Architecture là gì? Các công bố khoa học về Architecture

1. Vỏ não hình sọ đã được nghiên cứu trên khỉ macaque và khỉ nhện trong tình trạng gây mê nhẹ bằng cách ghi lại từ các đơn vị tế bào ngoại bào và kích thích võng mạc bằng các điểm hoặc mẫu ánh sáng. Phần lớn các tế bào có thể được phân loại thành đơn giản, phức tạp hoặc siêu phức tạp, với các đặc tính phản ứng rất giống với những gì đã được mô tả trước đây ở mèo. Tuy nhiên, trung bình, các trường tiếp nhận nhỏ hơn, và có độ nhạy cao hơn với sự thay đổi về phương vị kích thích. Một tỷ lệ nhỏ các tế bào được mã hóa màu sắc.

2. Bằng chứng được trình bày cho ít nhất hai hệ thống cột độc lập kéo dài theo chiều dọc từ bề mặt tới chất trắng. Cột loại đầu tiên chứa các tế bào có các phương vị trường tiếp nhận chung. Chúng tương tự như các cột phương vị được mô tả ở mèo, nhưng có khả năng có diện tích mặt cắt nhỏ hơn. Trong hệ thống thứ hai, các tế bào được tụ tập thành các cột theo sự ưa thích về mắt. Các cột ưu thế mắt lớn hơn các cột phương vị, và hai tập hợp ranh giới dường như độc lập với nhau.

3. Có một xu hướng cho các tế bào được nhóm lại theo sự đối xứng của phản ứng với chuyển động; ở một số khu vực, các tế bào phản ứng tốt như nhau với hai hướng chuyển động ngược nhau của một đường, nhưng những khu vực khác chứa một hỗn hợp các tế bào ưa thích một hướng và tế bào ưa thích hướng kia.

4. Một tổ chức ngang tương ứng với lớp vỏ não cũng có thể được nhận diện. Các lớp trên (II và hai phần ba trên của III) chứa các tế bào phức tạp và siêu phức tạp, nhưng các tế bào đơn giản thì gần như không có. Các tế bào chủ yếu bị kích thích bởi cả hai mắt. Các tế bào đơn giản được tìm thấy sâu trong lớp III, và trong IV A và IV B. Trong lớp IV B, chúng chiếm một tỷ lệ lớn trong quần thể, trong khi đó các tế bào phức tạp thì rất hiếm. Trong các lớp IV A và IV B, người ta tìm thấy các đơn vị thiếu đặc tính phương vị; không rõ liệu đây có phải là thân tế bào hay sợi trục của các tế bào geniculat. Trong lớp IV, hầu hết các tế bào chỉ bị kích thích bởi một mắt; lớp này gồm một mô hình ghép với các tế bào ở một số khu vực chỉ phản ứng với một mắt, trong khi các khu vực khác phản ứng với mắt còn lại. Các lớp V và VI chủ yếu chứa các tế bào phức tạp và siêu phức tạp, bị kích thích bởi cả hai mắt.

5. Vỏ não được coi là một hệ thống được tổ chức theo chiều dọc và theo chiều ngang theo những cách hoàn toàn khác nhau. Trong hệ thống chiều dọc (trong đó các tế bào nằm dọc theo một đường thẳng đứng trong vỏ não có các đặc điểm chung) các thông số kích thích như vị trí võng mạc, phương vị đường, ưu thế mắt, và có thể là hướng chuyển động, được bản đồ hóa trong các tập hợp các mô hình chồng chéo nhưng độc lập. Hệ thống ngang phân loại các tế bào trong các lớp theo các bậc phân cấp, các bậc thấp nhất (các tế bào đơn giản bị kích thích bởi một mắt) nằm trong và gần lớp IV, các bậc cao hơn trong các lớp trên và dưới.

Các kết nối thần kinh, cung cấp nền tảng cho các mạng lưới chức năng, tồn tại dù cho chúng có đang hoạt động chức năng hay không vào bất kỳ thời điểm nào. Tuy nhiên, chưa rõ mức độ liên hệ liên tục giữa các vùng não khi não "nghỉ ngơi". Trong công trình này, chúng tôi xác định các mạng lưới kích hoạt chính bằng cách tiến hành phân tích mạng lưới kích hoạt dựa trên hình ảnh của hàng ngàn bản đồ kích hoạt riêng biệt được lấy từ cơ sở dữ liệu BrainMap của các nghiên cứu hình ảnh chức năng, liên quan đến gần 30,000 chủ thể con người. Một cách độc lập, chúng tôi tách riêng các mạng lưới đồng biến đổi chính trong não khi nghỉ ngơi, được hình ảnh hóa bằng phương pháp chụp cộng hưởng từ chức năng ở 36 chủ thể trong trạng thái nghỉ. Các tập hợp mạng lưới não chính, cùng với sự phân rã của chúng thành các mạng con, cho thấy sự tương ứng chặt chẽ giữa các phân tích độc lập về động lực não trong trạng thái nghỉ và kích hoạt. Chúng tôi kết luận rằng toàn bộ bộ sưu tập các mạng lưới chức năng mà não sử dụng khi hoạt động là "chủ động" liên tục và động lực ngay cả khi ở trạng thái "nghỉ ngơi."

Những căn chỉnh nhiều miền chính xác của 86 miền xảy ra trong các protein tín hiệu đã được xây dựng và sử dụng để cung cấp một công cụ dựa trên web (SMART: công cụ nghiên cứu kiến trúc mô-đun đơn giản) cho phép xác định nhanh chóng và chú thích các chuỗi miền tín hiệu. Đa số các protein tín hiệu có đặc điểm đa miền với một sự đa dạng đáng kể về các tổ hợp miền được biết đến. So sánh với các cơ sở dữ liệu đã thiết lập cho thấy rằng 25% bộ miền của chúng tôi không thể suy luận từ SwissProt và 41% không thể được chú thích bởi Pfam. SMART có khả năng xác định các kiến trúc mô-đun của các chuỗi đơn lẻ hoặc bộ gen; việc áp dụng cho toàn bộ bộ gen nấm men đã tiết lộ rằng ít nhất 6.7% các gen của nó chứa một hoặc nhiều miền tín hiệu, khoảng 350 gene lớn hơn so với sự chú thích trước đây. Quá trình xây dựng SMART đã dự đoán ( i ) các họ miền đồng hình mới ở những vị trí không mong đợi như các miền đồng hình 4.1 trong protein kinase kết dính điểm; ( ii ) các họ miền trước đây chưa được biết đến, bao gồm một miền đồng hình citron; ( iii ) các chức năng khả thi của các họ miền sau khi xác định các thành viên của họ bổ sung, ví dụ, vai trò liên kết ubiquitin cho các miền liên kết ubiquitin (UBA); ( iv ) vai trò tế bào cho các protein, như các miền DEATH dự đoán trong các thụ thể netrin, càng làm ngụ ý những phân tử này trong việc hướng dẫn trục thần kinh; ( v ) các miền tín hiệu trong các gen bệnh đã biết như các miền SPRY trong cả marenostrin/pyrin và Midline 1; ( vi ) các miền trong bối cảnh phát sinh loài không ngờ như các đồng hình kinase diacylglycerol trong nấm men và vi khuẩn; và ( vii ) các phân loại protein có thể bị sai, được minh họa bởi một miền dự đoán pleckstrin trong một protein của Candida albicans , trước đây được mô tả như một integrin.