Phân tích sự biến đổi trình tự của gen Avirulence Avr-Pita1 trong các chủng nấm gây bệnh đảo lúa, Magnaporthe oryzae tại Việt Nam

Bệnh đạo ôn lúa gây ra bởi một loại nấm sợi (Magnaporthe oryzae) là một trong những bệnh gây hại nghiêm trọng nhất đối với cây lương thực toàn cầu. Sự tương tác giữa cây lúa, Oryza sativa và nấm gây bệnh đạo ôn M. oryzae được kích hoạt bởi sự tương tác giữa các sản phẩm protein từ các gen kháng của cây lúa và các gen tính không virulent của nấm. Các gen kháng có khả năng bảo vệ cây lúa khỏi sự nhiễm trùng của nấm gây bệnh đạo ôn. Tuy nhiên, các gen kháng thường bị phá vỡ sau vài năm do sự tiến hóa của các chủng nấm mới. Do đó, việc tìm kiếm các mẫu bệnh đạo ôn chứa gen không virulent Avr-Pita1 và phân tích sự biến đổi trình tự gen này là cần thiết cho các nghiên cứu tiếp theo nhằm giảm thiểu sự nhiễm bệnh đạo ôn ở lúa. Gen không virulent Avr-Pita1 của 25 mẫu bệnh đạo ôn đã được thu thập từ miền Bắc, miền Trung và miền Nam Việt Nam được khuếch đại và phân tích. Các cây phát sinh loài được xây dựng bằng cách sử dụng các phương pháp neighbor-joining và maximum likelihood trong chương trình MEGA 6.0. Kết quả cho thấy 18 mẫu bệnh đạo ôn có gen Avr-Pita1 và hầu hết trong số đó đến từ miền Trung và miền Nam Việt Nam. Kết quả phân tích phát sinh loài và phân tích đa hình cũng cho thấy sự đa dạng của trình tự nucleotid của gen Avr-Pita1 giữa 18 mẫu bệnh đạo ôn và sự khác biệt giữa Avr-Pita1 của các mẫu Việt Nam và những mẫu từ các nước khác.