Phân tích gen sigE của Streptomyces coelicolor tiết lộ sự tồn tại của một phân họ các yếu tố sigma polymerase RNA của vi khuẩn eubacterial liên quan đến điều hòa các chức năng ngoại tế bào.

Sigma E, một yếu tố sigma polymerase RNA có trọng lượng phân tử 28,000, đã được xác định trước đó nhờ khả năng điều hướng phiên mã từ promoter P2 của gen agarose (dagA) của Streptomyces coelicolor. Một mồi oligonucleotide thoái hóa, được thiết kế từ chuỗi N-đầu của sigma E tinh khiết, đã được sử dụng để phân lập gen sigma E (sigE). Chuỗi dự đoán của sigma E cho thấy sự tương đồng lớn nhất với chuỗi của bảy protein khác: CarQ của Myxococcus xanthus, AlgU của Pseudomonas aeruginosa, HrpL của Pseudomonas syringae, sigma E của Escherichia coli, CnrH của Alcaligenes eutrophus, FecI của E. coli, và SigX của Bacillus subtilis, là một protein chưa được xác định chức năng. Tám protein này xác định một phân họ của các yếu tố polymerase RNA của vi khuẩn eubacterial đủ khác biệt so với các sigma khác mà, trong nhiều trường hợp, chúng không được xác định bởi các phương pháp tìm kiếm bằng tương đồng tiêu chuẩn. Thông tin hiện có cho thấy tất cả chúng đều điều hòa các chức năng ngoại tế bào và hoạt động như các phân tử tác động đáp ứng với các kích thích ngoại tế bào. CnrH của A. eutrophus dường như là một yếu tố mã hóa trên plasmid.