dataTài liệu tham khảo
Lancefield RC. A serological differentiation of human and other groups of hemolytic streptococci. J Exp Med 1933; 59: 571–591.
Sepala HJ, Vuopio-Varkila M, Osterblad M, et al. Evaluation of methods for epidemiologic typing of group A streptococci. J Infect Dis 1994; 169: 519–525.
Bingen E, Denamur E, Lambert-Zechovsky N, et al. DNA restriction fragment length polymorphism differentiates recurrence from relapse in treatment failures of Streptococcus pyogenes pharingitis. J Med Microbiol 1992; 31: 71–77.
Martin DR, Single LA. Molecular epidemiology of group A Streptococcus Mtype 1 infections. J Infect Dis 1993; 167: 1112–1117.
Cleary PP, Kaplan EL, Handley JP, et al. Clonal basis for resurgence of serious Streptococcus pyogenes disease in the 1980s. Lancet 1992; 339: 518–521.
Bruneau S, de Montclos H, Drouet E, et al. rRNA gene restriction patterns of Streptococcus pyogenes epidemiological applications and relations to serotypes. J Clin Microbiol 1994; 32: 2953–2958.
Musser JM, Hauser AR, Kim MH, et al. Streptococcus pyogenes causing toxic-shock-like syndrome and other invasive diseases: Clonal diversity and pyrogenic exo-toxin expression. Proc Natl Acad Sci USA 1991; 88: 2668–2672.
Musser JM, Gray BM, Schlievert PM, et al. Streptococcus pyogenes pharyngitis: Characterization of strains by multilocus enzyme genotype, M and T protein serotype, and pyrogenic exotoxin gene probing. J Clin Microbiol 1992; 30: 600–603.
Nguyen L, Levy D, Ferroni A, et al. Molecular epidemiology of Streptococcus pyogenes in an area where acute pharyngotonsillitis is endemic. J Clin Microbiol 1997; 35: 2111–2114.
Lancerfield RC. A microprecipitation technique for classifying hemolytic streptoccocci and improved methods for producing antisera. Proc Soc Exp Biol Med 1938; 38: 473–478.
Maniatis T, Fritsch EF, Sambrook J. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Springer Harbor, NY, 1982.
Regnault B, Grimont F, Grimont PAD. Universal ribotyping method using a chemically labelled oligonucleotide probe mixture. Res Microbiol 1997; 148: 649–659.
Hunter PR, Gaston MA. Numerical index of the dis-criminatory ability of typing systems: An application of Simpson's index of diversity. J Clin Microbiol 1988; 26: 2465–2466.
Mastori E. Aspekte epidemiologjike e bakteriologjike te skarlatines ne vendin tone per periudhen 1975–1984. Revista mjeksore 1986; 3: 5–11.
Tenover FC, Arbeit RD, Goering RV, et al. Interpreting chromosomal DNA restriction patterns produced by pulsed-field gel electrophoresis: Criteria for bacterial strain typing. J. Clin Microbiol 1995; 33: 2233–2239.
Arbeit RD, Arthur M, Dunn RD, et al. Resolution of recent evolutionary divergence among Escherichia coli from related lineages: the application of pulsed-field electrophoresis to molecular epidemiology. J Infect Dis 1990; 161: 230–235.
Prevost G, Joulliac B, Piemont Y. DNA fingerprinting by pulsed-field gel electrophoresis is more effective than rybotyping in distinguishing among methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates. J Clin Microbiol 1992; 30: 967–973.
Maslow JN, Brecher SM, Adams KS. Relationship between indole production and differentiation of Klebsiella species: Indole positive and negative isolates of Klebsiella determined to be clonal. J Clin Microbiol 1993; 31: 2000–2003.
Damian M, Koblavi S, Carle I, et al. Molecular characterisation of Vibrio cholerae O1 strains isolated in Romania. Res Microbiol 1998; 149: 745–755.
Shundi L, Damian M. Streptococcal erythrogenic toxin speA gene detection by polymerase chain reaction in strains isolates in Albania. Rom Arch Microbiol Immunol 1997; T 56, 3–4: 147–153.