KÍNH ĐIỆN TỬ GIẢI ĐÔI CÁC THÀNH PHẦN CỦA SPLICEOSOME

Annual Reviews - Tập 35 Số 1 - Trang 435-457 - 2006
Holger Stark1, Reinhard Lührmann1
1Max Planck Institute for Biophysical Chemistry, 37077 Göttingen, Germany

Tóm tắt

Việc cắt ghép là bước thiết yếu trong quá trình biểu hiện gen, trong đó các intron được loại bỏ khỏi pre-mRNA để tạo ra mRNA trưởng thành có thể được ribosome dịch mã. Phản ứng này được xúc tác bởi một phức hợp RNP đại phân tử lớn và động được gọi là spliceosome. Spliceosome được hình thành qua sự kết hợp theo từng bước của năm snRNP bao gồm snRNA U1, U2, U4, U5 và U6 cùng với hơn 150 protein gắn kết tuần tự với pre-mRNA. Để nghiên cứu cấu trúc của cỗ máy RNP đặc biệt động này, trải qua nhiều thay đổi về thành phần và hình dạng, kính hiển vi điện tử đông lạnh (cryo-EM) hiện nay là phương pháp ưu tiên. Trong bài viết đánh giá này, chúng tôi trình bày kết quả từ các nghiên cứu cryo-EM cùng với một số quan điểm mới về cấu trúc và chức năng của quá trình cắt ghép, đồng thời chỉ ra những triển vọng và giới hạn của kỹ thuật cryo-EM trong việc thu thập thông tin cấu trúc về các phức hợp đại phân tử, chẳng hạn như spliceosome, tham gia vào quá trình cắt ghép.

Từ khóa

#spliceosome #cryo-electron microscopy #snRNP #gene expression #introns #mRNA

Tài liệu tham khảo

10.1016/S0968-4328(97)00068-1

10.1038/308032a0

10.1006/jmbi.1996.0171

10.1016/j.molcel.2004.07.022

10.1038/nsmb761

10.1016/S0014-5793(99)01475-1

10.1016/S0076-6879(97)77021-6

Burge C, Tuschl T, Sharp PA. 1999. Splicing of Precursors to mRNA by the Spliceosomes. Cold Spring Harbor, NY: Cold Spring Harbor Press. 525pp.

10.1006/jmbi.2002.5438

10.1101/gad.8.16.1974

10.1038/20367

10.1016/j.molcel.2005.03.021

10.1002/j.1460-2075.1993.tb05775.x

10.1126/science.8146658

10.1006/jsbi.1996.0030

10.1016/0022-2836(82)90282-0

10.1038/376441a0

10.1101/gad.13.7.851

10.1126/science.1084155

10.1016/j.molcel.2005.02.016

10.1101/gad.10.2.233

10.1016/S0168-9525(00)02176-4

10.1006/jmbi.1998.1668

10.1016/S0092-8674(00)80963-0

Harauz G, 1986, Optik, 73, 146

10.1073/pnas.262483899

10.1017/S003358350000305X

10.1016/j.sbi.2005.08.004

10.1017/S1355838202021088

10.1016/S1097-2765(03)00270-3

10.1038/nsmb728

10.1016/S0959-440X(99)80032-3

10.1016/S0092-8674(00)80550-4

10.1083/jcb.145.7.1355

10.1093/nar/18.13.3803

10.1006/jsbi.1999.4174

10.1101/gad.8.24.3008

10.1126/science.1077783

10.1038/sj.emboj.7600241

10.1016/S1097-2765(01)00167-8

10.1146/annurev.bi.64.070195.002251

10.1016/S1047-8477(03)00069-8

Moore MJ, 1993, The RNA World, 303

10.1006/jmbi.1998.2078

10.1016/j.jmb.2004.04.078

10.1038/348515a0

10.1002/j.1460-2075.1994.tb06729.x

10.1038/1700

10.1016/0092-8674(94)90563-0

10.1006/jmbi.1997.1182

10.1038/nrm1259

10.1016/0304-3991(92)90233-A

10.1016/0304-3991(94)90038-8

10.1364/JOSAA.21.000499

10.1016/j.jsb.2003.09.030

10.1038/29234

10.1002/j.1460-2075.1996.tb00481.x

10.1002/jemt.1060090405

10.1016/S1047-8477(02)00541-5

10.1101/gr.473902

10.1074/jbc.275.11.7439

10.1016/S0022-2836(03)00684-3

10.1006/jmbi.1999.3258

10.1016/j.jsb.2003.11.007

10.1093/nar/18.24.7373

10.1016/S1047-8477(03)00072-8

10.1016/j.jsb.2005.04.004

10.1038/35059098

10.1016/0968-4328(96)00018-2

10.1006/jsbi.1998.4014

10.1038/sj.emboj.7600102

10.1073/pnas.83.18.6721

10.1128/MCB.14.5.2994

10.1016/S0092-8674(00)80925-3

10.1038/35054102

10.1016/S0969-2126(01)00216-7

Stark H, 2002, Nat. Struct. Biol., 9, 849

10.1016/S0092-8674(00)81057-0

10.1074/jbc.M207685200

10.1093/emboj/20.9.2293

10.1093/emboj/20.1.187

10.1016/0304-3991(84)90066-4

10.1016/0304-3991(87)90010-6

10.1016/0304-3991(81)90059-0

10.1017/S0033583500003644

10.1006/jsbi.1996.0004

10.1002/j.1460-2075.1985.tb03944.x

10.1016/S0092-8674(00)80774-6

10.1016/S1097-2765(00)00131-3

10.1016/j.jsb.2003.11.026

10.1017/S135583829898030X

10.1101/gad.12.10.1409

10.1016/S0955-0674(97)80003-8

Will CL, Luhrmann R. 2005. Richness of RNA roles in modern RNA world. InRNA World, ed.RF Gesteland, TR Cech, JF Atkins, pp.369–400. Cold Spring Harbor, NY: Cold Spring Harbor Press. 3rd ed.

10.1515/BC.2005.084

10.1002/9783527619504.ch42

10.1093/emboj/20.16.4536

10.1093/emboj/cdf480

10.1038/nature01031

10.1006/jsbi.1996.0033

10.1073/pnas.0508048103