Theoretical Biology and Medical Modelling

Công bố khoa học tiêu biểu

* Dữ liệu chỉ mang tính chất tham khảo

Sắp xếp:  
Modelling the effect of a dengue vaccine on reducing the evolution of resistance against antibiotic due to misuse in dengue cases
Theoretical Biology and Medical Modelling - Tập 17 - Trang 1-7 - 2020
Ana Kurauchi, Claudio Jose Struchiner, Annelies Wilder-Smith, Eduardo Massad
This paper intends to check whether and how a hypothetical dengue vaccine could contribute to issue of evolution of bacteria resistance against antibiotics by reducing the number of patients that would inappropriately being treated with antibiotics. We use a new mathematical model that combines, in a novel way, two previously published papers, one on the evolution of resistance against antibiotics and one classical Ross-Macdonald model for dengue transmission. The model is simulated numerically and reproduces a real case of evolution of resistance against antibiotics. In addition the model shows that the use of a hypothetical dengue vaccine could help to curb the evolution of resistance against an antibiotic inappropriately used in dengue patients. Both the increase in the proportion of resistant bacteria due to the misuse of antibiotics in dengue cases as a function of the fraction of treated patients and the reduction of that proportion as a function of vaccination coverage occur in a highly non-linear fashion. The use of a dengue vaccine is helpful in reducing the rate of evolution of antibiotic resistance in a scenario of misuse of the antibiotics in dengue patients.
Mathematical modelling of spatio-temporal glioma evolution
Theoretical Biology and Medical Modelling - Tập 10 - Trang 1-31 - 2013
Maria Papadogiorgaki, Panagiotis Koliou, Xenofon Kotsiakis, Michalis E Zervakis
Gliomas are the most common types of brain cancer, well known for their aggressive proliferation and the invasive behavior leading to a high mortality rate. Several mathematical models have been developed for identifying the interactions between glioma cells and tissue microenvironment, which play an important role in the mechanism of the tumor formation and progression. Building and expanding on existing approaches, this paper develops a continuous three-dimensional model of avascular glioma spatio-temporal evolution. The proposed spherical model incorporates the interactions between the populations of four different glioma cell phenotypes (proliferative, hypoxic, hypoglychemic and necrotic) and their tissue microenvironment, in order to investigate how they affect tumor growth and invasion in an isotropic and homogeneous medium. The model includes two key variables involved in the proliferation and invasion processes of cancer cells; i.e. the extracellular matrix and the matrix-degradative enzymes concentrations inside the tumor and its surroundings. Additionally, the proposed model focuses on innovative features, such as the separate and independent impact of two vital nutrients, namely oxygen and glucose, in tumor growth, leading to the formation of cell populations with different metabolic profiles. The model implementation takes under consideration the variations of particular factors, such as the local cell proliferation rate, the variable conversion rates of cells from one category to another and the nutrient-dependent thresholds of conversion. All model variables (cell densities, ingredients concentrations) are continuous and described by reaction-diffusion equations. Several simulations were performed using combinations of growth and invasion rates, for different evolution times. The model results were evaluated by medical experts and validated on experimental glioma models available in the literature, revealing high agreement between simulated and experimental results. Based on the experimental validation, as well as the evaluation by clinical experts, the proposed model may provide an essential tool for the patient-specific simulation of different tumor evolution scenarios and reliable prognosis of glioma spatio-temporal progression.
Nghiên cứu lâm sàng về ảnh hưởng của ngộ độc chì đối với khả năng trí tuệ và hành vi thần kinh của trẻ em Dịch bởi AI
Theoretical Biology and Medical Modelling - - 2013
Shuangxing Hou, Yuan Lv, Pengpeng Jin, B. Ding, Na Qin, L i Li, Xuedong Liu, Wu Z, Gang Zhao, Yanchun Deng
Tóm tắt Đặt vấn đề

Chì là một kim loại nặng và chất độc hại quan trọng đối với môi trường, đồng thời là chất độc thần kinh có thể gây hại cho nhiều chức năng của hệ thần kinh. Ngộ độc chì là một tình trạng y tế gây ra bởi nồng độ chì tăng cao trong cơ thể. Chì can thiệp vào nhiều quá trình trong cơ thể và độc hại cho nhiều cơ quan và mô, bao gồm hệ thần kinh trung ương. Nó can thiệp vào sự phát triển của hệ thần kinh và do đó đặc biệt độc hại đối với trẻ em, gây ra những tổn thương thần kinh và nhận thức có thể trở thành vĩnh viễn. Trong nghiên cứu này, chúng tôi đã điều tra mối quan hệ giữa ngộ độc chì và khả năng trí tuệ cũng như khả năng hành vi thần kinh của trẻ em.

#ngộ độc chì #hệ thần kinh #phát triển trẻ em #hành vi trẻ em #trí tuệ trẻ em
Phân biệt giữa sự tăng trưởng tuyến tính và sự tăng trưởng hàm mũ trong chu kỳ phân chia: Nghiên cứu tế bào đơn, nghiên cứu nuôi cấy tế bào và đối tượng nghiên cứu chu kỳ tế bào Dịch bởi AI
Theoretical Biology and Medical Modelling - Tập 3 Số 1 - 2006
Stephen Cooper
Tóm tắt Giới thiệu

Hai phương pháp để hiểu sự tăng trưởng trong chu kỳ tế bào là nghiên cứu tế bào đơn, trong đó sự tăng trưởng trong chu kỳ tế bào của một tế bào đơn lẻ được đo lường, và nghiên cứu nuôi cấy tế bào, trong đó sự tăng trưởng trong chu kỳ tế bào của một số lượng lớn tế bào được phân tích như một tổng thể. Mitchison đã đề xuất rằng nghiên cứu tế bào đơn, vì chúng cho thấy sự biến thiên trong các mô hình tăng trưởng tế bào, là phương pháp phù hợp hơn để hiểu sự tăng trưởng tế bào trong chu kỳ tế bào và nên được ưu tiên hơn so với các nghiên cứu nuôi cấy. Cụ thể, Mitchison lập luận rằng người ta có thể thu thập mô hình tăng trưởng tế bào bằng cách quan sát vi mô các tế bào đơn trong chu kỳ phân chia. Trái với quan điểm của Mitchison, bài viết này lập luận rằng các quy luật sinh học cơ bản của sự tăng trưởng tế bào không thể được tìm thấy trong các nghiên cứu tế bào đơn. Quy luật tăng trưởng tế bào có thể và nên được hiểu qua việc nghiên cứu các tế bào như một tổng thể.

Kết quả

Mục đích hay mục tiêu của phân tích chu kỳ tế bào được trình bày và thảo luận. Những ý tưởng này được áp dụng cho cuộc tranh cãi giữa các bên ủng hộ sự tăng trưởng tuyến tính như một mô hình tăng trưởng có thể xảy ra trong chu kỳ tế bào và những người ủng hộ sự tăng trưởng hàm mũ trong chu kỳ tế bào. Các thí nghiệm khác biệt (puls) và toàn phần (tế bào đơn) được so sánh về phương diện phân tích chu kỳ tế bào và kết luận rằng phương pháp gán nhãn xung (pulse-labeling approaches) được ưu tiên hơn so với việc quan sát vi mô sự tăng trưởng tế bào để phân biệt giữa các mô hình tăng trưởng tuyến tính và hàm mũ. Thậm chí còn rõ ràng hơn, các thí nghiệm tổng hợp được ưu tiên hơn so với nghiên cứu tế bào đơn.

Kết luận

Sự nhất quán logic của sự tăng trưởng hàm mũ – tích hợp và tính toán cho hóa sinh, sinh học tế bào, và phân tích thực nghiệm chặt chẽ – dẫn đến kết luận rằng các đề xuất về sự tăng trưởng tuyến tính là kết quả của những rối loạn thực nghiệm và hạn chế trong việc đo lường. Đề xuất rằng mô hình tăng trưởng tế bào phổ quát trong chu kỳ tế bào là hàm mũ.

Sự bao gồm của thụ thể glucocorticoid trong mô hình trục hạ đồi - tuyến yên - tuyến thượng thận cho thấy sự tồn tại hai trạng thái ổn định Dịch bởi AI
Theoretical Biology and Medical Modelling - - 2007
Shakti Gupta, Eric Aslakson, Brian M. Gurbaxani, Suzanne D. Vernon
Tóm tắt Nền tảng

Hệ thống quản lý stress chủ yếu của cơ thể là trục hạ đồi - tuyến yên - tuyến thượng thận (HPA). Trục HPA phản ứng với các thách thức về thể chất và tinh thần để duy trì sự ổn định nội môi một phần bằng cách kiểm soát mức cortisol trong cơ thể. Sự rối loạn chức năng của trục HPA liên quan đến nhiều bệnh liên quan tới stress.

Kết quả

Chúng tôi đã phát triển một mô hình có cấu trúc của trục HPA bao gồm thụ thể glucocorticoid (GR). Mô hình này tích hợp động học phi tuyến tính của sự tổng hợp GR tại tuyến yên. Hiệu ứng phi tuyến tính phát sinh từ thực tế rằng GR tạo thành đồng dimer sau khi bị kích hoạt bởi cortisol và tự kích thích sự tổng hợp của nó tại tuyến yên. Sự đồng dimer hóa này cho phép tồn tại hai trạng thái ổn định (thấp và cao) và một trạng thái không ổn định của sự sản xuất cortisol dẫn đến trạng thái tồn tại hai (bistability) của trục HPA. Trong mô hình này, nồng độ GR thấp đại diện cho trạng thái ổn định bình thường, và nồng độ GR cao đại diện cho trạng thái ổn định bị rối loạn. Một cú sốc ngắn hạn trong trạng thái ổn định bình thường sẽ tạo ra một sự biến động nhỏ trong nồng độ GR mà nhanh chóng trở lại mức bình thường. Stress kéo dài và lặp đi lặp lại sẽ tạo ra nồng độ GR cao và bền vững không trở về mức nền, buộc trục HPA chuyển sang một trạng thái ổn định thay thế. Một trong những hậu quả của việc tăng nồng độ GR ổn định là mức cortisol ổn định giảm, điều này đã được quan sát thấy trong một số rối loạn liên quan đến stress như Hội chứng Mệt mỏi Mạn tính (CFS).

Kết luận

Sự bao gồm của biểu hiện GR tại tuyến yên đã dẫn đến một mô hình sinh học hợp lý về sự tồn tại hai trạng thái ổn định của trục HPA và tình trạng hypocortisolism. Nồng độ GR cao đã tăng cường phản hồi âm tính của cortisol lên hạ đồi và buộc trục HPA vào một trạng thái cortisol thấp thay thế. Mô hình này có thể được sử dụng để khám phá các cơ chế tiềm ẩn gây ra các rối loạn của trục HPA.

Các thuốc chẹn thụ thể angiotensin phổ biến có thể điều chỉnh trực tiếp hệ thống miễn dịch qua VDR, PPAR và CCR2b Dịch bởi AI
Theoretical Biology and Medical Modelling - - 2006
Trevor G Marshall, Robert E. Lee, Frances Marshall
Tóm tắt Đặt vấn đề

Có những dấu hiệu cho thấy các thuốc chẹn thụ thể angiotensin (ARBs) phổ biến có thể có tác dụng kháng viêm bằng cách điều chỉnh trực tiếp hệ thống miễn dịch. Chúng tôi quyết định sử dụng mô hình phân tử để nhanh chóng đánh giá các mục tiêu tiềm năng nào có thể biện minh cho chi phí xác thực trong phòng thí nghiệm chi tiết. Chúng tôi trước tiên nghiên cứu thụ thể hạt nhân VDR, được kích hoạt bởi hormone secosteroid 1,25-dihydroxyvitamin-D. Thụ thể này trung gian cho việc biểu hiện các chất điều chỉnh phổ biến như GnRH (hormone giải phóng gonadotrophin) và hormone cận giáp (PTH). Ngoài ra, chúng tôi còn xem xét Thụ thể kích hoạt peroxisome gamma (PPARgamma), có ảnh hưởng đến chức năng của các tế bào thực bào, và Thụ thể C-Chemokine, loại 2b (CCR2b), giúp thu hút mono bào đến vị trí thách thức miễn dịch viêm.

#ARBs #VDR #PPARgamma #CCR2b #kháng viêm #mô hình phân tử #thụ thể hạt nhân #thuốc tim mạch
Is intracellular pH a clock for mitosis?
Theoretical Biology and Medical Modelling - Tập 10 - Trang 1-6 - 2013
L John Gagliardi, Daniel H Shain
Experiments have shown that the intracellular pH of many cells rises to a maximum at the onset of mitosis, subsequently decreasing 0.3 to 0.5 pH units by the end of mitosis. This result, and observations that tubulin net charge depends strongly on pH, may be critical for microtubule (MT) dynamics during mitosis. In vivo studies demonstrate that MT dynamics is sensitive to pH, with MT growth favored by higher pH values. Therefore it seems likely that the shift from the dominance of microtubule growth during prophase, and to a lesser extent during prometaphase, to a parity between MT polymerization and depolymerization during metaphase chromosome oscillations is a consequence of gradually decreasing intracellular pH during mitosis. Thus the timing and sequencing of prophase, prometaphase, and metaphase chromosome motions may be understood as an increase in the MT disassembly to assembly probability ratio resulting from a continuously declining intracellular pH.
Optimal back-extrapolation method for estimating plasma volume in humans using the indocyanine green dilution method
Theoretical Biology and Medical Modelling - - 2014
David Polidori, Clarence W. Rowley
Estimating the subcritical transmissibility of the Zika outbreak in the State of Florida, USA, 2016
Theoretical Biology and Medical Modelling - Tập 13 - Trang 1-7 - 2016
Linh Dinh, Gerardo Chowell, Kenji Mizumoto, Hiroshi Nishiura
Florida State has reported autochthonous transmission of Zika virus since late July 2016. Here we assessed the transmissibility associated with the outbreak and generated a short-term forecast. Time-dependent dynamics of imported cases reported in the state of Florida was approximated by a logistic growth equation. We estimated the reproduction number using the renewal equation in order to predict the incidence of local cases arising from both local and imported primary cases. Using a bootstrap method together with the logistic and renewal equations, a short-term forecast of local and imported cases was carried out. The reproduction number was estimated at 0.16 (95 % Confidence Interval: 0.13, 0.19). Employing the logistic equation to capture a drastic decline in the number of imported cases expected through the course of 2016, together with the low estimate of the local reproduction number in Florida, the expected number of local reported cases was demonstrated to show an evident declining trend for the remainder of 2016. The risk of local transmission in the state of Florida is predicted to dramatically decline by the end of 2016.
Immunostimulation and Immunoinhibition of Premalignant Lesions
Theoretical Biology and Medical Modelling - Tập 4 - Trang 1-5 - 2007
Richmond T Prehn
The immune reaction may be either stimulatory or inhibitory to tumor growth, depending upon the local ratio of immune reactants to tumor cells. A tumor-stimulatory immune response may be essential for survival of a neoplasm in vivo and for the biological progression from a premalignant lesion to a malignancy. Neither a positive nor a negative correlation between the magnitude of an immune-cell infiltrate and a cancer's prognosis can reveal whether the infiltrate was stimulating or inhibiting to the tumor's growth unless the position on the nonlinear curve that relates tumor growth to the magnitude of the immune reaction is known. This hypothesis is discussed in relation to the development of human malignant melanomas and colorectal cancers.
Tổng số: 422   
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 10